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2010 年度 実績報告書

世界最高レベルの瞬発系選手の全ゲノム解析による運動能力関連多型の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22240072
研究機関地方独立行政法人東京都健康長寿医療センター(東京都健康長寿医療センター研究所)

研究代表者

田中 雅嗣  地方独立行政法人東京都健康長寿医療センター(東京都健康長寿医療センター研究所), 研究部長 (60155166)

研究分担者 福 典之  地方独立行政法人東京都健康長寿医療センター(東京都健康長寿医療センター研究所), 研究員 (40392526)
キーワードゲノム全領域関連解析 / 一塩基多型 / 瞬発系運動能力 / 全エクソン塩基配列解析 / 陸上短距離走 / 核ゲノム多型 / ミトコンドリアゲノム多型 / ジャマイカ人
研究概要

世界レベルの瞬発系運動選手の全ゲノムに存在する一塩基多型(SNPs)を対象とした網羅的な関連解析を開始した。最初にジャマイカの短距離選手群48人と対照群48人のDNAをIllumina社のHuman 660W-Quad BeadChipを用いて約60万個のSNPsを解析した。660Wチップで分析可能なSNPは主としてヨーロッパ人とアジア人の多型であった。そこで、ジャマイカの短距離選手群8人と対照群8人ならびに米国の短距離選手群48人と対照群48人のDNAをOmini1 BeadChipで分析した。Omini1は約100万個のSNPsを分析できるチップであり、アフリカ人の分析にも適している。660WとOmini1によって得られたSNPsデータをソフトウエアPLINKによって統合し解析した。Call rate<95%,MAF<0.1,HWEp<5.0E-5のSNPsを選択した。タイピング不良の試料を除外し、660Wで分析した69検体とOmni1で分析した89検体を選択し、Hapmap Phase3の988人を比較対照として集団構造を分析した。10個の固有ベクターで補正した後の29万個のSNPsを用いてManhattan plotを得た。その結果、第1染色体長腕と第2染色体長腕にそれぞれ5.0E-05以下のp値を示すSNP各1個を検出したが、全ゲノム解析において有意と考えられる5.0E-08以下のp値を示すSNPは検出されなかった。このため、さらに288人のDNAをOmniExpressによって分析することにした。一方、一般集団では極めて頻度の低い多様性が世界レベルの瞬発系運動選手が有する類い稀な運動能力に関与している可能性を考慮し、全エクソン解析を開始した。

  • 研究成果

    (28件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (23件) (うち査読あり 19件) 学会発表 (4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Mitochondrial haplogroups A and M7a confer a genetic risk for coronary atherosclerosis in the Japanese elderly : An autopsy study of 1,536 patients2011

    • 著者名/発表者名
      Sawabe M., et al.
    • 雑誌名

      J Atheroscler Thromb

      巻: 18 ページ: 166-175

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial DNA analysis of Hokkaido Jomon skeletons : Remnants of archaic maternal lineages at the southwestern edge of former Beringia2011

    • 著者名/発表者名
      Adachi N., et al.
    • 雑誌名

      Am J Phys Anthropol

      巻: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of a polymorphism of BTN2A1 with dyslipidemia in East Asian populations2011

    • 著者名/発表者名
      Fujimaki T., et al.
    • 雑誌名

      Exp Ther Med

      巻: 2 ページ: 745-749

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Importance of mitochondrial haplotypes and maternal lineage in sprint performance among individuals of West African ancestry2011

    • 著者名/発表者名
      Deason M., et al.
    • 雑誌名

      Scand J Med Sci Sports

      巻: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial haplogroups associated with elite Japanese athlete status2011

    • 著者名/発表者名
      Mikami E., et al.
    • 雑誌名

      Scand J Med Sci Sports

      巻: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Beneficial effect of pyruvate therapy on Leigh syndrome due to a novel mutation in PDH E 1α gene2011

    • 著者名/発表者名
      Koga Y., et al.
    • 雑誌名

      Brain Dev

      巻: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of a polymorphism of BTN2A1 with type 2 diabetes mellitus in Japanese individuals2011

    • 著者名/発表者名
      Hiramatsu M., et al.
    • 雑誌名

      Diabetic Med

      巻: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of a polymorphism of BTN2A1 with hypertension in Japanese individuals2011

    • 著者名/発表者名
      Horibe H., et al.
    • 雑誌名

      Am J Hypertens

      巻: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of polymorphisms of BTN2A1 and ILF3 with myocardial infarction in Japanese individuals with or without hypertension, diabetes mellitus, or chronic kidney disease2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshida T., et al.
    • 雑誌名

