微生物におけるC1化合物代謝制御の分子基盤に立脚した環境技術開発

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22310046
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 環境技術・環境材料
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 由里本 博也 京都大学, 大学院・農学研究科, 准教授 (00283648)
• 研究分担者: 阪井 康能 京都大学, 大学院・農学研究科, 教授 (60202082) ; 奥 公秀 京都大学, 大学院・農学研究科, 助教 (10511230)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: メタン / メタノール / ホルムアルデヒド / C1微生物 / メタン資化性細菌 / メタノール資化性酵母 / メタノール資化性細菌 / 代謝制御

研究概要

メタンやメタノール、ホルムアルデヒドなどのC1化合物を利用する微生物のC1化合物代謝制御の分子基盤に立脚した環境技術開発を目的とする研究を行った。ホルムアルデヒド固定を触媒するHps-Phi融合酵素をメタン資化性細菌、メタノール資化性細菌、植物で発現に成功した。また、メタノール資化性酵母のホルムアルデヒド応答性遺伝子発現に関わる因子を取得し、その機能を解明した。

研究成果

• [雑誌論文] Expression level of methanol-inducible peroxisomal proteins and peroxisome morphology are affected by oxygen conditions and mitochondrial respiratory pathway function in the methylotrophic yeastCandida boidinii. (2013)
  • 著者名/発表者名: S. Fujimura, H. Yurimoto, S. Kurimoto, Y.Matsufuji, T. Ito, T. Hayakawa, N. Tomizuka, Y. Sakai, and T. Nakagawa
  • 雑誌名: FEMS Yeast Res 巻: 13 ページ: 359-366
  • DOI: doi:10.1111/1567-1364.12040
  • 査読あり
• [雑誌論文] Roseomonas musae sp. nov., a new bacterium isolated from a banana phyllosphere. (2013)
  • 著者名/発表者名: P. Nutaratat, N. Srisuk, K. Duangmal, H. Yurimoto, Y. Sakai, Y. Muramatsu, and Y.Nakagawa
  • 雑誌名: Antonie van Leeuwenhoek 巻: 103 ページ: 617-624
  • DOI: doi:10.1007/s10482-012-9845-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular characterization of the Candida boidinii MIG1and its role in regulation of methanol inducible gene expression (2012)
  • 著者名/発表者名: Z. Zhai, H. Yurimoto, and Y. Sakai
  • 雑誌名: Yeast 巻: 29 ページ: 293-301
  • DOI: doi:10.1002/yea.2909
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of methanotrophs in the phyllosphere (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Iguchi, I. Sato, M. Sakakibara, H. Yurimoto, and Y. Sakai
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem 巻: 76 ページ: 1580-1583
  • DOI: doi:10.1271/bbb.120281
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of pink-pigmented facultative methylotrophs on leaves of vegetables. (2012)
  • 著者名/発表者名: M. Mizuno, H. Yurimoto, N. Yoshida, H. Iguchi, and Y. Sakai
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem 巻: 76 ページ: 578-580
  • DOI: doi:10.1271/bbb.110737
  • 査読あり
• [雑誌論文] Msn5p is involved in formaldehyde resistance but not in oxidative stress response in the methylotrophic yeastCandida boidinii. (2012)
  • 著者名/発表者名: Z. Zhai, H. Yurimoto, and Y. Sakai
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem 巻: 76 ページ: 299-304
  • DOI: doi:10.1271/bbb.110679
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stimulation of methanotrophic growth in co-cultures by cobalamin excreted by rhizobia. (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Iguchi, H. Yurimoto, and Y. Sakai
  • 雑誌名: Appl. Environ. Microbiol 巻: 77 ページ: 8509-8515
  • DOI: doi:10.1128/AEM.05834-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Yeast methylotrophy and autophagy in a methanol-oscillating environment on growing Arabidopsis thaliana leaves. (2011)
  • 著者名/発表者名: K. Kawaguchi, H. Yurimoto, M. Oku, and Y. Sakai
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6 ページ: e25257
  • DOI: doi:10.1371/journal.pone.0025257
  • 査読あり
• [雑誌論文] C1 微生物複合生物系による省エネ型炭素固定技術 (2011)
  • 著者名/発表者名: 阪井康能、由里本博也
  • 雑誌名: 環境資源工学 巻: 58 ページ: 59-63
• [雑誌論文] Inhibition of surgical trauma-enhanced peritoneal dissemination of tumor cells by human catalase derivatives in mice (2011)
  • 著者名/発表者名: C. Nishizaki, M. Nishikawa, T. Yata, T. Yamada, Y. Takahashi, M. Oku, H. Yurimoto, Y. Sakai,K. Nakanishi, and Y. Takakura
  • 雑誌名: Free Radic. Biol. Med 巻: 51 ページ: 773-779
  • DOI: doi:10.1016/j.freeradbiomed.2011.05.025
  • 査読あり
• [雑誌論文] Yeast methylotrophy: metabolism, gene regulation, and peroxisome homeostasis (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Yurimoto, M. Oku, and Y. Sakai
  • 雑誌名: Int. J. Microbiol 巻: 2011 ページ: 101298
