| 研究課題/領域番号 |
21KK0188
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| 研究機関 | 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 |
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研究代表者 |
玉村 雪乃 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 動物衛生研究部門, 主任研究員 (90584384)
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| 研究分担者 |
関塚 剛史 国立感染症研究所, 病原体ゲノム解析研究センター, 室長 (40462775) [辞退]
黒田 誠 国立感染症研究所, 病原体ゲノム解析研究センター, センター長 (80317411)
グルゲ キールティ・シリ 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 動物衛生研究部門, グループ長補佐 (50391446)
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| 研究期間 (年度) |
2021-10-07 – 2025-03-31
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| キーワード | 環境化学 / メタゲノム解析 |
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| 研究実績の概要 |
本課題ではスリランカを対象とし、COVID-19流行下における過剰な医薬品使用の、薬剤耐性菌、医薬品残留物、重金属による環境汚染への影響を明らかにすることを目的とする。
今年度は、COVID-19流行中である2022年にスリランカで採取した水試料からのUPLC-Qtrap MS/MS systemによる医薬品残留物検出方法の検討を行った。βラクタム系抗菌剤を含む医薬品残留物の検出法を確立し、一部の検体からシプロフロキサシン、アジスロマイシン、クラリスロマイシン等が検出され、2022年1月に採取した検体と比較して2022年12月に採取した検体では医薬品残留物濃度が低い傾向が認められた。さらに、一部の検体においてICP-MSによる重金属の検出を行い、34種類の重金属が検出された。2023年12月にCOVID-19流行後の検体として2022年と同様の地点で採材を行い、採取した検体について現在メタゲノム解析、医薬品残留物、重金属、薬剤耐性菌の検出を進めている。
また、スリランカにおける調査の比較対象として、インドにおいてもCOVID-19流行中及び流行後の病院排水、生活排水、河川水を2022年2月、2023年5月及び6月に採取した。メタゲノム解析の結果、下水処理前と比較して下水処理後の検体ではBacteriaのリード数が少なく、下水処理前はBifidobacterium等腸管由来と考えられる菌の検出割合が高い一方で、下水処理後はThauera、Bradyrhizobium等、土や淡水から分離される菌の検出割合が高く、多様性が高かった。クラスター解析により、主に2022年の検体で構成されるクラスターと2023年の検体で構成されるクラスターが形成され、COVID-19流行中及び流行後に細菌叢が変化していたことが明らかとなった。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
当初の計画通り、COVID-19流行後にスリランカ現地で採材することができた。また、今年度はスリランカとの比較対象としてインドでも採材することができた。採取した試料の解析は最終年度までに完了予定であり、おおむね順調に進展していると判断した。
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| 今後の研究の推進方策 |
2024年度は当初の予定通り、昨年度までに採取した検体のメタゲノム解析、医薬品、重金属、薬剤耐性菌の検出を完了する。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
2024年度はインド及びスリランカでの採材を予定していたが、研究代表者が体調不良によりスリランカへ渡航できなかったこと、留学生が日本に来れなかったこと等から旅費及び人件費の支出がなくなり、次年度使用額が生じた。
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