• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2012 年度 研究成果報告書

関数データとしての蛋白発現データ解析と癌個別化診断の試み

研究課題

  • PDF
研究課題/領域番号 22500271
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 統計科学
研究機関東北大学 (2012)
公益財団法人がん研究会 (2010-2011)

研究代表者

宮田 敏  東北大学, 大学院・医学系研究科, 講師 (60360343)

研究分担者 磯村 実  島根大学, 医学部, 講師 (40272497)
連携研究者 松浦 正明  公益財団法人がん研究会, がんゲノム研究部, 部長 (40173794)
研究期間 (年度) 2010 – 2012
キーワードゲノム統計解析 / 関数データ解析 / 非線型回帰
研究概要

蛋白発現プロファイルからの関数データの抽出には局所的に滑らかさの異なる関数の平滑化を行う。このため、適応型可変節点スプライン関数の理論的研究およびプログラム開発を行った。また、蛋白発現データを微分不能な点を持つ確率分布から得られたものと解釈し、きわめて特異な確率密度関数の推定問題として研究した。スプライン関数節点の最適化は、遺伝的アルゴリズムにより適応型モデル撰択基準を最適化することで行われた。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2013 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] Effect of the Great East Japan Earthquake on cardiovascular diseases--report from the 10 hospitals in the disaster area2013

    • 著者名/発表者名
      Aoki T, Takahashi J, Fukumoto Y, Yasuda S, Ito K, Miyata S, Shinozaki T, Inoue K, Yagi T, Komaru T, Katahira Y, Obata A, Hiramoto T
    • 雑誌名

      Circ J

      巻: 77(2) ページ: 490-493

    • URL

      https://www.jstage.jst.go.jp/article/circj/77/2/77_CJ-12-1594/_article

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Great East Japan Earthquake Disaster and cardiovascular diseases.2012

    • 著者名/発表者名
      Aoki T, Fukumoto Y, Yasuda S, Sakata Y, Ito K, Takahashi J, Miyata S, Tsuji I, Shimokawa H.
    • 雑誌名

      Eur Heart J

      巻: 33(22) ページ: 2796-2803

    • DOI

      DOI:10.1093/eurheartj/ehs288. Epub 2012PMID: 22930461

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Japanese Society for Cancer of the Colon and Rectum. "Results of a Japanese nationwide multi-institutional study on lateral pelvic lymph node metastasis in low rectal cancer: is it regional or distant disease?"2012

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi T, Watanabe T, Miyata S, Kotake K, Muto T, Sugihara K
    • 雑誌名

      Ann Surg

      巻: 255(6) ページ: 1129-1134

    • DOI

      doi:10.1097/SLA.0b013e3182565d9d. PMID: 22549752

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clinical impact ofintraoperative detection of carcinoembryonic antigen mRNA in pleural lavage specimens from nonsmall cell lung cancer patients2012

    • 著者名/発表者名
      Satoh Y, Sugai S, Uehara H, Mun M, Sakao Y, Okumura S, Nakagawa K, Ishikawa Y, Miki Y, Miyata S.
    • 雑誌名

      Thorac Cardiovasc Surg

      巻: 60(8) ページ: 533-540

    • DOI

      DOI:10.1055/s-0031-1298066

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Malignant transformation of breast fibroadenoma to malignant phyllodes tumor: long-term outcome of 36 malignant phyllodes tumors.2011

    • 著者名/発表者名
      Abe M, Miyata S, Nishimura S, Iijima K, Makita M, Akiyama F, Iwase T.
    • 雑誌名

      Breast Cancer

      巻: 18(4) ページ: 268-272

    • DOI

      doi:10.1007/s12282-009-0185-x.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prognostic factors for survival after salvage surgery for locoregional recurrence of colon cancer2011

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi T, Fujimoto Y, Konishi T, Kuroyanagi H, Ueno M, Oya M, Miyata S, Yamaguchi T.
    • 雑誌名

      Am J Surg.

