イネ属ゲノムに取り込まれたウイルス配列の機能探索イネツングロ病に着目して

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22380001
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 育種学
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 貴島 祐治 北海道大学, 大学院・農学研究院, 教授 (60192556)
• 連携研究者: 小柳 香奈子 北海道大学, 大学院・情報科学研究科, 准教授 (20362840) ; 安井 秀 九州大学, 大学院・農学研究院, 准教授 (70220142)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: イネ / ゲノム科学 / 耐病性

研究概要

ネゲノムに見いだされる内在性RTBVウイルス配列(ERTBV配列)を日本型日本晴系統やインド型93-11系統で特定し、それらの挿入機構やツングロ病との耐性機構について解析した。ERTBVはゲノムの中のATが連続している領域に挿入する傾向が高く、AT連続配列は外来からDNA断片を取り込む可能性が強く示唆された。また、アフリカイネ系統のWK18と日本型台中65の交雑後代で、イネ染色体5番にRTBV抵抗性を示す遺伝子領域qTDR5を見いだした。qTDR5の中にはERTBVが1箇所含まれている。

研究成果

• [雑誌論文] イネゲノムの反復配列に基づく低温鈍感力の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 石黒聖也,佐藤裕,貴島祐治
  • 雑誌名: 日本草地学会誌 巻: 59 ページ: 60-63
• [雑誌論文] イネのゲノム中のAT反復配列は種々のDNAを取り込む進化の原動力 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小柳香奈子,劉瑞芳,陳孫禄,水野美登利,貴島祐治
  • 雑誌名: 日本草地学会誌 巻: 59 ページ: 55-59
• [雑誌論文] A pair of transposons coordinately suppresses gene expression, independent of pathways mediated by siRNA in Antirrhinum (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Uchiyama, S. Hiura, I. Ebinuma, M. Senda, T. Mikami, C. Martin and Y. Kishima
  • 雑誌名: New Phytologist 巻: 197 ページ: 431-440
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary force of AT-rich repeats to trap genomic and episomal DNAs in the rice genome: lessons from endogenous pararetrovirus (2012)
  • 著者名/発表者名: R. Liu, K.O. Koyanagi, S. Chen and Y. Kishima
  • 雑誌名: The Plant Journal 巻: 72 ページ: 817-828
  • 査読あり
• [雑誌論文] An apple atp9 pseudogene is maintained at high copy number in 'Golden Delicious' -type mitochondria but is present substoichiometrically in 'Delicious'-type mitochondria (2012)
  • 著者名/発表者名: S. Kato, K. Kitazaki, A. Wakatsuki, Y. Kishima and T. Mikami
  • 雑誌名: Scientia Horticulturae 巻: 134 ページ: 237-240
  • 査読あり
• [雑誌論文] An intact mitochondrial cox1 gene and a pseudogene with different genomic configurations are present in apple cultivars 'Golden Delicious' and 'Delicious': Evolutionary aspects (2011)
  • 著者名/発表者名: A. Wakatsuki, K. Kitazaki, S. Kato, Y. Kishima and T. Mikami
  • 雑誌名: Scientia Horticulturae 巻: 130 ページ: 49-53
  • 査読あり
• [雑誌論文] Temperature controls nuclear import of Tam3 transposase in Antirrhinum (2011)
  • 著者名/発表者名: K. Fujino, SN. Hashida, T. Ogawa, T. Natsume, T. Uchiyama, T. Mikami and Y. Kishima
  • 雑誌名: The Plant Journal 巻: 65 ページ: 146-155
  • 査読あり
• [雑誌論文] トランスポゾンを指標にしたコシヒカリ品種内の遺伝的差異 (2010)
  • 著者名/発表者名: 貴島祐治、堀田夕夏、石黒聖也、山村和照、塙章、内藤聡、佐野芳雄
  • 雑誌名: 育種学研究 巻: 12 ページ: 81-86
  • 査読あり
• [学会発表] The comparative analyses on the seed performances in the rice hybrids with different combinations (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuya Ota, Kei Ogasawara and Yuji Kishima
  • 学会等名: XVth Meeting of the EUCARPIA Sction -Biometrics in Plant Breeding- Stuttgart-Hohenheim Germany
  • 年月日: 20120905-07
• [学会発表] Evaluation of Genome-wide expression against the coolstress at the rice booting stage (2012)
  • 著者名/発表者名: Seiya Ishiguro, Kei Ogasawara, Yutaka Sato and Yuji Kishima
  • 学会等名: XVth Meeting of the EUCARPIA Sction -Biometrics in Plant Breeding- Stuttgart-Hohenheim Germany
  • 年月日: 20120905-07
• [学会発表] イネゲノムの反復配列に基づく低温鈍感力の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 貴島祐治
  • 学会等名: 日本草地学会北海道大会企画シンポジウム2
  • 発表場所: 酪農学園大学北海道江別市
  • 年月日: 20120905-07
• [学会発表] ゲノムにウイルス断片を持つイネ系統のウイルス抵抗性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 貴島祐治
  • 学会等名: 日本育種学会2012年秋季大会ワークショップ
  • 発表場所: 京都産業大学
  • 年月日: 2012-09-14
• [学会発表] Transcriptions of repeat sequences at boot stage in rice anther and its expression changes induced by low-temperature. (2011)
  • 著者名/発表者名: Seiya Ishiguro, Yutaka Sato and Yuji Kishima
  • 学会等名: 9International Plant Cold Hardiness Seminar
  • 発表場所: Abbey of Neumunster, Luxembourg
  • 年月日: 20110717-22
• [学会発表] Temperature-dependent nuclear import of Tam3 transposase in Antirrhinum. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kaien Fujino, Takashi Ogawa, Tomoko Natsume and Yuji Kishima
  • 学会等名: 9International Plant Cold Hardiness Seminar
  • 発表場所: Abbey of Neumunster, Luxembourg, Luxembourg
  • 年月日: 20110717-22
• [学会発表] イネゲノム反復配列の発現パターンから見た雄性生殖器官の特徴化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 貴島祐治,石黒聖也,太田雄也,佐藤裕
  • 学会等名: 第83回日本遺伝学会シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学農学部京都市
  • 年月日: 2011-09-20
• [学会発表] Genomic properties of endogenous rice tungro bacilliform virus sequences in the rice genomes. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yuji Kishima
  • 学会等名: IRRI Special Seminer, International Rice Research Institute
  • 発表場所: Philippines
  • 年月日: 2011-03-01
• [学会発表] The structural properties of endogenous rice tungro bacilliform virus sequences in the rice genome. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ruifang Liu, Kanako O. Koyanagi and Yuji Kishima
  • 学会等名: 3 International Rice Congress
  • 発表場所: National Convention Center, Hanoi, Vietnam
  • 年月日: 20101108-12
• [備考]
  • URL: http://www.agr.hokudai.ac.jp/rfoa/abs/abs1-2.html