リボソームの異常と疾患：新たな疾患「リボソーム病」発症の分子機構

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22370065
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 宮崎大学
• 研究代表者: 剣持 直哉 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (00133124)
• 連携研究者: 鈴木 勉 東京大学, 工学研究科, 教授 (20292782) ; 高柳 淳 慶應義塾大学, 医学部, 講師 (80245464)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2013-03-31
• キーワード: 翻訳 / リボソーム / 造血異常 / 発がん / ゼブラフィッシュ / 核小体 / p53 / リボソーム病

研究概要

リボソームはすべての生物に不可欠なタンパク質の合成工場である。最近、リボソームの異常が細胞のがん化や骨髄不全などの原因となる可能性が示された。本研究は、リボソームの異常に起因する「リボソーム病」発症の分子機構を解明することを目的とした。ゼブラフィッシュを用いた疾患モデルの解析により、リボソーム病発症に関わる重要な因子を同定した。また、研究推進に不可欠なデータベースの整備を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Ribosomal protein deficiency causes Tp53-independent erythropoiesis failure in zebrafish (2014)
  • 著者名/発表者名: Yadav V.G., Chakraborty A., Uechi T., and Kenmochi N.
  • 雑誌名: Int. J. Biochem. Cell Biol. 巻: 49 ページ: 1-7
  • DOI: 10.1016/j.biocel.2014.01.006
  • 査読あり
• [雑誌論文] snOPY : a small nucleolar RNA orthological gene database (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoshihama M., Nakao A., and Kenmochi N.
  • 雑誌名: BMC Research Notes 巻: 6 ページ: 426
  • DOI: 10.1186/1756-0500-6-426
  • 査読あり
• [雑誌論文] A detection method for intronic snoRNA genes using extended- weight-updating SOM with appearance probability of bases (2013)
  • 著者名/発表者名: Yamamori K., Matsuo T., Iwakiri J., Kenmochi N., and Yoshihara I.
  • 雑誌名: Artificial Life and Robotics 巻: 17 ページ: 405-411
  • DOI: 10.1007/s10015-012-0072-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] リボソーム病-リボソーム合成の異常と疾患- (2013)
  • 著者名/発表者名: 剣持直哉
  • 雑誌名: 生化学(リボソームの機能調節と疾患) 巻: 85 ページ: 909-915
• [雑誌論文] リボソームタンパク質と翻訳制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 上地珠代, 剣持直哉
  • 雑誌名: 生体の科学(細胞の分子構造と機能-核以外の細胞小器官) 巻: 63 ページ: 362-363
• [雑誌論文] Dissecting the protein-RNA interface : the role of protein surface shapes and RNA secondary structures in protein-RNA recognition (2012)
  • 著者名/発表者名: Iwakiri J., Tateishi H., Chakraborty A., Patil P., and Kenmochi N.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 40 ページ: 3299-3306
  • DOI: 10.1093/nar/gkr1225
  • 査読あり
• [雑誌論文] Loss of ribosomal RNA modification causes developmental defects in zebrafish (2012)
  • 著者名/発表者名: Higa-Nakamine S., Suzuki T., Uechi T., Chakraborty A., Nakajima Y., Nakamura M., Hirano N., Suzuki T., and Kenmochi N.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 40 ページ: 391-398
  • DOI: 10.1093/nar/gkr700
  • 査読あり
• [雑誌論文] The NPC motif of aquaporin-11, unlike the NPA motif of known aquaporins, is essential for full expression of molecular function (2011)
  • 著者名/発表者名: Ikeda M., Andoo A., Shimono M., Takamatsu N., Taki A., Muta K., Matsushita W., Uechi T., Matsuzaki T., Kenmochi N., Takata K., Sasaki S., Ito K., and Ishibashi K.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 286 ページ: 3342-3350
  • DOI: 10.1074/jbc.M110.180968
  • 査読あり
• [雑誌論文] Erythropoiesis failure due to RPS19 deficiency is independent of an activated p53 response in a zebrafish model of Diamond-Blackfan anaemia (2011)
  • 著者名/発表者名: Torihara H., Uechi U., Chakraborty A., Shinya M., Sakai N., and Kenmochi N.
