ヒト染色体動態の全体像解明に向けた染色体情報システムの構築

2014 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 22221009
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 白髭 克彦 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (90273854)
• 研究分担者: 広田 亨 公益財団法人がん研究会, その他部局等, その他 (50421368) ; 伊藤 武彦 東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授 (90501106) ; 須谷 尚史 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教 (30401524)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2015-03-31
• キーワード: ゲノム

研究実績の概要

26年度の成果は以下にまとめることができる
1. ヒト染色体動態の可視化システムとして従来のソフトをDROMPAIIにバージョンアップし、いくつかの標準化手法を取り入れた。また、新たに、マウス細胞をスパイクインすることによりより定量的にヒト染色体のChIP-seq解析を行う系の開発に着手した。
2. 染色体高次構造と転写の伸長反応をリンクさせる因子としてコヒーシンタンパクを同定した。この同期不全が原因で発症する疾患CHOPS症候群の分子病態を明らかにした。
3. 染色体凝縮因子であるコンデンシンがR-Loop構造をマスクすることで染色体分離に寄与していることを見出した。
4. 染色体高次構造に関わるタンパクのKOマウスの系統を幾つか作出し、それらの発生分化過程への寄与を明らかにするための材料を整えた。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Germline gain-of-function mutations in AFF4 cause a developmental syndrome functionally linking the super elongation complex and cohesin. (2015)
  • 著者名/発表者名: Izumi K, Nakato R, Zhang Z, Edmondson AC, Noon S, Dulik MC, Rajagopalan R, Venditti CP, Gripp K, Samanich J, Zackai EH, Deardorff MA, Clark D, Allen JL, Dorsett D, Misulovin Z, Komata M, Bando M, Kaur M, Katou Y, Shirahige K*, Krantz ID*.(Shared Corresponding Authors)
  • 雑誌名: Nat Genet. 巻: 47 ページ: 338-344
  • DOI: 10.1038/ng.3229
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The chromosomal association of the Smc5/6 complex depends on cohesion and predicts the level of sister chromatid entanglement. (2014)
  • 著者名/発表者名: Jeppsson K, Carlborg KK, Nakato R, Berta DG, Lilienthal I, Kanno T, Lindqvist A, Brink MC, Dantuma NP, Katou Y, Shirahige K, Sjogren C.
  • 雑誌名: PLoS Genet. 巻: 10 ページ: e1004680
  • DOI: 10.1371/journal.pgen
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Histone variants enriched in oocytes enhance reprogramming to induced pluripotent stem cells. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinagawa T, Takagi T, Tsukamoto D, Tomaru C, Huynh LM, Sivaraman P, Kumarevel T, Inoue K, Nakato R, Katou Y, Sado T, Takahashi S, Ogura A, Shirahige K, Ishii S.
  • 雑誌名: Cell Stem Cell. 巻: 14 ページ: 217-224
  • DOI: 10.1016/j.stem.
  • 査読あり
• [雑誌論文] The maintenance of chromosome structure: positioning and functioning of SMC complexes. (2014)
  • 著者名/発表者名: Jeppsson K, Kanno T, Shirahige K, Sjogren C.
  • 雑誌名: Nat Rev Mol Cell Biol. 巻: 15 ページ: 601-614
  • DOI: 10.1038/nrm3857.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Chromatin immunoprecipitation protocol for mammalian cells. (2014)
  • 著者名/発表者名: Komata M, Katou Y, Tanaka H, Nakato R, Shirahige K, Bando M.
  • 雑誌名: Methods Mol Biol. 巻: 1164 ページ: 33-38
  • DOI: 10.1007/978-1-4939-0805-9_4.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [備考] 肥満と低身長が特徴の新たな希少遺伝病を発見 AFF4遺伝子が発育・体重増加をコントロール
  • URL: http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/pressrelease150304.html