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2022 年度 実施状況報告書

進化分子工学を駆使した新規高機能金属酵素の開発

研究課題

研究課題/領域番号 21K20535
研究機関大阪大学

研究代表者

加藤 俊介  大阪大学, 大学院工学研究科, 助教 (60909125)

研究期間 (年度) 2021-08-30 – 2024-03-31
キーワード人工金属酵素 / 進化分子工学 / 指向性進化法 / C-H結合官能基化 / 生体触媒 / ヘムタンパク質 / 金属ポルフィリノイド
研究実績の概要

本研究は、進化分子工学的手法を遷移金属錯体へと応用し、優れた触媒特性を発揮する新規高機能触媒を開発することを目的とする。具体的には、非天然の遷移金属錯体を補因子としてタンパク質に導入した「人工金属酵素」を構築し、指向性進化法(directed evolution)を駆使した遺伝子工学的な改変を実施する。2022年度は、鉄コロール錯体を補因子としてミオグロビンに導入した人工金属酵素を構築し、指向性進化法によるタンパク質反応場の改変を実施した。ミオグロビンのヘム結合サイトを構成する複数のアミノ酸残基を選定し、部位飽和変異導入(site-saturation mutagenesis)によりランダム化した変異体ライブラリをスクリーニングすることで、ABTSの酸化反応に対して高いペルオキシダーゼ活性を示す変異体を獲得することに成功した。この得られた変異体は、改変前の人工金属酵素と比較して、24倍高い反応初速度を示すことが判明した。加えて、鉄二核錯体やチアミン二リン酸を補因子とする人工酵素の開発にも現在着手しており、今後これらの人工金属酵素の指向性進化法による改変も実施する予定である。また、2022年度は、効率的な人工金属酵素の指向性進化を実現するために、オリゴペプチド(Strep-tag II)を精製タグに用いた新たなハイスループットスクリーニング(HTS)手法を確立した。本HTS手法は、安価なキチン粉末をクロマトグラフィー担体として用いて、人工金属酵素の指向性進化を細胞夾雑物非存在下で実現する強力な手法である。今後、このHTS手法を最大限に活用し、進化分子工学による高機能金属酵素の開発に着手する。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究は、指向性進化法(directed evolution)による人工金属酵素の遺伝子工学的な改変を実施し、優れた触媒活性を発揮する新規高機能触媒を開発することを目的とする。2022年度は、目標の一つであった非天然金属ポルフィリノイド(鉄コロール錯体)を補因子とする人工金属酵素について、指向性進化法による改変を実施し、触媒活性を向上させることに成功した。また、鉄二核錯体やチアミン二リン酸を補因子とする他の人工酵素の構築も実施しており、今後、これら人工金属酵素の指向性進化法による改変も行う予定である。加えて、2022年度は、効率的な指向性進化の実現に資する基盤技術の開発にも精力的に研究を実施した。なかでも、Strep-tag IIを精製タグに用いた新規ハイスループットスクリーニング(HTS)手法は、今後の研究展開を加速する基盤技術となることが期待される。以上の成果から、おおむね順調に進展しているとの評価を行った。

今後の研究の推進方策

今後の研究推進方策として、以下の2項目について特に重点を置き研究を遂行する。(i) 指向性進化の結果得られた上記の鉄コロール錯体を含む人工金属酵素について、詳細な解析(X線結晶構造解析・速度論解析)を実施する。そして、指向性進化法により導入されたアミノ酸残基への変異が、非天然の金属錯体の触媒活性にどのように寄与しているのかを明らかにする。(ii) 令和3年度に新しく構築した鉄二核錯体やチアミン二リン酸を補因子とする人工金属酵素について、指向性進化法による改変を実施し、優れた触媒特性を示す変異体を獲得する。この時、指向性進化法のスクリーニングには、上記のStre-tag IIを精製タグに用いた新規ハイスループットスクリーニング(HTS)手法を活用する。

