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2011 年度 実績報告書

イネ属ゲノムに取り込まれたウイルス配列の機能探索?イネツングロ病に着目して?

研究課題

研究課題/領域番号 22380001
研究機関北海道大学

研究代表者

貴島 祐治  北海道大学, 大学院・農学研究院, 教授 (60192556)

キーワードイネ / イネツングロ病 / RTBV / ERTBV / ジャポニカ / インディカ / Oryza glaberrima / AT連続配列
研究概要

平成23年度はイネ系統間のERTBVの多型検出とERTBVの多型に基づくツングロ病抵抗性の評価を行うことを計画し、以下のような成果をえた。
1.ジャポニカ稲(日本晴)のゲノムDNA配列を利用して、88サイトと特定されたERTBVの有無を区別できる52セットのPCRマーカーを作製した。
2.上記52のERTBVマーカーを用いてジャポニカ稲4系統、インディカ稲3系統、ルフィポーゴン(野生イネ)稲3系統、合計10系統を対象にPCRを行った。その中で22個のマーカーがジャポニカ稲とインディカ稲系統全てでERTBVの挿入が検出され、30個はジャポニカ稲特異的なマーカーであった。従って、ERTBVはイネの種分化以前から分化後に渡ってイネゲノムに挿入されたことを示唆するデータを得た。
3.前年度までに九州大学と共同でO.glaberrima系統とジャポニカ系統の間で3回戻し交配自殖系統BC_3F_2集団を作製した。国際イネ研究所(IRRI)Choi博士のもとでこれらの系統に対するツングロウイルス(RTSV/RTBV)感染実験を行い、ウイルスの病徴を評価した。
4.上記で得られたデータは、病徴の程度に応じて評価された。親系統のジャポニカ稲(T65)系統は、ツングロウイルスの感染に対してmildな病徴を示すのに対して、O.glaberrima IRGC103777系統はsevereな病徴を示す。T65とIRGC103777それぞれを反復親にした2つのBC_3F_2集団では、予想通りT65を反復親にした集団では相対的に強い個体が多く、IRGC103777を反復親に持つ集団では、多くが顕著に弱い傾向にあり、ツングロ病の病徴とERTBVのコピー数と関連する可能性も示唆された。しかし、T65を反復親にした集団の中にも、顕著に弱い個体が出現することや,IRGC103777を反復親に持つ集団でも強い個体が現れるなど、単純にはコピー数だけで説明できない結果であった。そこで、各ERTBV断片と病徴との関連性をQTL解析法で調査したところ、特定の断片とRTBVのウイルスの増殖との相関を得た。相関を示唆する断片は複数あるが、今後、これらに着目してツングロ病抵抗性との関係を調査して行く予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

九州大学と共同で作成したO.galberrima系統とジャポニカ系統の間のBC_3F_2集団を利用して、RTBVの感染実験から特定のERTBV断片を持つ系統にウイルス抵抗性を示す傾向が得られたことは、当初の目的以上の成果といえる。

今後の研究の推進方策

1.Oryza属におけるERTBVの起源の特定からRTBVの病原発生地域を推定する。これは、当該ウイルス病の耐性系統を探索するために今後重要となる。
2.ジャポニカの持つ基本的なツングロ病への抵抗性とERTBVの関連性を平成23年度に得られた成果をもとに具体的に検証する。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (1件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] An apple atp9 pseudogene is maintained at high copy number in 'Golden Delicious'-type mitochondria but is present substoichiometr ically in 'Delicious'-type mitochondria2012

    • 著者名/発表者名
      S.Kato, K.Kitazaki, A.Wakatsuki, Y.Kishima, T.Mikami
    • 雑誌名

      Scientia Horticulturae

      巻: 134 ページ: 237-240

    • DOI

      10.1016/j.scienta.2011.10.030

    • 査読あり
  • [雑誌論文] An intact mitochondrial cox1 gene and a pseudogene with different genomic configurations are present in apple cultivars 'Golden Delicious' and 'Delicious' : Evolutionary aspects2011

    • 著者名/発表者名
      A.Wakatsuki, K.Kitazaki, S.Kato, Y.Kishima, T.Mikami
    • 雑誌名

      Scientia Horticulturae

      巻: 130 ページ: 49-53

    • DOI

      10.1016/j.scienta.2011.05.037

    • 査読あり
  • [学会発表] イネゲノム反復配列の発現パターンから見た雄性生殖器官の特徴化2011

    • 著者名/発表者名
      貴島祐治, 石黒聖也, 太田雄也, 佐藤裕
    • 学会等名
      第83回日本遺伝学会シンポジウム
    • 発表場所
      京都大学農学部(京都府)(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-20
  • [図書] 植物育種学第4版 第2章1.遺伝子と形質発現 4.生殖様式と近交弱性2012

    • 著者名/発表者名
      貴島祐治
    • 総ページ数
      288
    • 出版者
      文永堂出版
  • [図書] 「植物の分子育種学」第5章トランスポゾンタギング2011

    • 著者名/発表者名
      貴島祐治
    • 総ページ数
      205
    • 出版者
      講談社

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公開日: 2013-06-26  

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