  • DOI: doi:10.1155/2011/101298
  • 査読あり
• [雑誌論文] Methylovulum miyakonense gen. nov., sp. Nov., a novel type I methanotroph from a forest soil. (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Iguchi, H. Yurimoto, and Y. Sakai
  • 雑誌名: Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 巻: 61 ページ: 810-815
  • DOI: doi:10.1099/ijs.0.019604-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] 光合成経路と相性のよいホルムアルデヒド固定反応 (2011)
  • 著者名/発表者名: 由里本博也、阪 井 康 能
  • 雑誌名: バイオサイエンスとインダストリー 巻: 69 ページ: 46-48
• [雑誌論文] C1微生物と植物の相互作用と炭素循環 ‐代謝生化学・分子細胞生物学からの理解‐ (2010)
  • 著者名/発表者名: 由里本博也、阪井康能
  • 雑誌名: 植物の生長調節 巻: 45 ページ: 125-131
• [雑誌論文] Crystal structure of 3-hexulose- 6-phosphate synthase, a member of the orotidine 5'-monophosphate decarboxylase suprafamily (2010)
  • 著者名/発表者名: I. Orita, A. Kita, H. Yurimoto, N. Kato, Y. Sakai, and K. Miki
  • 雑誌名: Proteins 巻: 78 ページ: 3488-3492
  • DOI: doi:10.1002/prot.22860
  • 査読あり
• [雑誌論文] Soluble and particulate methane monooxygenase gene clusters in the type I methanotrophMethylovulum miyakonense HT12. (2010)
  • 著者名/発表者名: H. Iguchi, H. Yurimoto, and Y. Sakai
  • 雑誌名: FEMS Microbiol. Lett. 巻: 312 ページ: 71-76
  • DOI: doi:10.1111/j.1574-6968.2010.02101.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Overexpression of an HPS/PHI fusion enzyme from Mycobacterium gastri in chloroplasts of geranium enhances its ability to assimilate and phytoremediate formaldehyde (2010)
  • 著者名/発表者名: Z. Song, I. Orita, F. Yin, H. Yurimoto, N. Kato,Y. Sakai, K. Izui, K. Li, and L. Chen
  • 雑誌名: phytoremediate formaldehyde. 巻: 32 ページ: 1541-1548
  • DOI: doi:10.1007/s10529-010-0324-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Peroxisomal catalase gene in the methylotrophic yeast Pichia methanolica (2010)
  • 著者名/発表者名: T. Nakagawa, K. Yoshida, A. Takeuchi, T. Ito, S. Fujimura, Y. Matsufujii, N. Tomizuka, H. Yurimoto, Y. Sakai, and T. Hayakawa
  • 雑誌名: Biotechnol. Biochem 巻: 74 ページ: 1733-1735
  • DOI: doi:10.1271/bbb.100329
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular characterization of two genes with high similarity to the dihydroxyacetone synthase gene in the methylotrophic yeast Pichia methanolica (2010)
  • 著者名/発表者名: T. Nakagawa, S. Fujimura, T. Ito, Y. Matsufujii,S. Ozawa, T. Miyaji, J. Nakagawa, N. Tomizuka, H. Yurimoto, Y. Sakai,and T. Hayakawa
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem. 巻: 74 ページ: 1491-1493
  • DOI: doi:10.1271/bbb.100153
  • 査読あり
• [雑誌論文] Trm2p-dependent derepression is essential for methanol-specific gene activation in the methylotrophic yeast Candida boidinii. (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Sasano, H. Yurimoto, M. Kuriyama, and Y. Sakai
  • 雑誌名: FEMS Yeast Res 巻: 10 ページ: 535-544
  • DOI: doi:10.1111/j.1567-1364.2010.00640.x
  • 査読あり
• [学会発表] Development of environmental technology based on symbiotic interactions of C1-microorganisms and plants. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yurimoto, H
  • 学会等名: The 6th JapanFinland Biotechnology Symposium
  • 発表場所: Sendai, Japan
  • 年月日: 20120604-08
• [学会発表] Metabolic flux regulates methanol-inducible gene expression in the methylotrophic yeast Candida boidinii (2011)
  • 著者名/発表者名: Yurimoto, H
  • 学会等名: The 25th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology
  • 発表場所: Olsztyn, Poland
  • 年月日: 20110711-16
• [学会発表] Gene organization and function of the RuMP pathway enzymes in methanotrophs (2010)
  • 著者名/発表者名: Yurimoto, H
  • 学会等名: Gordon Research Conference on Molecula Basis of Microbial One-Carbon Metabolism.
  • 発表場所: Lewiston, USA
  • 年月日: 20100801-06
• [学会発表] Biotechnological application of metabolic functions in C1-microorganisms. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yurimoto, H
  • 学会等名: The 5th Japan- Finland Biotechnology Symposium
  • 発表場所: Turku, Finland
  • 年月日: 2010-06-10
• [産業財産権] メタン酸化菌に対して用いられるメタン酸化活性向上剤、及びその利用 (2010)
  • 発明者名: 阪井康能、井口博之、由里本博也
  • 権利者名: 京都大学
  • 産業財産権番号: 特願2010-183287
  • 出願年月日: 2010-08-18