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2011 年度 実績報告書

HIV1逆転写酵素の転写エラー率制御によるエイズ治療法の基礎的研究

研究課題

研究課題/領域番号 22500273
研究機関豊橋技術科学大学

研究代表者

原田 耕治  豊橋技術科学大学, 大学院・工学研究科, 助教 (40390504)

キーワードHIV-1 / エイズ / 数理モデル / シミュレーション
研究概要

HIV-1は、エイズ(後天性免疫不全症候群)の原因ウイルスである。エイズ治療の困難さは、HIV-1の高頻度な突然変異、いわゆる"高変異性"に原因があるといわれている。この研究では、この高変異性を逆手に取りHIV-1を自壊させられないか検討する。つまり、HIV-1ゲノムに過剰な変異を起こし、遺伝情報を無意味化することを考える。では、どうやってHIV-1ゲノムに過剰な変異を起こさせるか?私は、HIV-1逆転写酵素が、HIV-1ゲノム合成の際、塩基置換の転写エラーを頻繁に起こす点に注目し、その転写エラー率を通常以上に高めることで、HIV-1を自壊させられないか検討する。
本年度は、HIV-1の突然変異率を制御することでHIV-1を自壊させることが可能かどうかを検証するため、HIV-1数理モデルを構築し、数値シミュレーション実験を行った。HIV-1数理モデルは、HIV-1の突然変異プロセス、ホスト(CD4+Tcell)細胞内での複製プロセス、ホスト細胞間の再感染プロセスを含み、また、HIV-1の種類としては、感染能力のあるものと欠如したもの、複製能力の高いものと低いものを考慮している。また、HIV-1の突然変異率を制御するため変異原の効果を取り入れている。HIV-1数理モデルは、HIV-1粒子数を変数とした非線形常微分方程式で記述されたポピュレーションダイナミクスである。数値シミュレーション実験において、変異原の効果を高め、HIV-1の突然変異率を高めていくと、ある突然変異率を境に、HIV-1粒子数が減少に転じることを明らかにした。これは、HIV-1の突然変異率を高めることで、HIV-1が自壊する可能性を示唆するものである。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究は、HIV-1の突然変異率を高めることによるHIV-1の自壊可能性について検討することを目的の一つとしている。本年度は、HIV-1が自壊する可能性があることを数値シミュレーションで明らかにすることに成功した。したがって本研究の目的の二部は達成されつつあると言える。ゆえに、おおむね順調に進展していると評価した。

今後の研究の推進方策

今後、実施すべき課題を挙げる。
1.今年度構築したHIV-1数理モデルにおいて、HIV1が自壊するパラメータ条件を明らかにする。そのために、状態の安定性解析を実施する。
2.HIV-1の突然変異の起源となるHIV-1逆転写酵素の転写エラープロセスを、今年度構築したHIV-1数理モデルに取り込む。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] A Pattern Formation Mechanism of a Cellular Automaton Evolving on a Mutual Determination Rule of Variables and a Dynamics2012

    • 著者名/発表者名
      Kouji Harada, Yoshiteru Ishida
    • 雑誌名

      Proc.of AROB 17th

      ページ: 321-324

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Toward Development of a Strategy to Drive HIV-1 into Self-Extinction through the Error Catastrophe2012

    • 著者名/発表者名
      Kouji Harada, Yoshiteru Ishida
    • 雑誌名

      Proc.of AROB 17th

      ページ: 317-320

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Emergence of Observable Rules in a Spatial Game System2011

    • 著者名/発表者名
      Kouji Harada, Yoshiteru Ishida
    • 雑誌名

      Artificial Life and Robotics

      巻: 16 ページ: 559-562

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Emergence of Observable Rules in a Spatial Game System2011

    • 著者名/発表者名
      Kouji Harada, Yoshiteru Ishida
    • 雑誌名

      Proc.of AROB 16th

      ページ: 459-462

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tovvard Elucidation of Longevity of Immunological Memory2011

    • 著者名/発表者名
      Kouji Harada, Yoshiteru Ishida
    • 雑誌名

      Lecture Note in Computer Science

      巻: 6884 ページ: 308-317

    • 査読あり
  • [学会発表] Toward Development of a Strategy to Drive HIV-1 into Self-Extinction through the Error Catastrophe2012

    • 著者名/発表者名
      Kouji Harada
    • 学会等名
      AROB 17th
    • 発表場所
      Beppu, Japan
    • 年月日
      2012-01-20
  • [学会発表] A Pattern Formation Mechanism of a Cellular Automaton Evolving on a Mutual Determination Rule of Variables and a Dynamics2012

    • 著者名/発表者名
      Kouji Harada
    • 学会等名
      AROB 17th
    • 発表場所
      Beppu, Japan
    • 年月日
      2012-01-20
  • [学会発表] Toward Elucidation of Longevity of Immunological Memory2011

    • 著者名/発表者名
      Kouji Harada
    • 学会等名
      KES'11
    • 発表場所
      Kaiserslautern, Germany
    • 年月日
      2011-09-13

URL: 

公開日: 2013-06-26  

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