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2012 年度 研究成果報告書

ゲノミックセレクションを活用した革新的作物育種システムの構築

研究課題

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研究課題/領域番号 22380010
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 育種学
研究機関東京大学

研究代表者

岩田 洋佳  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 准教授 (00355489)

研究分担者 江花 薫子  独立行政法人農業生物資源研究所, 遺伝資源センター多様性活用研究ユニット, 主任研究員 (00370643)
林 武司  独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 中央農業総合研究センター, 上席研究員 (70370674)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
キーワード植物育種 / 遺伝 / ゲノム育種 / ゲノミックセレクション / 量的遺伝子座(QTL) / 一塩基多型(SNP) / 育種シミュレーション
研究概要

ゲノムワイドマーカーをもとに個体や系統の遺伝的能力を予測して選抜するゲノミックセレクション(GS)について、(1)モデリング手法の開発、(2)イネ品種・系統における実データの収集・解析、(3)育種シミュレーションを行い、それを活用した作物育種効率化の可能性を検討した。(1)では、複数形質の同時予測、交配後代の分離の予測、遺伝子型×環境交互作用パターンの予測のための手法開発を行った。(2)では、イネ遺伝資源についてゲノムワイドSNPデータを収集するとともに、それを利用して様々なタイプの形質の予測精度を明らかにした。(3)では、他殖性植物と自殖性植物を想定したシミュレーションをそれぞれ行った。研究の結果、ゲノム情報に基づく予測のための種々の手法が開発された。また、作物育種に適したGSの利用形態を明らかにできた。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2013 2011

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Potential of genomic selection for mass selection breeding in annual allogamous crops2013

    • 著者名/発表者名
      Yabe S, Ohsawa R, Iwata H
    • 雑誌名

      Crop Science

      巻: 53 ページ: 95-105

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Bayesian methodand its variational approximation for prediction of genomic breeding values in multiple traits2013

    • 著者名/発表者名
      Hayashi T, Iwata H
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 14 ページ: 34

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Potential assessment of genome- wide association study and genomic selection in Japanese pear Pyrus pyrifolia2013

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Terakami S, TakadaN, Sawamura Y, Yamamoto T
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 63 ページ: 125-140

  • [雑誌論文] Accuracy of genomic selection prediction in barley breeding programs: a simulation study based on the real SNP data of barley breeding lines2011

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Jannink JL
    • 雑誌名

      Crop Science

      巻: 51 ページ: 1915-1927

    • 査読あり
  • [学会発表] Genomic prediction of trait segregation in progeny populations: examples in Japanese pear and rice2013

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Yoshioka T, Yamasaki M, Ebana K, Terakami S, Takada N, Saito T, Yamamoto T
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XXI
    • 発表場所
      アメリカ合衆国、サンディエゴ
    • 年月日
      20130112-0116
  • [学会発表] Integration of Genomics and Morphometrics Approaches Toward Systematic Plant Shape Improvement2011

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Ebana K, Uga Y, Hayashi T
    • 学会等名
      2nd ISBSA
    • 発表場所
      沖縄県男 女共同参画センターてぃるる(沖縄県)
    • 年月日
      2011-09-09
  • [学会発表] Non-MCMC methods for effective Bayesian analysis of high-dimensional genomic data2011

    • 著者名/発表者名
      Hayashi T, Iwata H
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XIX
    • 発表場所
      アメリカ合衆国、サンディエゴ
    • 年月日
      2011-01-16

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公開日: 2014-08-29   更新日: 2015-10-06  

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