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2010 年度 実績報告書

有機反応ダイナミクス支配現象の微視的解析

研究課題

研究課題/領域番号 22350023
研究機関立教大学

研究代表者

山高 博  立教大学, 理学部, 教授 (60029907)

研究分担者 望月 祐志  立教大学, 理学部, 教授 (00434209)
古明地 勇人  独立行政法人産業技術総合研究所, ナノシステム研究部門, 主任研究員 (30357032)
キーワード有機化学反応 / シミュレーション / 量子化学 / 遷移状態 / 溶媒効果
研究概要

本年度の研究実施計画にあげた3項目のうち、第1のFMO-MD法の開発拡充については、計画通りFMO法にその発展として3体フラグメント補正項を含むFMO3を実装した。さらに、MP2の微分計算エンジンの開発を行い、ベンチマーク計算を実施した。第2の有機反応の経路分岐現象の検討に関しては、気相での分子動力学シミュレーションによってベックマン転位のモデル反応において経路分岐現象を見いだしたのに続いて、有機化学実験による検討を行った。まず、9種類の置換1-phenyl-2-propanone,3-phenyl-2-butanone,および3-methyl-3-phenyl-2-butanoneのオキシム誘導体を合成し、これらの水性アセトニトリル中での反応を解析して、反応における経路分岐現象に関する実験的証左を得た。また、この研究の新たな展開として、シュミット転位反応やE2/E1cb脱離反応についても気相での分子動力学シミュレーション計算を行い、これらの反応でも経路分岐現象が存在することを見いだした。これらの結果は、有機反応のダイナミクス支配が一般の予想を超えて広く起こっていることを示唆している。第3の水溶液中での有機反応の微視的挙動の研究に関しては、置換反応だけではなく異なるタイプの反応における水中での微視的機構を解明するため、アミンのカルボニル化合物への付加反応について検討した。その結果、反応の進行に伴う溶媒分子の配座変化の様子を明らかにすることができた。中でも、複数の溶媒水分子を介したプロトンリレーの存在が明確に観察され、このプロトンリレーが協奏的反応を可能にしている様子が明らかとなった。これらの成果は、それぞれ化学分野のtop journalに発表した。

  • 研究成果

    (26件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (17件)

  • [雑誌論文] Fragment molecular orbital calculations for excitation energies of blue- and yellow-fluorescent proteins2011

    • 著者名/発表者名
      N.Taguchi, Y.Mochizuki, T.Nakano
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 504 ページ: 76-82

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fragment molecular orbital-based molecular dynamics (FMO-MD) method with MP2 gradient.2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Mochizuki, T.Nakano, Y.Komeiji, K.Yamashita, Y.Okiyama, H.Yoshikawa, H.Yamataka
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 504 ページ: 95-99

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamics Effects on E2/E1cb Borderline Mechanism. Unimolecular Elimination of 2-Aryl-3-chloro-2-R-propanols.2011

    • 著者名/発表者名
      S.Itoh, H.Yamataka
    • 雑誌名

      Chemistry, A European Journal

      巻: 17 ページ: 1230-1237

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Acceleration of fragment molecular orbital calculations with Cholesky decomposition approach2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Okiyama, T.Nakano, K.Yamashita, Y.Mochizuki, N.Taguchi, S.Tanaka
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 490 ページ: 84-89

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Large-scale FMO-MP3 calculations on the surface proteins of influenza virus, hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA)2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Mochizuki, K.Yamashita, K.Fukuzawa, K.Takematsu, H.Watanabe, N.Taguchi, Y.Okiyama, M.Tsuboi, T.Nakano, S.Tanaka
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 493 ページ: 346-352

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-body expansion and generalized dynamic fragmentation improve the Fragment Molecular Orbital-based Molecular Dynamics (FMO-MD)2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Komeiji, Y.Mochizuki, T.Nakano
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 484 ページ: 380-386

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reaction Pathway of Aliphatic Pinacol-type Rearrangement Reexamined2010

    • 著者名/発表者名
      S.Itoh, H.Yamataka
    • 雑誌名

      Journal of Physical Organic Chemistry

      巻: 23 ページ: 789-795

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reaction Pathways and Possible Path Bifurcation for the Schmidt Reaction.2010

    • 著者名/発表者名
      T.Katori, S.Itoh, M.Sato, H.Yamataka
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 132 ページ: 3413-3422

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Does Amination of Formaldehyde Proceeds through Zwitterionic Intermediate in Water? FMO-MD Simulations by Using Constraint Dynamics2010