      巻: 201(6) ページ: 726-733

    • DOI

      doi:10.1016/j.amjsurg.2010.03.003

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Trib1 links the MEK1/ERK pathway in myeloid leukemogenesis2010

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama T, Kanno Y, Yamazaki Y, Takahara T, Miyata S, Nakamura T
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 116(15) ページ: 2768-2775

    • DOI

      doi:10.1182/blood-2009-10-246264

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Therapeutic outcomes of endoscopic submucosal dissection of undifferentiated-type intramucosal gastric cancer without ulceration and preoperatively diagnosed as 20 millimetres or less in diameter.2010

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Y, Fujisaki J, Hirasawa T, Ishiyama A, Yoshimoto K, Ueki N, Chino A, Tsuchida T, Hoshino E, Hiki N, Fukunaga T, Sano T, Yamaguchi T, Takahashi H, Miyata S, Yamamoto N, Kato Y, Igarashi M.
    • 雑誌名

      Dig Endosc

      巻: 22(2) ページ: 112-118

    • DOI

      doi:10.1111/j.1443-1661.2010.00945.x.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Discriminant model for cytologic distinction of large cell neuroendocrine carcinoma from small cell carcinoma of the lung2010

    • 著者名/発表者名
      Hoshi R, Furuta N, Horai T, Ishikawa Y, Miyata S, Satoh Y.
    • 雑誌名

      J Thorac Oncol

      巻: 5(4) ページ: 472-478

    • DOI

      doi:10.1097/JTO.0b013e3181ce3cdd.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 適応型モデル選択基準を用いた一般化加法モデルの推定2010

    • 著者名/発表者名
      宮田敏
    • 雑誌名

      日本統計学会誌

      巻: Vol.39,Series JNo.2 ページ: 369-391

    • 査読あり
  • [学会発表] New software for imaging mass spectrometry data2012

    • 著者名/発表者名
      Masaaki Matsuura, Masaru Ushijima, Akiko Yuba-Kubo, Masatoshi Wakui, Mitsuyo Ohmura, Kurando Hosaka, Takahiro Hayasaka, Noritaka Masaki, Satoshi Miyata, Ikuko Yao, Mitsutoshi Setou, Kiyoshi Ogawa, Shigeki Kajihara
    • 学会等名
      American Association for Cancer Research Annual Meeting
    • 発表場所
      Chicago, IL. U.S.A.
    • 年月日
      2012-04-03
  • [学会発表] Results of a nationwide Japanese study on lateral pelvic lymph node metastasis in low rectal cancer: Is it regional or distant disease?2011

    • 著者名/発表者名
      T. Akiyoshi, T. Watanabe, S. Miyata, K. Kotake, T. Muto, K. Sugihara (2011)
    • 学会等名
      ASCO Annual Meeting: General Poster Session
    • 発表場所
      Chicago, Illinois. U.S.A.
    • 年月日
      20110637
  • [学会発表] イメージング質量分析データに基づいて領域を判別するソフトウェアの開発2011

    • 著者名/発表者名
      梶原茂樹、保坂蔵人、宮田敏、早坂孝宏、井上菜穂子、正木紀隆、久保亜希子、涌井昌俊、矢尾育子、小河潔、瀬藤光利、松浦正明
    • 学会等名
      第59回質量分析総合討論会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク大阪
    • 年月日
      2011-09-15
  • [学会発表] Gene Expression classification of human breast cancer2010

    • 著者名/発表者名
      Koichi Nagasaki, Minoru Isomura, Masaaki Matsuura, Masaru Ushijima, Satoshi Miyata, Hutoshi Akiyama, TetsuoNoda, Yoshio Miki
    • 学会等名
      69th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • 発表場所
      Osaka International Convention Center, Osaka
    • 年月日
      20100922-24
  • [学会発表] Development of detection method for novel fusion gene using GeneChip Exon Array2010

    • 著者名/発表者名
      Yusaku Wada, Masaaki Matsuura, Minoru Sugawara, Masaru Ushijima, Satoshi Miyata
    • 学会等名
      8th Joint Conference of the American Association for Cancer Research and the Japanese Cancer Association, Cancer Genomics, Epigenomics, and the Development of Novel Therapeutics
    • 発表場所
      Hilton Waikoloa Village Waikoloa, Hawaii. U.S.A.
    • 年月日
      20100205-09
  • [学会発表] Prediction of response to cancer chemotherapy by generalized additive model2010

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Miyata, Masaaki Matsuura
    • 学会等名
      8th Joint Conference of the American Association for Cancer Research and the Japanese Cancer Association, Cancer Genomics, Epigenomics, and theDevelopment of Novel Therapeutic
    • 発表場所
      Hilton Waikoloa Village Waikoloa, Hawaii. U.S.A.
    • 年月日
      20100205-09

URL: 

公開日: 2014-08-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi