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2010 年度 実績報告書

ナイロンオリゴマー分解酵素(NylABC)の分子設計と物質生産への応用

研究課題

研究課題/領域番号 22360350
研究機関兵庫県立大学

研究代表者

根来 誠司  兵庫県立大学, 大学院・工学研究科, 教授 (90156159)

研究分担者 武尾 正弘  兵庫県立大学, 大学院・工学研究科, 准教授 (40236443)
加藤 太一郎  兵庫県立大学, 大学院・工学研究科, 助教 (60423901)
キーワードナイロンオリゴマー / 6-アミノカプロン酸 / 6-Aminohexanoate oligomer / ナイロンオリゴマー分解酵素 / X線結晶構造解析 / アミド合成 / 耐熱性酵素
研究概要

加水分解酵素の逆反応によるアミド合成は、物質生産の観点から重要な検討課題であるが、本来の加水分解機能と比べて、通常、有機溶媒中における合成活性が低いため、十分な収率が得られない。本研究では、種々のナイロンオリゴマー分解変異酵素を用いて、高効率のアミド合成を可能とする触媒中心の形成要件について検討した。これまで、NylB'カルボン酸エステル分解酵素からのナイロンオリゴマー分解活性の高機能化では、G181D→H266Nによる適応歩行(タイプA変異)と、D370Y→R187S→F264Cによる適応歩行(タイプB変異)の2種類が存在することを確認しているが、前者ではアミド分解活性(水溶液中)と合成活性(有機溶媒中)がほぼ同等であった(合成/分解活性比≒1)。一方、後者の変異酵素では、分解活性のみを有し、合成活性は検出されなかった(合成/分解活性比<0.005)。生成物平衡濃度に影響を与える箇所として、触媒クレフト先端部に位置する187位に着目した。タイプA変異酵素のアルギニン(Arg187)を、合成オリゴヌクレオチドを用いた部位特異変異により、種々のアミノ酸に置換した。tert-ブチルアルコール中におけるアミド合成機能と加水分解機能の反応速度論解析を行った結果、変異酵素間の合成収率の変化は、主としてK_<cat>効果によるものであり、基質結合能(K_m値)は殆ど影響を受けないことが明らかとなった。さらに、アミド合成の触媒効率(K_<cat>/K_m)は、370位アミノ酸置換によって影響を受け、バリン置換によって最も高い触媒効率を示すことを見いだした。これらの変異酵素の立体構造解析を行った結果、アミド合成を高効率で触媒するため、触媒クレフト周辺の疎水性反応場形成(水排除効果および触媒部位の外部環境への遮蔽)が重要であると結論した。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Enantiodifferentiation of ketoprofen by Japanese firefly luciferase from Luciola lateralis2011

    • 著者名/発表者名
      D.Kato, T.Tatsumi, A.Bansho, K.Teruya, H.Yoshida, M.Takeo, S.Negoro
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Catalysis B : Enzymatic

      巻: 69 ページ: 140-146

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular dynamics studies on mutational structures of a nylon-6 byproduct-degrading enzyme2011

    • 著者名/発表者名
      T.Baba, K.Kamiya, T.Matsui, N.Shibata, Y.Higuchi, T.Kobayashi, S.Negoro, Y.Shigeta
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: (印刷中)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification and characterization of another 4-nitrophenol degradation gene cluster, nps, in Rhodococcus sp.strain PN1.2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto K, Nishimura M, Kato D, Takeo M, Negoro S
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering.

      巻: (印刷中)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] X-ray crystallographic analysis of the 6-aminohexanoate cyclic dimer hydrolase : catalytic mechanism and evolution of an enzyme responsible for nylon-6 byproduct degradation2010

    • 著者名/発表者名
      Yasuhira, K.Shibata, N., Mongami, G., Uedo, Y., Atsumi, Y Kawashima, Y., Hibino, A, Tanaka, Y., Lee, Y-Ho, Kato, D., Takeo, M., Higuchi, Y., Negoro S
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 285 ページ: 1239-1248

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enzymatic synthesis of nylon-6 units in organic solvents containing low concentrations of water.2010

    • 著者名/発表者名
      Kawashima, Y., Yasuhira, K., Shibata, N., Matsuura, Y., Tanaka, Y., Taniguchi, M., Miyoshi, Y., Takeo, M., Kato, D., Higuchi, Y., Negoro, S.
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Catalysis B : Enzymatic

      巻: 64 ページ: 81-88

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification and gene cloning of an enantioselective thioesterification enzyme from Brevibacterium ketoglutamicum KU 1073, a deracemization bacterium of 2-(4-chlorophenoxy)propanoic acid.2010

    • 著者名/発表者名
      Kato D, Yoshida H, Takeo M, Negoro S, Ohta H
    • 雑誌名

      Bioscience Biotechnology Biochemistry

      巻: 74 ページ: 2405-2412

    • 査読あり
  • [学会発表] ナイロン関連物質の酵素分解と合成:高機能触媒の分子設計2011

    • 著者名/発表者名
      根来誠司
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会(シンポジウム)
    • 発表場所
      京都市(京都女子大学)(招待講演)
    • 年月日
      2011-03-28
  • [学会発表] ナイロンオリゴマー加水分解酵素(NylC)の自己分断機構2011

    • 著者名/発表者名
      田中優佑, 大島祥平, 柴田浩, 柴田直樹, 加藤太一郎, 武尾正弘, 樋口芳樹, 根来誠司
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      京都市(京都女子大学)
    • 年月日
      2011-03-26
  • [学会発表] NylCの高度耐熱化とナイロン分解への応用2011

    • 著者名/発表者名
      田中優佑, 三田隆二, 橋本悠, 柴田直樹, 李映昊, 後藤祐児, 樋口芳樹, 加藤太一郎, 武尾正弘, 根来誠司
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      京都市(京都女子大学)
    • 年月日
      2011-03-26
  • [学会発表] ナイロンオリゴマー分解酵素によるアミド合成2011

    • 著者名/発表者名
      小林達也, 河島康之, 中田悠介, 柴田直樹, 加藤太一郎, 武尾正弘, 樋口芳樹, 重田育照, 神谷克政, 根来誠司
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      京都市(京都女子大学)
    • 年月日
      2011-03-26
  • [学会発表] ナイロンオリゴマー分解酵素を用いたアミド合成に関する研究2010

    • 著者名/発表者名
      中田悠介, 河島康之, 小林達也, 柴田直樹, 加藤太一郎, 武尾正弘, 樋口芳樹, 根来誠司
    • 学会等名
      第64回 酵素工学研究会
    • 発表場所
      東京大学・山上会館
    • 年月日
      2010-11-19
  • [学会発表] ナイロンオリゴマー加水分解酵素(NylC)の高度耐熱化とその分子機構2010

    • 著者名/発表者名
      田中優佑, 柴田浩, 橋本悠, 柴田直樹, 李映昊, 加藤太一郎, 武尾正弘, 樋口芳樹, 後藤祐児, 根来誠司
    • 学会等名
      第64回 酵素工学研究会
    • 発表場所
      東京大学・山上会館
    • 年月日
      2010-11-19
  • [学会発表] Enzymatic degradation and synthesis of nylon-6 related compounds2010

    • 著者名/発表者名
      根来誠司
    • 学会等名
      国際バイオポリマーシンポジウム2010 (ISBP2010)
    • 発表場所
      ドイツ(シュツットガルト)(招待講演)
    • 年月日
      2010-10-04

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公開日: 2012-07-19  

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