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2011 年度 実績報告書

ヘム・銅酸素還元酵素のエネルギー変換機構解明のための構造・機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 22370060
研究機関兵庫県立大学

研究代表者

村本 和優  兵庫県立大学, 大学院・生命理学研究科, 准教授 (50305679)

キーワード生物物理 / ナノバイオ / 蛋白質 / 酵素 / 呼吸鎖 / 生体エネルギー変換 / X線結晶構造解析
研究概要

呼吸鎖電子伝達系のヘム・銅酸素還元酵素はO_2還元反応とプロトンポンプのエネルギー変換を効率的に実現する。ヘム・銅酸素還元酵素は原核生物から高等生物まで普遍的に存在し、スーパーファミリーを形成する。スーパーファミリーは数タイプのサブファミリーに分類され、aa_3とcbb_3タイプではプロトン輸送経路とエネルギー変換効率が異なり、O_2分圧の異なる環境に適応して機能する。
効率の高いエネルギー変換機構を解明することを目的として、aa_3タイプの高分解能X線構造解析を行った。休止酸化型と還元型の酵素結晶から1.4Å分解能までの回折データを収集した。構造解析の結果、これまでに明らかになった酸化還元に伴う構造変化に加えて、新たに詳細な構造変化が見いだされた。酸化還元に伴い酵素の活性中心部位付近にある水分子のクラスター構造が変化することが明らかになり、これらの水分子の動きが酵素機能に関与していることが示唆される。
エネルギー変換効率を決定する構造化学的要因を解明することを目的として、aa_3タイプの構造をcbb_3タイプと比較解析する。cbb_3タイプの高分解能X線結晶構造解析を行うために、cbb_3タイプの大量発現条件を詳細に検討した。cbb_3タイプを大量発現させた菌体から、cbb_3タイプを精製する条件を検討した結果、十分なO_2消費活性を示す精製標品の収量と純度が向上した。aa_3タイプとcbb_3タイプの活性を比較した結果、アスコルビン酸/TMPDを電子供与体とする系ではcbb_3タイプの方がaa_3タイプよりも顕著に高いO_2消費活性を示すことが分かった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

aa_3タイプの構造解析が1.4Å分解能に到達したことにより、構造上の新たな知見が得られた。cbb_3タイプの大量発現系、および精製方法がほぼ確立された。また、活性測定系が確立され、機能上の特徴が見いだされた。

今後の研究の推進方策

aa_3タイプの1.4Å分解能での構造解析においてモデル構造の精密化を進めるとともに、さらに高分解能での解析可能なデータ収集に取り組む。aa_3タイプの反応中間体の構造解析を進める。cbb_3タイプの精製を進め、収量と純度をさらに向上させる。精製標品を用いて結晶化に取り組む。

  • 研究成果

    (24件)

すべて 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (19件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Structural studies on bovine heart cytochrome c oxidase2012

    • 著者名/発表者名
      吉川信也、村本和優、伊藤・新澤恭子、望月正雄
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta

      巻: 1817 ページ: 579-589

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2011.12.012

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The O_2 reduction and proton pumping gate mechanism of bovine heart cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      吉川信也、村本和優、伊藤・新澤恭子
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta

      巻: 1807 ページ: 1279-1286

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2011.06.008

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proton-pumping mechanism of cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      吉川信也、村本和優、伊藤・新澤恭子
    • 雑誌名

      Annu.Rev.Biophys.

      巻: 40 ページ: 205-223

    • DOI

      10.1146/annurev-biophys-042910-155341

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Distinguishing between Cl^- and O_2^<2-> as the bridging element between Fe^<3+> and Cu^<2+> in the resting oxidized cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      菅倫寛、矢野直峰, 他
    • 雑誌名

      Acta Cryst.D

      巻: 67 ページ: 742-744

    • DOI

      10.1107/S0907444911022803

    • 査読あり
  • [学会発表] チトクロム酸化酵素の酸素還元機構と高分解能データ収集2012

    • 著者名/発表者名
      村本和優
    • 学会等名
      大阪大学蛋白質研究所セミナー
    • 発表場所
      大阪大学(大阪府)(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-07
  • [学会発表] 呼吸鎖電子伝達系の構造と機能~酸素還元酵素を中心として~2012

