多系交雑集団を用いたゲノミックセレクション法の開発と実証

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22380011
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 育種学
• 研究機関: 公益財団法人かずさDNA 研究所 (2012); 公益財団法人かずさDNA研究所 (2010-2011)
• 研究代表者: 磯部 祥子 公益財団法人かずさDNA 研究所, 植物ゲノ厶研究部, 室長 (20343973)
• 研究分担者: 中谷 明弘 新潟大学, 推進機構超域学術院 (60301149)
• 連携研究者: 白澤 健太 (公財)かずさDNA研究所, 植物ゲノム研究部, 研究員 (60527026)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: 植物分子育種 / 他殖性

研究概要

多型交配集団を用いることで、親子関係のない系統間では有意な連鎖不平衡の距離が極めて短いアカクローバにおいても数百程度のマーカーでGenomics Selectionを行えることが実証できた。また、育種集団の選抜時において限られたマーカー数で選抜を行うことができるEGGS法を新たに開発することができた。

研究成果

• [雑誌論文] Will genomic selection be a practical method for plant breeding? (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakaya A and Isobe S
  • 雑誌名: Annals of Botany 巻: 110 ページ: 1303-1316
• [学会発表] Genomic selection in red clover: issues and solutions (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakaya A, Sharma TR, Boller B, Klimenko I, Kolliker R, Rana JC, Shirasawa K, Hirakawa H, Sato S, Tabata S, and Isobe S
  • 学会等名: Plant & Animal Genome XXI
  • 発表場所: SanDiego, USA
  • 年月日: 20130000
• [学会発表] EGGS: A novel approach for identification of optimum DNA markers sets for MAS (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakaya A, Sharma TR, Boller B, Klimenko I, Kolliker R, Rana JC, Shirasawa K, Hirakawa H, Sato S, Tabata S, and Isobe S
  • 学会等名: GPGR3
  • 発表場所: Juju, Korea
  • 年月日: 20130000
• [学会発表] 赤クローバ量的形質のゲノミック選抜に向けた表現型予測のブースト手法 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中谷明弘ら
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 年月日: 20120900
• [学会発表] QTL identification for agronomic traits using an AIL-like population in red clover (2012)
  • 著者名/発表者名: Isobe S, Boller B, Klimenko I, Kolliker S, Rana JC, Sharma TR, Shirasawa K, Hirakawa H, Sato Sand Tabata S
  • 学会等名: The 4th Japan-China-Korea Glassland Conference
  • 発表場所: Aichi, Japan
  • 年月日: 20120000
• [学会発表] Identification of optimum DNA markers sets for MAS in red clover with a novel approach based on `Adaboost' algorithm (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakaya A, Sharma TR, Boller B, Klimenko I, Kolliker R, Rana JC, Shirasawa K, Hirakawa H, Sato S, Tabata S, and Isobe S
  • 学会等名: VI International Conference on Legume Genetics and Genomics
  • 発表場所: Hyderabad, India
  • 年月日: 20120000
• [学会発表] Genome-wide SNP marker development and QTL identification for genomic selection in red clover (2011)
  • 著者名/発表者名: Isobe S, Boller B, Klimenko I, Kolliker S, Rana JC, Sharma TR, Shirasawa K,Hirakawa H, Sato Sand Tabata S
  • 学会等名: The 29th EUCARPIA Fodder Crops and Amenity Grass Section meeting
  • 発表場所: Dublin, Ireland
  • 年月日: 20110000
• [学会発表] Getting across the Devil river in the Legume land (2010)
  • 著者名/発表者名: Isobe S, Shirasawa K, Sato S, Hira kawa H, Koilkonda P and Tabata S
  • 学会等名: Vth Internati onal Conference on Legume Genetics and Genomics
  • 発表場所: Ahilomar, CA, USA
  • 年月日: 20100000
• [図書] Genome-wide SNP marker development and QTL identification for genomic selection in red clover. (2012) In: Breeding strategies for sustainable forage and turf grass improvement (2012)
  • 著者名/発表者名: Isobe S, Boller B , Klimenko I, Kolliker S, Rana JC, Sharma TR, Shirasawa K, Hirakawa H, Sato S and Tabata S
  • 出版者: Barth S, Milbourne D (ed). Springer
  • URL: DOI 10.1007/978-94-007-4555-1