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2010 年度 実績報告書

相同組み換えを制御する新規メディエーターの構造科学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 22370045
研究機関東京大学

研究代表者

清水 敏之  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 教授 (30273858)

キーワード相同組み換え / メディエーター / リコンビナーゼ / X線結晶構造解析
研究概要

全長のSwi5-Sfr1は精製可能であり結晶化も行ってきたが結晶が得られていない。そこで安定なドメインを見つけるためにプロテアーゼ消化を行い、Sfr1のN末端側は比較的切断されやすいことを見出した。そこでSfr1のN末を約半分削ったコンストラクト(Sfr1C)を数種類作成し、Swi5と共発現させて複合体の形(Swi5-Sfr1C)で精製し結晶化を試みた。その結果結晶が得られ、最終的に分解能2.2Åの回折像が得られた。この結晶の空間群はP2_12_12で格子定数はa=88.2Å,b=128.7Å,c=60.0Åであった。位相を決定するためにセレノメチオニン置換体の試料を調整し、この置換体でも結晶を得ることに成功した。なお、Swi5-Sfr1Cはほぼ全長と同等の組み換え活性があることは確認している。
セレノメチオニン置換体のデータをもとに単波長異常分散法により初期の電子密度を得ている。現在はこの電子密度をもとにモデリングを行っている。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2010

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Expression, Purification and crystallization of Swi5 and the Swi5-Sfr1 complex from fission yeast2010

    • 著者名/発表者名
      Kuwabara, et al
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.

      巻: F66 ページ: 1124-1126

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The structure of the N-terminal regulatory domain of a plant NADPH oxidase and its functional implications2010

    • 著者名/発表者名
      Oda, et al
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 285 ページ: 1435-1445

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of human REV7 in complex with a human REV3 fragment and structural implication of the interaction between DNA polymerase ζ and REV12010

    • 著者名/発表者名
      Hara, et al
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 285 ページ: 12299-122307

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure and functional implication of zinc-finger domain of Nanos2010

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto, et al
    • 雑誌名

      EMBO reports

      巻: 11 ページ: 848-853

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and functional characterization of Vibrio parahaemolyticus thermostable direct hemolysin (TDH)2010

    • 著者名/発表者名
      Yanagihara, et al
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem.

      巻: 285 ページ: 16267-16274

    • 査読あり
  • [学会発表] 関節リウマチ関連タンパク質PAD4の構造科学的研究2010

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 学会等名
      構造生物社会連携シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2010-11-20
  • [図書] 「入門構造生物学」(「転写)部分を担当)2010

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 総ページ数
      199
    • 出版者
      共立出版

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公開日: 2013-06-26  

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