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2012 年度 研究成果報告書

アジアを席巻する新変異型、新興型ロタウイルス感染症の流行動態と蔓延の分子機序

研究課題

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研究課題/領域番号 22406017
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分海外学術
研究分野 衛生学
研究機関札幌医科大学

研究代表者

小林 宣道  札幌医科大学, 医学部, 教授 (80186759)

研究分担者 石埜 正穂  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (30232325)
鷲見 紋子  札幌医科大学, 医学部, 准教授 (10363699)
漆原 範子  札幌医科大学, 医学部, 講師 (80396308)
ゴッシュ ソウビック  札幌医科大学, 医学部, 助教 (30597175)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
キーワードロタウイルス / 遺伝子型 / 新変異型 / 新興型 / 分子疫学 / アジア / 系統樹 / 遺伝子再集合(リアソートメント) / 遺伝子再集合体
研究概要

主としてアジアの国々に分布が拡大している新変異型、新興型ロタウイルスの遺伝学的特徴を明らかにするため、ロタウイルスの全遺伝子配列とその系統解析を行った。中国ではG1P[8]とG3P[8]、バングラデシュではG2P[4]が主要な遺伝子型であったが、それらの中には動物ロタウイルスに由来すると推測される遺伝子分節を有する遺伝子再集合体が検出された。またVP4遺伝子型P[8]の新変異型P[8]bは中国、バングラデシュ、ミャンマーで検出され、世界的な新興型G9を伴うものが多かった。アジアおよび他の地域からの様々な新興型ロタウイルス(遺伝子型G1P[6], G2P[6], G3P[2]、G3P[6], G3P[9], G4P[10], G6P[9], G8P[1], G9P[19])の全遺伝子を解析したところ、それらは1)ヒトロタウイルスの異なる遺伝子群間の遺伝子再集合体、2)ヒトと動物ロタウイルス間の遺伝子再集合体、3)動物ロタウイルスが直接ヒトに伝播したと考えられるもの、に大別された。以上より、新変異型、新興型ロタウイルスのおもな出現機序は、遺伝子再集合と種間伝播であると考えられた。

  • 研究成果

    (23件)

すべて 2013 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (17件) (うち査読あり 17件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] Effect of temperature, relative humidity, and rainfall on rotavirus infections in Kolkata,India.2013

    • 著者名/発表者名
      Sumi A, Rajendran K, Ramamurthy T, Krishnan T, Nair GB, Harigane K, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Epidemiol Infect

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complex evolutionary patterns of two rare human G3P[9] rotavirus strains possessing a feline/canine-like H6 genotype on an AU-1-like genotype constellation.2013

    • 著者名/発表者名
      Wang Y-H, Pang B-B, Zhou X, Ghosh S, Tang W-F, Peng J-S, Hu Q, Zhou D-J, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

    • 査読あり
  • [雑誌論文] hole genomic analyses of asymptomatic human G1P[6], G2P[6] and G3P[6] rotavirus strains reveal intergenogroup reassortment events and genome segments of artiodactyl origin.2013

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Urushibara N, Chawla-Sarkar M, Krishnan T, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The origin of two rare human P[10] rotavirus strains.2013

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Urushibara N, Kawaguchiya M, Shintani T, Kobayashi N
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 13 ページ: 292-300

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis of human G1P[8] rotavirus strains from different age groups in China.2012

    • 著者名/発表者名
      Shintani T, Ghosh S, Wang Y-H, Zhou X, Zhou D-J, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 4 ページ: 1289-1304

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis of a human G1P[9] rotavirus strain reveals intergenogroup reassortment events.2012

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Shintani T, Urushibara N, Taniguchi K, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Gen Virol

      巻: 93 ページ: 1700-1705

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prevalence of human rotavirus genotypes in Wuhan, China during 2008-2011 : changing trend of predominant genotype and emergence of strains with P[8]b subtype of VP4 gene.2011

    • 著者名/発表者名
      Wang Y-H, Zhou X, Ghosh S, Zhou D-J, Pang B-B, Peng J-S, Hu Q, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Arch Virol

      巻: 156 ページ: 2221-2231

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis of rotavirus strains: current status and future prospects.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Future Microbiol

      巻: 6 ページ: 1049-1065

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genomic analysis reveals the complex evolutionary dynamics of Kenyan G2P[4] human rotavirus strains.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Adachi N, Gatheru Z, Nyangao J, Yamamoto D, Ishino M, Urushibara N, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Gen Virol

      巻: 92 ページ: 2201-2208

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ghosh S, Paul SK, Yamamoto D, Nagashima S, Kobayashi N.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Paul SK, Yamamoto D, Nagashima S, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 11 ページ: 1481-1486

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detection and full genomic analysis of G6P[9] human rotavirus in Japan.2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto D, Kawaguchiya M, Ghosh S, Ichikawa M, Numazaki K, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Virus Genes

      巻: 43 ページ: 215-223

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full genomic analyses of two human G2P[4] rotavirus strains isolated in 2005 : Identification of caprine-like VP3 gene.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Paul SK, Hossain MA, Alam MM, Ahmed MU, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Gen Virol.

