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2022 年度 実績報告書

オルガノイドとゲノム解析を用いたリンパ節転移胆管癌診断治療法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 21K20850
研究機関東北大学

研究代表者

椎原 正尋  東北大学, 医学系研究科, 大学院非常勤講師 (00907701)

研究期間 (年度) 2021-08-30 – 2023-03-31
キーワード胆道癌 / リンパ節転移 / オルガノイド / 遺伝子解析 / ゲノム
研究実績の概要

本研究では胆管癌の手術切除検体のDNA解析から、胆管癌のリンパ節転移に関するドライバー遺伝子を抽出する。リンパ節転移関連ドライバー遺伝子変異が術前の血清や胆汁中でも同定可能かをliquid biopsyで検証し、術前診断ツールの開発を行う。さらにドライバー遺伝子に対する標的療法の効果を患者由来オルガノイドを用いて薬剤感受性から検証する。
東京女子医科大学消化器外科で保存していた手術症例の切除サンプルのうち2011年から2020年までの計53例(胆管癌38例、胆嚢癌13例、胆管内乳頭粘液性腫瘍(IPNB)2例)を対象とし、核酸抽出から遺伝子解析(whole exome sequence, transcriptome sequence)を外部業者に委託し、現在解析結果待ちである。
胆道癌オルガノイドの観察に関して、東北大学病態病理学分野で患者由来オルガノイドを数例培養している。ゲノム解析の結果からドライバー遺伝子変異が抽出出来れば、標的療法の効果を細胞増殖アッセイを行い検証する。

胆道癌オルガノイドと併行して、過去に報告のほとんどない膵管内乳頭粘液性腫瘍(IPMN)のオルガノイド培養法の確立と増殖形態の解明を試みた。胆道癌オルガノイド培養法に改変を加えた結果、Subtypeの異なる数種類のIPMNオルガノイド培養に成功した。共焦点顕微鏡によるタイムラプス観察では、オルガノイドが粘液を分泌する形態や分裂増殖する形態の観察に成功した。全エクソーム解析の結果から抽出したドライバー遺伝子変異の特異的阻害剤によってIPMNオルガノイドの増殖と粘液分泌が抑制された。さらに同一症例から培養したIPMCオルガノイドと膵管癌オルガノイドのtranscriptome解析の結果の比較からIPMCに高発現しているgeneXを同定した。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2022

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Application of Patient-Derived Cancer Organoids to Personalized Medicine2022

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Shiihara
    • 雑誌名

      journal of personalized medicine

      巻: 12 ページ: 789

    • DOI

      10.3390/jpm12050789

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 患者由来IPMNオルガノイドとゲノム解析を用いた増殖形態の解明2022

    • 著者名/発表者名
      椎原正尋、石川智彦、大森優子、元井冬彦、森川孝則、中川圭、林洋毅、水間正道、大塚英郎、岡村容伸、木下賢吾、海野倫明、古川徹
    • 学会等名
      第122回外科学会定期学術集会
  • [学会発表] 患者由来IPMNオルガノイドとゲノム解析を用いた増殖形態の解明の樹立とゲノム解析2022

    • 著者名/発表者名
      椎原正尋、石川智彦、大森優子、元井冬彦、森川孝則、中川圭、林洋毅、水間正道、大塚英郎、岡村容伸、木下賢吾、海野倫明、古川徹
    • 学会等名
      第108回日本消化器病学会総会
  • [学会発表] Characteristic phenotypes of growth and mucus secretion of patient-derived organoids may substantiate invasive phenotypes of intraductal papillary mucinous neoplasms of the pancreas2022

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Shiihara, Tomohiko Ishikawa, Takuya Yoshida, Yuko Omori, Katsuya Hirose, Takanori Morikawa, Kei Nakagawa, Masamichi Mizuma, Hideo Ohtsuka, Fuyuhiko Motoi, Michiaki Unno, Yasunobu Okamura, Kengo Kinoshita, and Toru Furukawa
    • 学会等名
      第26回国際膵臓学会/第53回日本膵臓学会大会

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公開日: 2023-12-25  

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