      Int J Mol Med

      巻: 27 ページ: 745-752

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of a polymorphism of BTN2A1 with chronic kidney disease in Japanese individuals with or without hypertension or diabetes mellitus2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshida T., et al.
    • 雑誌名

      Mol Med Rep

      巻: 4 ページ: 511-518

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of a polymorphism of BTN2A 1 with chronic kidney disease in Japanese individuals with or without hypertension or diabetes mellitus2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshida T., et al.
    • 雑誌名

      Exp Ther Med

      巻: 印刷中

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of a polymorphism of BTN2A1 with myocardial infarction in East Asian populations2011

    • 著者名/発表者名
      Yamada Y., et al.
    • 雑誌名

      Atherosclerosis

      巻: 215 ページ: 145-152

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 人類の遺伝的多様性と運動能力2011

    • 著者名/発表者名
      田中雅嗣
    • 雑誌名

      体育の科学

      巻: 61 ページ: 351-356

  • [雑誌論文] ミトコンドリア病ならびにシトリン欠損症に対するピルビン酸ナトリウム療法2011

    • 著者名/発表者名
      田中雅嗣
    • 雑誌名

      日本先天性代謝異常学会雑誌

      巻: 27 印刷中

  • [雑誌論文] Metabolic analysis of 13C-labeled pyruvate for noninvasive assessment of mitochondrial function2010

    • 著者名/発表者名
      I-Chien Wu, Ikuroh Ohsawa, Noriyuki Fuku, Masashi Tanaka
    • 雑誌名

      Ann N Y Acad Sci

      巻: 1201 ページ: 111-120

  • [雑誌論文] Trehalose extends longevity in the nematode Caenorhabditis elegans2010

    • 著者名/発表者名
      Honda Y., et al.
    • 雑誌名

      Aging Cell

      巻: 9 ページ: 145-152

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial haplogroups associated with lifestyle-related diseases and longevity in the Japanese population2010

    • 著者名/発表者名
      Nishigaki Y., et al.
    • 雑誌名

      Geriatr Gerontol Int

      巻: 10 Suppl 1 ページ: S59-S69

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Redox regulation, gene expression and longevity2010

    • 著者名/発表者名
      Honda Y., et al.
    • 雑誌名

      Geriatr Gerontol Int

      巻: 10 Suppl 1 ページ: S59-S69

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Extensive screening system using suspension array technology to detect mitochondrial DNA point mutations2010

    • 著者名/発表者名
      Komaki H., et al.
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta

      巻: 1800 ページ: 313-315

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Extensive screening system using suspension array technology to detect mitochondrial DNA point mutations2010

    • 著者名/発表者名
      Nishigaki Y., et al.
    • 雑誌名

      Mitochondrion

      巻: 10 ページ: 300-308

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Extensive and rapid screening for major mitochondrial DNA point mutations in patients with hereditary hearing loss2010

    • 著者名/発表者名
      Kato T., et al.
    • 雑誌名

      J Hum Genet

      巻: 55 ページ: 300-308

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Loss of mutant mitochondrial DNA harboring the MELAS A3243G mutation in human cybrid cells after cell-cell fusion with normal tissue-derived fibroblast cells2010

    • 著者名/発表者名
      Yano T., et al.
    • 雑誌名

      Int J Mol Med

      巻: 25 ページ: 153-158

    • 査読あり
  • [雑誌論文] ミトコンドリアゲノム多型と健康・長寿2010

    • 著者名/発表者名
      福典之・田中雅嗣
    • 雑誌名

      公衆衛生

      巻: 9 ページ: 754-760

  • [学会発表] Mitochondrial DNA in human longevity and in age-associated diseases2010

    • 著者名/発表者名
      Tanaka M.
    • 学会等名
      The 6th Conference of Asian Society of Mitochondrial Research and Medicine
    • 発表場所
      Fukuoka
    • 年月日
      2010-12-17
  • [学会発表] ピルビン酸療法2010

    • 著者名/発表者名
      田中雅嗣
    • 学会等名
      第52回日本先天性代謝異常学会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-10-22
  • [学会発表] Mitopenia contributes to sarcopenia, osteopenia, diabetes, and metabolic syndrome : Practical approaches to verify this hypothesis2010

    • 著者名/発表者名
      Tanaka M.
    • 学会等名
      The 12th Asian-Pacific Conference of Clinical Biochemistry
    • 発表場所
      Seoul
    • 年月日
      2010-10-04
  • [学会発表] ミトコンドリアと光感受性2010

    • 著者名/発表者名
      田中雅嗣
    • 学会等名
      第32回日本光医学・光生物学会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-07-31
  • [備考]

    • URL

      http://mtsnp.tmig.or.jp/mtsnp/index.shtml

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公開日: 2012-07-19  

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