2012 年度実績報告書

マイクロＲＮＡおよびｓｎｏＲＮＡとその標的の網羅的予測

研究課題

研究課題/領域番号	22240031
研究機関	東京大学
研究代表者	浅井潔東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (30356357)
研究分担者	木立尚孝東京大学, 新領域創成科学研究科, 准教授 (80415778)
研究期間 (年度)	2010-04-01 – 2013-03-31
キーワード	RNA / RNA-RNA相互作用
研究概要	２次構造を考慮した配列情報解析技術を駆使し、miRNAとsnoRNA及びそれらの標的RNAをゲノム配列から正確に予測する手法を開発すること、および開発した手法によってヒトゲノムを中心に網羅的な解析を行うことを目的に研究を行った。進化的に保存したmiRNA前駆体と成熟miRNAを予測する手法を開発し、査読付き論文として発表した。RNA塩基置換による2次構造的エネルギーの変化を計算するアルゴリズムを開発し、査読付き論文として発表した。ガイド配列と相補的な塩基配列をもつ遺伝子のすべてが、必ずしも標的遺伝子となるわけではない。そこで、RNA分子内の2次構造、分子間の2次構造的な相互作用などを考慮し、標的遺伝子を効率的に絞り込むことができる情報解析手法について検討した。
現在までの達成度 (区分)	理由 25年度が最終年度であるため、記入しない。
今後の研究の推進方策	25年度が最終年度であるため、記入しない。