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2011 年度 実績報告書

消化器癌の網羅的DNAメチル化解析による癌症例層別化

研究課題

研究課題/領域番号 22390255
研究機関東京大学

研究代表者

金田 篤志  東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任准教授 (10313024)

キーワード癌 / エピゲノム / エピジェネティクス / マイクロアレイ / 次世代シーケンサー / 情報工学
研究概要

DNAメチル化異常を詳細にゲノム上にマッピングし癌のエピゲノム異常を解明し消化器癌症例を層別化することは、癌の複雑な遺伝子制御異常を明らかにするために必須である。大腸癌は3つの異なるメチル化エピジェノタイプに分類されるが(Yagi et al.Clin Cancer Res 2010)、今年度は前癌病変として大腸腺腫、大腸異常腺窩、さらに大腸正常粘膜について定量解析を終えた。大腸癌で認められた高メチル化群とBRAF変異の相関関係は鋸歯状腺腫に認められ、鋸歯状腺腫が高メチル化群大腸癌の前癌病変と思われた。従来型の非鋸歯状腺腫が、中メチル化群と低メチル化群の2群に分類される事、中メチル化群とKRAS変異の相関関係はすでに構築されていることを同定しメチル化エピジェノタイプは腺腫の段階で完成していた(Yagi et al.Am J Pathol,2012)。正常線維芽細胞でRas遺伝子を活性化させ早期細胞老化を誘導するとヒストン修飾がダイナミックに協調的に変化しBmp2-Smad1シグナルが活性化することが重要であることを同定し、Bmp2-Smad1シグナルおよびその下流標的遺伝子がメチル化異常により破綻することがRas陽性癌の発癌機構の一つとして考えられた(Kaneda et al.PLoS Genet 2011)。胃癌のメチル化解析はInfiniumビーズアレイを用いて行った。胃癌は低メチル化群、高メチル化群、超高メチル化群の3群にクラスターされ、超高メチル化群は全てEBウィルス胃癌であった。低メチル化群の胃癌細胞株にEBウィルスを感染させると異常メチル化が誘導されて超高メチル化群を呈した。EBウィルス感染そのものが超高メチル化群の原因であることを証明した
(Matsusaka et al.CancerRes,2011)。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

先行していた大腸癌については前癌病変に関してエピジェノタイピング解析が順調に進行し、発癌機構としてRas誘導性細胞老化の重要な機構がメチル化異常により破綻していると考える研究が順調に進行。さらに、昨年度の肝癌に加えて胃癌のエピジェノタイピング解析も順調に進行。いずれも論文発表まで行った。

今後の研究の推進方策

大腸癌はさらに前癌病変検体を増やして解析を進め、また臨床応用可能なマーカーの樹立を目指す。胃癌についてはEBウィルスによる異常メチル化誘導の解析を進める。いずれも特に問題点はない。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (8件) 図書 (1件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Intermediate methylation epigenotype and its correlation to KRAS mutation in conventional colorectal adenoma2012

    • 著者名/発表者名
      Yagi, K., Takahashi, H., Akagi, K., Matsusaka, K., Seto, Y., Aburatani, H., Nakajima, A., and Kaneda, A.†
    • 雑誌名

      Am. J. Pathol.

      巻: 180 ページ: 616-625

    • DOI

      doi.org/10.1016/j.ajpath.2011.10.010

  • [雑誌論文] がんエビゲノムマーカー2012

    • 著者名/発表者名
      金田篤志
    • 雑誌名

      日本臨床

      巻: (In press)(掲載確定)

  • [雑誌論文] DNA methylation epigenotype specific to Epstein-Barr virus-positive gastric cancer, and its induction in gastric cancer cell by Epstein-Barr virus infection2011

    • 著者名/発表者名
      Matsusaka K, Kaneda A, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Res

      巻: 71 ページ: 7187-7197

    • DOI

      doi:10.1158/0008-5472.CAN-11-1349

    • 査読あり
  • [雑誌論文] HCCとエビゲノム2011

    • 著者名/発表者名
      金田篤志
    • 雑誌名

      肝胆膵

      巻: 62 ページ: 933-943

  • [雑誌論文] がんのエビゲノム異常2011

    • 著者名/発表者名
      金田篤志
    • 雑誌名

      細胞

      巻: 43 ページ: 504-507

  • [学会発表] DNA Methylation Profiling of Papillary and Follicular Thyroid Cancer2011

    • 著者名/発表者名
      Yasuko Kikuchi, Atsushi Kaneda, et al.
    • 学会等名
      第70回日本癌学会総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      20111003-20111005
  • [学会発表] PRC2 overexpression and H3K27me3 modification in small cell lung cancer2011

    • 著者名/発表者名
      Teruyuki Sato, Atsushi Kaneda, et al.
    • 学会等名
      第70回日本癌学会総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-04
  • [学会発表] Markedly high methylation epigenotype identified in EB virus(+) gastric cancer and its induction by EB virus infection2011

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Matsusaka, Atsushi Kaneda
    • 学会等名
      第70回日本癌学会総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-03
  • [学会発表] Decoding the genome and transcriptome of human pancreatic cancer by integrated next-generation sequencing technologies2011

    • 著者名/発表者名
      Linghua Wang, Atsushi Kaneda, et al.
    • 学会等名
      第70回日本癌学会総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-03
  • [学会発表] Development of DNA methylation epigenotypes and their correlation to oncogene mutation in colorectal adenoma2011

    • 著者名/発表者名
      Koichi Yagi, Atsushi Kaneda, et al.
    • 学会等名
      第70回日本癌学会総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-03
  • [学会発表] Epigenomic profiling of oral cancer2011

    • 著者名/発表者名
      Sayaka Yoshiba, Atsushi Kaneda, et al.
    • 学会等名
      第70回日本癌学会総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-03
  • [学会発表] 大腸癌前癌病変におけるDNAメチル化エピジェノタイプ2011

    • 著者名/発表者名
      八木浩一、金田篤志, ら
    • 学会等名
      第5回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      熊本
    • 年月日
      2011-05-19
  • [学会発表] 甲状腺乳頭癌、濾胞癌におけるエピジェネティック変異に関する検討2011

    • 著者名/発表者名
      菊池弥寿子、金田篤志, ら
    • 学会等名
      第5回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      熊本
    • 年月日
      2011-05-19
  • [図書] Cancer classification by genome-wide and quantitative DNA methylation analyses. In "Epigenomics From Chromatin Biology to Therapeutics"(Krishnarao Appasani Ed.)2012

    • 著者名/発表者名
      Kaneda A
    • 総ページ数
      293-305
    • 出版者
      Cambridge University Press
  • [備考]

    • URL

      http://www.genome.rcast.u-tokyo.ac.jp/

  • [産業財産権] 特許2010

    • 発明者名
      金田篤志, ら
    • 権利者名
      東京大学, など
    • 産業財産権番号
      PCT/JP2010/061164
    • 出願年月日
      2010-06-30
    • 外国

URL: 

公開日: 2013-06-26  

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