II型制限酵素HindIIIの時分割結晶構造解析

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22370036
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 渡邉 信久 名古屋大学, シンクロトロン光研究センター, 教授 (70212321)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: X線 / 結晶構造解析 / 制限酵素 / 反応機構 / 時間分割 / フリーズトラップ

研究概要

遺伝子実験に広く使用されている II 型制限酵素 HindIII の基質 DNA の切断反応のメカニズムを解明するため,HindIII の基質 DNA 複合体の結晶を作成し,金属イオンをソーキングして一定時間後に急速凍結するフリーズトラップ法による時間分割結晶構造解析を行った.HindIII の切断反応には2つの金属イオンが必須であり,2つめの金属イオンが結合して始めて切断反応が起こることが解明された.

研究成果

• [学会発表] Time-resolved structure analysis of restriction endonuclease Hind III (2013)
  • 著者名/発表者名: Kawamura, T., Kobayashi, T. and Watanabe, N
  • 学会等名: International Conference on Structural Genomics 2013 - Structural Life Science
  • 発表場所: Keio Plaza Hotel Sapporo
  • 年月日: 20130729-0801
• [学会発表] II 型制限酵素 Hind III の反応メカニズムと 2価金属イオン (2012)
  • 著者名/発表者名: 小林朋希,河村高志,渡邉信久
  • 学会等名: 日本結晶学会年会
  • 発表場所: 東北大学片平キャンパス
  • 年月日: 2012-10-25
• [学会発表] Hind III-cognate DNA 複合体の新規結晶化条件とフリーズトラップ法のための装置開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小林朋希,河村高志,渡邉信久
  • 学会等名: 日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ホテル阪急エクスポパーク
  • 年月日: 20110607-09
• [学会発表] フリーズトラップ用時分割フラッシュクーリング結晶マウント装置の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 渡邉信久,小林朋希,河村高志
  • 学会等名: 日本結晶学会年会
  • 発表場所: 大阪大学コンベンションセンター
  • 年月日: 2010-12-05