臨床検体を用いた統合的オミクス解析による骨転移関連遺伝子の網羅的探索と臨床応用

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22501057
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 臨床腫瘍学
• 研究機関: 独立行政法人国立がん研究センター
• 研究代表者: 近藤 格 独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (30284061)
• 研究分担者: 川井 章 独立行政法人国立がん研究センター, 中央病院, 医長 (90252965)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: 化学療法

研究概要

転移性骨腫瘍の分子背景を調べるため、手術時に得られ保管されていた臨床検体を用いて、原発腫瘍組織と転移性骨腫瘍組織の発現解析を行った。肺癌、乳癌、肝細胞癌、大腸癌、膵癌、胃癌、腎癌、耳下腺癌を対象した。プロテオームを解析するために蛍光二次元電気泳動法およびPROTOMAP法を使用した。また、マイクロRNAの網羅的解析のためにマイクロアレイを使用した。原発腫瘍組織に比べ転移性骨組織において発現が亢進あるいは低下している遺伝子を同定した。培養細胞株を用いた抑制実験を実施し、増殖・浸潤・遊走との関連を確認した。

研究成果

• [雑誌論文] Laser microdissection and two-dimensional difference gel electrophoresis reveal proteomic intra-tumor heterogeneity in colorectal cancer. (2013)
  • 著者名/発表者名: Sugihara Y, Taniguchi H, Kushima R, Tsuda H, Kubota D, Ichikawa H, Fujita S, Kondo T
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 78 ページ: 134-47
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteomic identification of the macrophage-capping protein as a protein contributing to the malignant features of hepatocellular carcinoma. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura K, Ojima H, Kubota D, Sakumoto M, Nakamura Y, Tomonaga T, Kosuge T, Kondo T
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 78 ページ: 362-73
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteomic-based identification of the APC-binding protein EB1 as a candidate of novel tissue biomarker and therapeutic target for colorectal cancer. (2012)
  • 著者名/発表者名: Sugihara Y, Taniguchi H, Kushima R, Tsuda H, Kubota D, Ichikawa H, Sakamoto K, Nakamura Y, Tomonaga T, Fujita S, Kondo T
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 75(17) ページ: 5342-55
  • 査読あり
• [雑誌論文] Decreased Selenium-Binding Protein 1 Enhances Glutathione Peroxidase 1 Activity and Downregulates HIF-1α to Promote Hepatocellular Carcinoma Invasiveness. (2012)
  • 著者名/発表者名: Huang C, Ding G, Gu C, Zhou J, Kuang M, Ji Y, He Y, Kondo T, Fan J
  • 雑誌名: Clin Cancer Res 巻: 18(11) ページ: 3042-53
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel application for pseudopodia proteomics using excimer laser ablation and two-dimensional difference gel electrophoresis. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ito A, Mimae T, Yamamoto Y. S, Hagiyama M, Nakanishi J, Ito M, Hosokawa Y, Okada M, Murakami Y, Kondo T
  • 雑誌名: Lab Invest 巻: 92(9) ページ: 1374-85
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sivertsson Å. Antibody-based protein profiling of the human chromosome 21. (2012)
  • 著者名/発表者名: Uhlen M, Oksvold P, Algenas C, Hamsten C, Fagerberg L, Klevebring D, Lundberg E, Odeberg J, Ponten F, Kondo T
  • 雑誌名: Molecular & cellular proteomics : MCP 巻: 11(3) ページ: M111.013458
  • 査読あり
• [雑誌論文] Macrophage-capping protein as a tissue biomarker for prediction of response to gemcitabine treatment and prognosis in cholangiocarcinoma. (2012)
  • 著者名/発表者名: Morofuji N, Ojima H, Onaya H, Okusaka T, Shimada K, Sakamoto Y, Esaki M, Nara S, Kosuge T, Asahina D, Ushigome M, Hiraoka N, Nagino M, Kondo T
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 75(5) ページ: 1577-89