    • 著者名/発表者名
      村本和優
    • 学会等名
      名古屋大学大学院理学研究科生命理学専攻セミナーアドバンス生命理学特論
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)(招待講演)
    • 年月日
      2012-01-04
  • [学会発表] チトクロムcbb_3酸化酵素の発現と精製2011

    • 著者名/発表者名
      安藤友里子, 他
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第37回討論会
    • 発表場所
      京都産業大学(京都府)
    • 年月日
      2011-12-21
  • [学会発表] チトクロム酸化酵素反応中間体2011

    • 著者名/発表者名
      木登梨佳, 他
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第37回討論会
    • 発表場所
      京都産業大学(京都府)
    • 年月日
      2011-12-21
  • [学会発表] チトクロム酸化酵素反応サイクルの構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      村本和優, 他
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第37回討論会
    • 発表場所
      京都産業大学(京都府)
    • 年月日
      2011-12-21
  • [学会発表] Optimization of expression condition and purification of cbb_3-type cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      安藤友里子, 他
    • 学会等名
      日本生物物理学会第49回年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-17
  • [学会発表] Crystallization of bovine cytochrome c oxidase by new detergents2011

    • 著者名/発表者名
      畑中美紀, 他
    • 学会等名
      日本生物物理学会第49回年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-16
  • [学会発表] The effect of crystallization and cryoprotectant treatment on the absorption spectra of fully-oxidized cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      望月正雄, 他
    • 学会等名
      日本生物物理学会第49回年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-16
  • [学会発表] X-ray structural analysis of cytochrome c oxidase in the resting oxidized state at 1.4Å resolution2011

    • 著者名/発表者名
      矢野直峰, 他
    • 学会等名
      日本生物物理学会第49回年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-16
  • [学会発表] X-ray structural analysis of R and O form intermediates of bovine cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      藤澤秀徳, 他
    • 学会等名
      日本生物物理学会第49回年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-16
  • [学会発表] X-ray structural analysis of P form intermediate of bovine cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      木登梨佳, 他
    • 学会等名
      日本生物物理学会第49回年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-16
  • [学会発表] X-ray structural analysis of F form intermediate of bovine cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      村本和優, 他
    • 学会等名
      日本生物物理学会第49回年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • 年月日
      2011-09-16
  • [学会発表] Structural changes of bovine cytochrome c oxidase dependent on the redox states2011

    • 著者名/発表者名
      村本和優, 他
    • 学会等名
      XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • 発表場所
      Madrid (Spain)
    • 年月日
      2011-08-23
  • [学会発表] High resolution analysis and anamolous dispersion analysis of bovine cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      矢野直峰, 他
    • 学会等名
      XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • 発表場所
      Madrid (Spain)
    • 年月日
      2011-08-23
  • [学会発表] High resolution structures of bovine cytochrome c oxidase in the resting oxidized and the reduced states2011

    • 著者名/発表者名
      村本和優, 他
    • 学会等名
      Gordon Research Conferences, Bioenergetics
    • 発表場所
      New Hampshire (USA)
    • 年月日
      2011-06-27
  • [学会発表] The O_2 reduction and protonpumping gate mechanisms of bovine heart cytochrome c oxidase2011

    • 著者名/発表者名
      吉川信也, 他
    • 学会等名
      Gordon Research Conferences, Bioenergetics
    • 発表場所
      New Hampshire (USA)
    • 年月日
      2011-06-27
  • [学会発表] ウシ心筋チトクロム酸化酵素還元型の1.4Å分解能X線構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      藤澤秀徳, 他
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急(大阪府)
    • 年月日
      2011-06-08
  • [学会発表] ウシ心筋チトクロム酸化酵素休止酸化型の1.4Å分解能X線構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      矢野直峰, 他
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急(大阪府)
    • 年月日
      2011-06-08
  • [学会発表] ウシ心筋チトクロム酸化酵素の還元・再酸化による構造変化2011

    • 著者名/発表者名
      村本和優, 他
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ホテル阪急(大阪府)
    • 年月日
      2011-06-07
  • [備考]

    • URL

      http://www.sci.u-hyogo.ac.jp/life/regulation/publication.html

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公開日: 2013-06-26  

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