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2010 年度 実績報告書

C-to-U型RNA編集による植物オルガネラゲノムの機能維持機構の起源と進化

研究課題

研究課題/領域番号 22370002
研究機関京都府立大学

研究代表者

小保方 潤一  京都府立大学, 生命環境科学研究科, 教授 (50185667)

研究分担者 椎名 隆  京都府立大学, 生命環境科学研究科, 教授 (10206039)
杉山 康雄  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 准教授 (70154507)
キーワード葉緑体RNA編集 / C-to-U型RNA編集 / 葉緑体ゲノム / 植物ゲノム / RNA編集因子 / シロイヌナズナ / 単離精製 / RNA-タンパク質複合体
研究概要

本年度の研究では、次の二つの大きな成果が得られた。
(1)生鮮重量約10kgのシロイヌナズナから無傷葉緑体を単離し、そこからRNA編集活性をもつ葉緑体抽出液を調製した。次いで、この抽出液を、野生型及び種々の塩基置換を導入したpsbE遺伝子配列を持つRNA鎖によってアフィニティー精製し、最終的に、psbE RNA上の特異的なC塩基を180分間に0.5fmolほどUに変換できるRNA編集活性を濃縮・精製することに成功した。回収された精製画分に含まれるタンパク質成分をLC-MS/MS法によって分析したところ、RNA編集因子を構成するタンパク質成分の候補として、3~10種程度のタンパク質がリストアップされた。現在、これらの候補タンパク質について、生化学的手法と遺伝学的手法の双方から,RNA編集機能に対する関わりを調べている。
(2)in vitro RNA編集系を用いた生化学的な解析から、葉緑体RNA編集因子の活性がRNaseに感受性であることが示された。この知見は、RNA編集因子が単純なタンパク質装置ではなく、RNA成分を含むRNA-タンパク質複合体(RNP complex)であることを示唆している。現在の所、RNase処理によって失活するのが「配列特異的な基質認識能」なのか、「C-to-U変換を司る触媒能」なのかは、まだ不明である。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Transcriptome analysis of respiration-responsive genes in Chlamydomonas reinhardtii : Mitochondrial retrograde signaling coordinates the genes for cell proliferation with energy-producing metabolisms.2011

    • 著者名/発表者名
      Matsuo, M., Hachisu, R., Tabata, S., Fukuzawa, H., Obokata, J.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol

      巻: 52 ページ: 333-343

    • 査読あり
  • [雑誌論文] efense response of a pepper cultivar cv.Sy-2 is induced at temperatures below 24℃2011

    • 著者名/発表者名
      Koeda, S., Hosokawa, M., Kang, B.C., Tanaka, C., Choi, D., Sano, S., Shiina, T., Doi, M., Yazawa
    • 雑誌名

      J Plant Res

      巻: (印刷中)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selective Excitation of Photosystems in Chloroplasts inside Plant Leaves Observed by Near-Infrared Laser-Based Fluorescence Spectral Microscopy.2010

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa, M., Shiina, T., Terazima, M., Kumazaki, S.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol

      巻: 51 ページ: 225-238

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nuclear/Nucleolar GTPase 2 Proteins as a Subfamily of YlqF/YawG GTPases Function in Pre-60S Ribosomal Subunit Maturation of Mono- and Dicotyledonous Plants.2010

    • 著者名/発表者名
      Im, C.H., Hwang, S.M., Son, Y.S., Heo, J.B., Bang, W.Y., Suwastika, I.N., Shiina, T., Bahk, J.D
    • 雑誌名

      J Biol Chem.

      巻: 286 ページ: 8620-8632

    • 査読あり
  • [学会発表] 一次共生者の遺伝子群はどのように宿主核の発現系に取り込まれるのか2010

    • 著者名/発表者名
      小保方潤一
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド国際会議場
    • 年月日
      2010-12-09
  • [学会発表] How the chloroplast-nucelar genome system has evolved in plants2010

    • 著者名/発表者名
      Obokata, J.
    • 学会等名
      ISBDS2010 International Symposium on Biodiversity Sciences "Genome, Evolution and Environment"
    • 発表場所
      ホテル・ルブラ王山名古屋
    • 年月日
      2010-08-02

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公開日: 2012-07-19  

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