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteomic study identified HSP 70 kDa protein 1A as a possible therapeutic target, in combination with histone deacetylase inhibitors, for lymphoid neoplasms. (2012)
  • 著者名/発表者名: Fujii K, Suzuki N, Ikeda K, Hamada T, Yamamoto T, Kondo T, Iwatsuki K.
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 75(4) ページ: 1401-10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Clinical proteomics identified ATP-dependent RNA helicase DDX39 as a novel biomarker to predict poor prognosis of patients with gastrointestinal stromal tumor. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kikuta K, Kubota D, Saito T, Orita H, Yoshida A, Tsuda H, Suehara Y, Katai H, Shimada Y, Toyama Y, Sato K, Kaneko K, Beppu Y, Murakami Y, Kawai A, Kondo T
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 75(4) ページ: 1089-98
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteomic study of malignant pleural mesothelioma by laser microdissection and two-dimensional difference gel electrophoresis identified cathepsin D as a novel candidate for a differential diagnosis biomarker. (2012)
  • 著者名/発表者名: Hosako M, Muto T, Nakamura Y, Tsuta K, Tochigi N, Tsuda H, Asamura H, Tomonaga T, Kawai A, Kondo T
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 75(3) ページ: 833-44
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pfetin as a prognostic biomarker for gastrointestinal stromal tumor: validation study in multiple clinical facilities. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kubota D, Orita H, Yoshida A, Gotoh M, Kanda T, Tsuda H, Hasegawa T, Katai H, Shimada Y, Kaneko K, Kawai A, Kondo T
  • 雑誌名: Jpn J Clin Oncol 巻: 41(10) ページ: 1194-202
  • 査読あり
• [雑誌論文] Steroid receptor expression in thymomas and thymic carcinomas. (2011)
  • 著者名/発表者名: Mimae T, Tsuta K, Takahashi F, Yoshida A, Kondo T, Murakami Y, Okada M, Takeuchi M, Asamura H, Tsuda H
  • 雑誌名: Cancer 巻: 117(19) ページ: 4398-405
  • 査読あり
• [雑誌論文] Combined use of a solid-phase hexapeptide ligand library with liquid chromatography and two-dimensional difference gel electrophoresis for intact plasma proteomics. (2011)
  • 著者名/発表者名: Hagiwara T, Saito Y, Nakamura Y, Tomonaga T, Murakami Y, Kondo T
  • 雑誌名: International Journal of Proteomics 巻: 2011 ページ: 739615
  • 査読あり
• [雑誌論文] Global expression study in colorectal cancer on proteins with alkaline isoelectric point by two-dimensional difference gel electrophoresis. (2011)
  • 著者名/発表者名: Muto T, Taniguchi H, Kushima R, Tsuda H, Yonemori H, Chen C, Sugihara Y, Sakamoto K, Kobori Y, Palmer H, Nakamura Y, Tomonaga T, Tanaka H, Mizushima H, Fujita S, Kondo T
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 74(6) ページ: 858-73
  • 査読あり
• [雑誌論文] Secernin-1 as a novel prognostic biomarker candidate of synovial sarcoma revealed by proteomics. (2011)
  • 著者名/発表者名: Suehara Y, Tochigi N, Kubota D, Kikuta K, Nakayama R, Seki K, Yoshida A, Ichikawa H, Hasegawa T, Kaneko K, Chuman H, Beppu Y, Kawai A, Kondo T
  • 雑誌名: Journal of Proteomics 巻: 74(6) ページ: 829-42
  • 査読あり
• [雑誌論文] Peroxiredoxin 2 as a chemotherapy responsiveness biomarker candidate in osteosarcoma revealed by proteomics. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kikuta K, Tochigi N, Saito S, Shimoda T, Morioka H, Toyama Y, Hosono A, Suehara Y, Beppu Y, Kawai A, Hirohashi S, Kondo T