      巻: 92 ページ: 1222-1227

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Emergence of G9 as a predominant genotype of human rotaviruses in Cuba.2011

    • 著者名/発表者名
      Ribas M, Nagashima S, Calzado A, Acosta G, Tejero Y, Cordero Y, PiedraD, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Med Virol

      巻: 83 ページ: 738-744

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Yamamoto D, Ghosh S, Kuzuya M, Wang Y-H, Zhou X, Chawla-Sarkar M, Paul SK, Ishino M, Kobayashi N.2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto D, Ghosh S, Kuzuya M, Wang Y-H, Zhou X, Chawla-Sarkar M, Paul SK, Ishino M, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      J Gen Virol

      巻: 92 ページ: 361-369

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full Genomic analysis of a simian SA11-like G3P[2] Rotavirus strain isolated from an asymptomatic infant : identification of novel VP1, VP6, and NSP4 genotype.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Gatheru Z, Nyangao J, Adachi N, Urushibara N, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Infect Genet Evol

      巻: 11 ページ: 57-63

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Full genomic analysis of a G8P[1] Rotavirus strain isolated from an asymptomatic infant in Kenya provides evidence for an artiodactyl-to-human interspecies transmission event.2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Gatheru Z, Nyangao J, Adachi N, Urushibara N, Kobayashi N
    • 雑誌名

      J Med Virol

      巻: 83 ページ: 367-376

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic analysis of human rotavirus in Myanmar : detection of Indian-Bangladeshi G1/G2 lineages, Chinese G3 lineage and OP354-like P[8] lineage (P[8]b subtype).2010

    • 著者名/発表者名
      Aung MS, Aung TS, Oo KY, Win N, Ghosh S, Yamamoto D, Kobayashi N.
    • 雑誌名

      Southeast Asian J Trop Med Public Health

      巻: 41 ページ: 1393-1404

    • 査読あり
  • [学会発表] Interspecies transmission of rotaviruses evidenced by whole genomic sequence analysis2013

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Ghosh S.
    • 学会等名
      The 17th FAVA (Federation of Asian Veterinary Association) congress
    • 発表場所
      Taipei
    • 年月日
      20130000
  • [学会発表] Molecular epidemiological analysis of G3P[9] rotaviruses from diarrheal patients in China2012

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Wang YH, Zhou X, Pang BB, Liu MQ, Peng JS, Hu Q, Zhou DJ, Ghosh S.
    • 学会等名
      he 13thAsia-Pacific congress of Clinical Microbiology and Infection
    • 発表場所
      Beijing
    • 年月日
      20120000
  • [学会発表] Full genomic analysis of rare G6P[9] human rotavirus detected in Japan2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto D, Kawaguchiya M, Ghosh S, Ichikawa M, Numazaki K, Kobayashi N.
    • 学会等名
      15thInternational Congress of Virology
    • 発表場所
      Sapporo
    • 年月日
      20110000
  • [学会発表] Full-genomic analysis of human rotavirus strains which have VP4 genes belonging to a rare P[8] subtype (P[8]B)2011

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi N, Ghosh S, Paul SK, Nagashima S.
    • 学会等名
      15thInternational Congress of Virology
    • 発表場所
      Sapporo
    • 年月日
      20110000
  • [学会発表] Full genomic analysis of human G2P[4] rotavirus strains from Africa2011

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Adachi N, Gatheru Z, Nyangao J, Ishino M, Urushibara N, Kobayashi N.
    • 学会等名
      15thInternational Congress of Virology
    • 発表場所
      Sapporo.
    • 年月日
      20110000
  • [学会発表] Full genomic analysis of an artiodactyl-like group A rotavirus G8P[1] strain detected from an asymptomatic infant in Kenya2010

    • 著者名/発表者名
      Ghosh S, Kobayashi N.
    • 学会等名
      12th Western Pacific Congress on Chemotherapy and Infectious Diseases
    • 発表場所
      Singapore
    • 年月日
      20100000

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公開日: 2014-08-29  

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