  • 雑誌名: Brit. J. Haematol. 巻: 152 ページ: 648-654
  • DOI: 10.1111/j.1365-2141.2010.08535.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Guarding the 'translation apparatus': defective ribosome biogenesis and the p53 signaling pathway (2011)
  • 著者名/発表者名: Chakraborty A., Uechi T., and Kenmochi N.
  • 雑誌名: Wiley Interdiscip Rev RNA 巻: 2 ページ: 507-522
  • DOI: 10.1002/wrna.73
  • 査読あり
• [雑誌論文] リボソーム病と経路 (2011)
  • 著者名/発表者名: 剣持直哉
  • 雑誌名: 医学のあゆみ(RNA医学・医療) 巻: 238 ページ: 476-480
• [学会発表] Analyzing the zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia (2014)
  • 著者名/発表者名: Uechi T., Nakajima Y., Yadav G. H., Suzuki Y., Sugano S., and Kenmochi N.
  • 学会等名: The 13th Diamond Blackfan Anemia International Consensus Conference
  • 発表場所: Atlanta, USA
  • 年月日: 20140308-10
• [学会発表] Erythropoiesis failure and ribosomal dysfunction in zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia (2013)
  • 著者名/発表者名: Uechi T., Nakajima Y., Yadav G., Sawada T., Ikeda M., and Kenmochi N.
  • 学会等名: The 62nd Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
  • 発表場所: Boston, USA
  • 年月日: 20131022-26
• [学会発表] When p53 senses faulty ribosomes : Induction of Tp53 correlates with enhanced expression of c-Myc target nucleolar proteins in Rpl11-deficient zebrafish (2013)
  • 著者名/発表者名: Chakraborty A., Uechi T., Gleizes P.E., and Kenmochi N.
  • 学会等名: The 18th Annual Meeting of the RNA Society
  • 発表場所: Davos, Switzerland
  • 年月日: 20130611-16
• [学会発表] Loss of snoRNA expression leads to developmental defects in zebrafish (2013)
  • 著者名/発表者名: Kenmochi N., Higa-Nakamine S., Uechi T., Chakraborty A., Suzuki T., and Suzuki T.
  • 学会等名: Keystone symposia "Noncoding RNAs in Development and Cancer"
  • 発表場所: Vancouver, Canada
  • 年月日: 20130120-24
• [学会発表] Loss of ribosomal RNA modification causes developmental defects in zebrafish (2012)
  • 著者名/発表者名: Higa-Nakamine S., Uechi T., Chakraborty A., Suzuki T., Suzuki T., and Kenmochi N.
  • 学会等名: International Conference on Ribosome Synthesis
  • 発表場所: Banff, Canada
  • 年月日: 20120822-25
• [学会発表] Loss of snoRNA expression impairs ribosomal RNA modification and causes developmental defects in zebrafish (2012)
  • 著者名/発表者名: Kenmochi N., Higa-Nakamine S., Uechi T., Chakraborty A., Nakajima Y., Suzuki T., and Suzuki T.
  • 学会等名: Keystone symposia"Protein-RNA Interactions in Biology and Disease"
  • 発表場所: Santa Fe, USA
  • 年月日: 20120304-08
• [図書] Ribosomes and ribosomal proteins : more than just 'housekeeping' (2012)
  • 著者名/発表者名: Chakraborty A., and Kenmochi N.
  • 出版者: In : eLS. John Wiley & Sons Ltd, Chichester.
• [備考] リボソームタンパク質遺伝子データベース(RPG)
  • URL: http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/
• [備考] snoRNA遺伝子データベース(snOPY)
  • URL: http://snoopy.med.miyazaki-u.ac.jp/
• [備考] ゼブラフィッシュRP遺伝子ノックダウンデータベース
  • URL: http://zebrafish.med.miyazaki-u.ac.jp/
• [備考] 研究室ホームページ
  • URL: http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/labo/
• [産業財産権] 抗RNA抗体のスクリーニング方法及びRNA抗体の製造方法 (2011)
  • 発明者名: 剣持直哉,吉浜麻生,高柳淳,清水信義
  • 権利者名: 宮崎大学,慶慮義塾大学
  • 産業財産権番号: 特願2011-098698
  • 出願年月日: 2011-04-26