次年度使用額が生じた理由

2022年度は、人工金属酵素の指向性進化において変異体ライブラリのハイスループットスクリーニングに想定より時間がかかり、計画の一部を先送りにした。これにより生化学消耗品購入経費が未使用となったが、本計画は2023年度に引き続き実施予定であるため、この未使用額は計画通り生化学消耗品の購入費に充てる。また、新型コロナウイルス感染症の感染拡大の影響により、当初参加を予定していた国内学会(日本農芸化学会2023年度大会)がオンライン開催となり、旅費やその他経費の支出額が減少した。この未使用額は2023年度以降、バイオ関連化学シンポジウム等の国内学会の対面形式での開催が見込まれるため、この経費に充てることとする。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] RWTH Aachen University(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      RWTH Aachen University
  • [雑誌論文] Evolutionary Engineering of a Cp*Rh(III) Complex-Linked Artificial Metalloenzyme with a Chimeric β-Barrel Protein Scaffold2023

    • 著者名/発表者名
      Kato Shunsuke、Onoda Akira、Schwaneberg Ulrich、Hayashi Takashi
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: in press ページ: in press

    • DOI

      10.1021/jacs.3c00581

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Engineering of hemoproteins2023

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Takashi、Kato Shunsuke
    • 雑誌名

      Comprehensive Inorganic Chemistry III

      巻: 3 ページ: 215~230

    • DOI

      10.1016/B978-0-12-823144-9.00142-4

    • 査読あり
  • [学会発表] キメラ型バレルタンパク質を基盤とするロジウム含有金属酵素の指向性進化:芳香族C-H結合官能基化反応への応用2022

    • 著者名/発表者名
      加藤俊介、小野田晃、Ulrich Schwaneberg、林高史
    • 学会等名
      第48回生体分子科学討論会
  • [学会発表] アフィニティ精製手法を活用したハイスループットスクリーニング系の構築と鉄コロール錯体を導入したミオグロビンの指向性進化への応用2022

    • 著者名/発表者名
      竹内康基、加藤俊介、林高史
    • 学会等名
      第34回生物無機化学夏季セミナー
  • [学会発表] キチン粉末を利用したアフィニティー精製手法の開発:非天然化学反応を触媒する微生物酵素の探索への応用2022

    • 著者名/発表者名
      加藤俊介、林高史
    • 学会等名
      第16回バイオ関連化学シンポジウム
  • [学会発表] Directed Evolution of an Artificial Metalloenzyme Containing an Iron Corrole Complex Using a High-throughput Screening Platform Based on an Affinity Purification System2022

    • 著者名/発表者名
      竹内康基、加藤俊介、林高史
    • 学会等名
      錯体化学会第72回討論会
  • [学会発表] Evolutionary Engineering of a Rh(III)-linked Artificial Metalloenzyme for Isoquinoline Synthesis via C(sp2)-H Bond Activation2022

    • 著者名/発表者名
      加藤俊介、小野田晃、Ulrich Schwaneberg、林高史
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
    • 国際学会
  • [学会発表] Directed Evolution of Myoglobin Reconstituted with an Iron Corrole Complex Base on a Screening Platform Based on an Affinity Purification System2022

    • 著者名/発表者名
      竹内康基、加藤俊介、林高史
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
    • 国際学会
  • [学会発表] Directed Evolution of Myoglobin Reconstituted with an Iron Corrole Complex: Development of Artificial Peroxidase with Enhanced Catalytic Activity2022

    • 著者名/発表者名
      竹内康基、加藤俊介、林高史
    • 学会等名
      第103回日本化学会春季年会
  • [学会発表] ミオグロビンを利用した人工金属酵素の開発:アルドキシム脱水反応によるニトリル合成2022

    • 著者名/発表者名
      阿部美笛、加藤俊介、林高史
    • 学会等名
      第103回日本化学会春季年会
  • [図書] 化学「2023年の化学 注目の論文」酵素で光り輝く有機合成2023

    • 著者名/発表者名
      加藤俊介
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      株式会社 化学同人
  • [備考] 指向性進化法を駆使した人工金属酵素の創製

    • URL

      http://www.cfi.eng.osaka-u.ac.jp/seeds/seeds_list_1/kato_shunsuke_assist/

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公開日: 2023-12-25  

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