    • 著者名/発表者名
      M.Sato, H.Yamataka, Y.Komeiji, Y.Mochizuki, T.Nakano
    • 雑誌名

      Chemistry, A European Journal

      巻: 16 ページ: 6430-6433

    • 査読あり
  • [学会発表] α-ブロモアセトフェノンの求核反応における置換/付加反応の境界領域の計算化学的解析2011

    • 著者名/発表者名
      伊藤晋平、山高博
    • 学会等名
      第91日本化学会春季年会
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2011-03-26
  • [学会発表] フェナシルクロリドとメトキシドイオンの反応経路の解析32011

    • 著者名/発表者名
      笹川慶太、山高博
    • 学会等名
      第91日本化学会春季年会
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2011-03-26
  • [学会発表] アシロインの二重水素転位反応に関する理論的解析2011

    • 著者名/発表者名
      神宮路賢、山高博
    • 学会等名
      第91日本化学会春季年会
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2011-03-26
  • [学会発表] フェニルメチルニトロナートアンビデントアニオンのメチル化機構の速度論的研究2011

    • 著者名/発表者名
      坂田朋未、山高博
    • 学会等名
      第91日本化学会春季年会
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2011-03-26
  • [学会発表] MOおよびMD計算によるビニルジアゾニウムイオンの窒素脱離における経路分岐現象の検討2011

    • 著者名/発表者名
      綿貫亜美、山高博
    • 学会等名
      第91日本化学会春季年会
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2011-03-26
  • [学会発表] シュミソト転位と断片化の反応経路に関する実験的研究2011

    • 著者名/発表者名
      山本雄太郎、秋元諒、山高博
    • 学会等名
      第91日本化学会春季年会
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2011-03-26
  • [学会発表] 1-置換フェニル-2-プロパノンオキシム類のベックマン転位と断片化の反応経路に関する研究2010

    • 著者名/発表者名
      山本雄太郎、長谷川拡人、山高博
    • 学会等名
      第21回基礎有機化学討論会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2010-09-09
  • [学会発表] フェナシルクロリドとメトキシドイオンの反応経路の解析22010

    • 著者名/発表者名
      笹川慶太、山高博
    • 学会等名
      第21回基礎有機化学討論会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2010-09-09
  • [学会発表] α-ブロモアセトフェノンの求核攻撃に出現する経路分岐現象の計算化学的解析2010

    • 著者名/発表者名
      伊藤晋平、山高博
    • 学会等名
      第21回基礎有機化学討論会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2010-09-09
  • [学会発表] MDを利用した水溶液中におけるt-BuClの加水分解反応シミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      佐藤真、山高博、古明地勇人、望月祐志、中野達也
    • 学会等名
      第21回基礎有機化学討論会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2010-09-09
  • [学会発表] アシロイン誘導体の水素移動反応に関する理論的研究2010

    • 著者名/発表者名
      神宮路賢、山高博
    • 学会等名
      第21回基礎有機化学討論会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2010-09-09
  • [学会発表] フェニルメチルニトロナートのメチル化機構の速度論的研究2010

    • 著者名/発表者名
      坂田朋未、山高博
    • 学会等名
      第21回基礎有機化学討論会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2010-09-09
  • [学会発表] Dynamic path bifurcation in the Beckmann reaction : Support from kinetic analyses2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Yamamoto, H.Hasegawa, H.Yamataka
    • 学会等名
      International Conference on Physical Organic Chemistry
    • 発表場所
      釜山(韓国)
    • 年月日
      2010-08-28
  • [学会発表] Experimental study on the reaction pathway of Schmidt rearrangement and fragmentation.2010

    • 著者名/発表者名
      Y.Yamamoto, R.Akimoto, H.Yamataka
    • 学会等名
      International Conference on Physical Organic Chemistry
    • 発表場所
      釜山(韓国)
    • 年月日
      2010-08-28
  • [学会発表] A Theoretical Study of Borderline Mechanism of Nucleophilic Addition/Substitution Reaction of α-bromoacetophenone.2010

    • 著者名/発表者名
      S.Itoh, H.Yamataka
    • 学会等名
      International Conference on Physical Organic Chemistry
    • 発表場所
      釜山(韓国)
    • 年月日
      2010-08-28
  • [学会発表] Theoretical Analysis of Amination of Fornaldehyde : FMO-MD Simulations by Using Constraint Dynamics.2010

    • 著者名/発表者名
      M.Sato, H.Yamataka, Y.Komeji, Y.Mochizuki, T.Nakano
    • 学会等名
      International Conference on Physical Organic Chemistry
    • 発表場所
      釜山(韓国)
    • 年月日
      2010-08-28
  • [学会発表] An Analysis of the Reaction Pathway of Phenacyl Chloride with Methoxide Ion.2010

    • 著者名/発表者名
      K.Sasagawa, H.Yamataka
    • 学会等名
      International Conference on Physical Organic Chemistry
    • 発表場所
      釜山(韓国)
    • 年月日
      2010-08-28

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公開日: 2012-07-19  

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