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2011 年度 実績報告書

オセアニア集団における肥満・脂質代謝・糖代謝関連変異の探索と倹約遺伝子仮説の検証

研究課題

研究課題/領域番号 22370084
研究機関筑波大学

研究代表者

大橋 順  筑波大学, 医学医療系, 准教授 (80301141)

研究分担者 木村 亮介  琉球大学, 亜熱帯島嶼科学超域研究推進機構, 特命准教授 (00453712)
西田 奈央  国立国際医療研究センター, 肝炎免疫研究センター, 上級研究員 (50456109)
中山 一大  自治医科大学, 医学部, 助教 (90433581)
キーワードオセアニア / 肥満 / 多型 / 倹約遺伝子仮説
研究概要

(1)進化遺伝学的解析手法の開発と、関連解析候補SNPの絞り込み
HUGO Pan-Asian SNP Consortiumによって得られたアジア人集団の個体遺伝子型データと、我々のオセアニア人集団の個体遺伝子型データ(800名)に対し、連鎖不平衡にあるSNPについてはその代表値を選び出しながら、肥満・脂質代謝・糖代謝との関連が想起される遺伝子の中で、アジア人集団とオセアニア人集団間において、顕著に分化している遺伝子(SNP)を探索した。
(2)SNPタイピング
オセアニア集団約800検体について、TaqManアッセイおよびDigiTag2アッセイを用いて、(1)よりえられた候補SNPのタイピングを施行した。
(3)肥満・脂質代謝・糖代謝との関連解析
(2)によってタイピングされたSNPについて、オセアニア人集団を対象に重回帰分析、ロジスティック回帰分析、共分散分析などを用いて、肥満・脂質代謝・糖代謝との関連解析を行った。
(4)絞り込まれたSNPの周辺SNPのタイピング
(3)において、有意な関連がみられたSNPの周辺に存在するタグSNPのタイピングを行った。現在は全体の5割程度が終了している。
(5)アジア人集団を対象にしだ関連解析
(4)で、肥満・脂質代謝・糖代謝との関連が検出された8個のSNPについて、日本人集団(600名)、およびモンゴル人集団(950名)において、関連解析を行い、関連の再現性を確認した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

絞り込んだ候補SNP周辺の再配列解析を除いてほぼ計画通りに実行できたため。

今後の研究の推進方策

肥満との有意な関連が見いだされたADRB2多型の機能解析を進めるとともに、ADRB2分子が働くパスウェイ上の遺伝子についても関連解析を行う。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] DRD4 VNTR polymorphism in Oceanic populations2012

    • 著者名/発表者名
      Naka, et al.
    • 雑誌名

      Anthropological Science

      巻: (In press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Extended Haplotype Homozygosity (EHH)を用いる正の自然選択検出法の検出力比較2012

    • 著者名/発表者名
      大橋順
    • 雑誌名

      統計数理

      巻: (In press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] No evidence for strong recent positive selection favoring the 7 repeat allele of VNTR in the DRD4 gene2011

    • 著者名/発表者名
      Naka, et al.
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 6

    • DOI

      doi:10.1371/journal.pone.0024410

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Testing the thrifty gene hypothesis : the Gly482Ser variant in PPARGC1A is associated with BMI in Tongans2011

    • 著者名/発表者名
      Myles, et al.
    • 雑誌名

      BMC Medical Genetics

      巻: 12

    • DOI

      doi:10.1186/1471-2350-12-10

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Serum Leptin Level and Body Mass Index in Melanesian and Micronesian Solomon Islanders : Focus on Genetic Factors and Urbanization2011

    • 著者名/発表者名
      Furusawa, et al.
    • 雑誌名

      American Journal of Human Biology

      巻: 23 ページ: 435-444

    • DOI

      DOI:10.1002/ajhb.21124

    • 査読あり
  • [学会発表] オセアニア集団におけるDRD4遺伝子VNTR多型の解析2011

    • 著者名/発表者名
      中伊津美, ほか
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会
    • 発表場所
      幕張、千葉
    • 年月日
      2011-11-11
  • [学会発表] オセアニア集団におけるβアドレナリン受容体プロモーター多型と肥満との関連2011

    • 著者名/発表者名
      中伊津美, ほか
    • 学会等名
      日本人類学会
    • 発表場所
      那覇、沖縄
    • 年月日
      2011-11-04
  • [学会発表] Significant association of ADRB2 Glu27Gln polymorphism with triglyceride level2011

    • 著者名/発表者名
      Naka I, et al.
    • 学会等名
      American Society of Human Genetics
    • 発表場所
      Montreal, Canada
    • 年月日
      2011-10-14
  • [備考]

    • URL

      http://www.md.tsukuba.ac.jp/community-med/publicmd/GE/CCP004.html

URL: 

公開日: 2013-06-26  

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