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2010 年度 実績報告書

バキュロウイルスをモデルとした長鎖非コードRNAの機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 22380033
研究機関東京大学

研究代表者

勝間 進  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 准教授 (20378863)

キーワードバキュロウイルス / 昆虫 / 非コードRNA / 発現制御 / 遺伝子 / 転写 / 昆虫ウイルス / ウイルス
研究概要

昆虫ウイルスの一種であるバキュロウイルスは、100kbp以上の2本鎖DNAをゲノムとして持つ大型のDNAウイルスであり、高度な宿主制御を行うことが知られている。バキュロウイルスゲノムには100個以上のタンパク質コード遺伝子が存在するが、非コードRNAの存在は知られていない。申請者は、ウイルス感染培養細胞のトランスクリプトーム解析によって、既報のORFをコードしない長鎖非コードRNAがウイルスゲノムから転写されている可能性を見いだしていた。今年度は、まず、ウイルス感染培養細胞から作成した完全長cDNAライブラリーのランダムシークエンシングから得られた5',3'端各約10,000クローンをウイルスゲノムにマップし、4679個の転写ユニットを同定した。また、ゲノム上に存在する後期遺伝子転写モチーフ(TAAG)のうち70%程度は実際に使用されていることを明らかにした。さらに、転写ユニットのなかには、50~100種の長鎖非コードRNAと思われる転写産物が存在した。そのうちの一部は、遺伝子ORFの5'端にクラスターをなしてマップされたことから、ORFの転写制御に何らかの役割を果たしていると考えられた(Katsuma et al., 2011, Journal of General Virology)。現在、非コードRNAだと考えられる転写物のプロモーターを欠損した組換えウイルスを作成中である。今後、それらのウイルスの性状を調べることで、ウイルスの長鎖非コードRNAの機能を知ることができると考えている。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (7件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Role of the ubiquitin-proteasome system in Bombyx mori nucleopolyhedrovirus infection2011

    • 著者名/発表者名
      Katsuma S, Tsuchida A, Imai-Matsuda N, Kang W-K, and Shimada T
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 92 ページ: 699-705

    • DOI

      DOI:10.1099/vir.0.027573-0

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mass identification of transcriptional units expressed from the Bombyx mori nucleopolyhedrovirus genome2011

    • 著者名/発表者名
      Katsuma S, Kang W-K, Shin-i T, Ohishi K, Kadota K, Kohara Y, and Shimada T
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 92 ページ: 200-203

    • DOI

      DOI:10.1099/vir.0.025908-0

    • 査読あり
  • [雑誌論文] BmDJ-1 is a key regulator for the developmental oxidative modification of the silkworm, Bombyx mori2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroko Tabunoki
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 6(掲載確定)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of a Bombyx mori nucleopolyhedrovirus mutant lacking both fp25K and p352010

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi T, Shimada T, and Katsuma S
    • 雑誌名

      Virus Genes

      巻: 41 ページ: 144-148

    • DOI

      DOI:10.1007/s11262-010-0492-5

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hsc70/Hsp9O chaperone machinery mediates ATP-dependent RISC loading of small RNA duplexes2010

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Iwasaki
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 39 ページ: 292-299

    • 査読あり
  • [学会発表] バキュロウイルスによる宿主行動制御におけるPTPタンパク質の役割2010

    • 著者名/発表者名
      小谷野泰枝
    • 学会等名
      第9回昆虫病理研究会シンポジウム・第16回BT研究会
    • 発表場所
      財団法人人材開発センター富士研修所
    • 年月日
      20100923-20100925
  • [学会発表] BmNPVの宿主行動制御におけるpolh領域の役割2010

    • 著者名/発表者名
      國生龍平
    • 学会等名
      第9回昆虫病理研究会シンポジウム・第16回BT研究会
    • 発表場所
      財団法人人材開発センター富士研修所
    • 年月日
      20100923-20100925
  • [学会発表] バキュロウイルス感染におけるユビキチン・プロテアソーム経路の役割2010

    • 著者名/発表者名
      土田歩未
    • 学会等名
      第9回昆虫病理研究会シンポジウム・第16回BT研究会
    • 発表場所
      財団法人人材開発センター富士研修所
    • 年月日
      20100923-20100925
  • [学会発表] エクジソン糖転移酵素はカイコ個体におけるウイルス増殖部位の決定に関与する2010

    • 著者名/発表者名
      勝間進
    • 学会等名
      日本蚕糸学会第80回記念大会
    • 発表場所
      信州大学繊維学部
    • 年月日
      20100403-20100404
  • [学会発表] バキュロウイルス感染におけるユビキチン・プロテアソーム経路の役割2010

    • 著者名/発表者名
      土田歩未
    • 学会等名
      日本蚕糸学会第80回記念大会
    • 発表場所
      信州大学繊維学部
    • 年月日
      20100403-20100404
  • [学会発表] Baculoviruses control host physiology and behavior by captured cellular homologs2010

    • 著者名/発表者名
      勝間進
    • 学会等名
      Silkworm Genome Symposium-New Silk Road : Silkworm Genome to Sustainable Agriculture
    • 発表場所
      Tsukuba Center for Institutes
    • 年月日
      2010-11-09
  • [学会発表] 昆虫ウイルスの巧みな宿主制御戦略2010

    • 著者名/発表者名
      勝間進
    • 学会等名
      日本昆虫科学連合設立記念・日本学術会議公開シンポジウム「新時代の昆虫科学を拓く」
    • 発表場所
      日本学術会議講堂
    • 年月日
      2010-07-24
  • [備考]

    • URL

      http://papilio.ab.a.u-tokyo.ac.jp./igb/index-J.html

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公開日: 2012-07-19  

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