  • 雑誌名: Proteomics Clinical Applications 巻: 4(5) ページ: 560-7
  • 査読あり
• [学会発表] Proteomics and immunohistochemistry validation established pfetin as a novel prognostic biomarker in gastrointestinal stromal tumor (2013)
  • 著者名/発表者名: Kondo T
  • 学会等名: Proteomics Forum 2013
  • 発表場所: Berlin, German
  • 年月日: 20130317-21
• [学会発表] Proteomic approach revealed novel prognostic biomarkers in gastrointestinal stromal tumor (GIST) (2012)
  • 著者名/発表者名: Kondo T, Kubota D , Ichikawa H, Tajima T, Mukaihara K, Sugihara Y, Suehara Y, Kikuta K, Kawai A
  • 学会等名: 17th Annual Connective Tissue Oncology Society Meeting
  • 発表場所: Prague, Czech Republic
  • 年月日: 20121114-17
• [学会発表] Cancer proteomics for biomarker development for personalized medicine; lessons from biomarker study in gastrointestinal stromal tumor (2012)
  • 著者名/発表者名: Kondo T, Kubota D, Kawai A
  • 学会等名: 6th Central and Eastern European Proteomic Conference
  • 発表場所: Budapest, Hungary
  • 年月日: 20121014-17
• [学会発表] Proteomic approach for biomarker discovery towards personalized medicine (2012)
  • 著者名/発表者名: Kondo T, Kubota D, Ichikawa H, Sugihara Y, Sekizaki Y, Murakami Y, Huang C, Fan J, Kawai A
  • 学会等名: Human Proteome Organisation, 11th Annual World Congress
  • 発表場所: Boston, USA
  • 年月日: 20120909-13
• [学会発表] Proteomics revealed novel prognostic utility of KCTD12 in gastrointestinal stromal tumor (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota D, Kikuta K, Suehara Y, Gotoh M, Yoshida A, Kawai A, Kondo T
  • 学会等名: 9th Siena Meeting FROM GENOME TO PROTEOME: OPEN INNOVATIONS
  • 発表場所: Siena, Italy
  • 年月日: 20120826-30
• [学会発表] Proteomics for biomarker development to personalized medicine (2012)
  • 著者名/発表者名: Kondo T, Huang C, Sekizaki H, Ichikawa H, Sugihara Y, Kubota D, Murakami Y, Fan J
  • 学会等名: Asia Oceania Human Proteome Organization 6th Congress
  • 発表場所: Beijing, China
  • 年月日: 20120505-07
• [学会発表] Proteomics application for sarcoma (2012)
  • 著者名/発表者名: Kondo T
  • 学会等名: The symposium of therapy and diagnosis of bone and soft tissue neoplasm in upper extremity
  • 発表場所: Shanghai, China
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] プロテオーム解析による個別化医療のためのバイオマーカー開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 近藤 格
  • 学会等名: 第58回日本臨床検査医学会学術集会
  • 発表場所: 岡山
  • 年月日: 20111117-20
• [学会発表] Proteomic study of malignant pleural mesothelioma by laser microdissection and two-dimensional difference gel electrophoresis (2011)
  • 著者名/発表者名: Kondo T, Kubota D, Kawai A
  • 学会等名: 2011 Combined Meeting of the Connective Tissue Oncology Society and the Musculoskeletal Tumor Society
  • 発表場所: Chicago, USA
  • 年月日: 20111026-29
• [学会発表] プロテオーム解析による個別化医療のためのバイオマーカー開発 (2011)
  • 著者名/発表者名: 近藤 格
  • 学会等名: 第70回日本癌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 20111003-05
• [学会発表] Cancer proteomics for biomarker development toward personalized medicine (2011)
  • 著者名/発表者名: Kondo T
  • 学会等名: 5th Central and Eastern European Proteomic Conference
  • 発表場所: Prague, Czech
  • 年月日: 20110919-22
• [学会発表] Solid-phase hexapeptide ligand library with liquid chromatography and two-dimensional difference gel electrophoresis for intact plasma proteomics (2011)
  • 著者名/発表者名: Kondo T, Hagiwara T, Kubota D, Sugihara Y, Yonemori H, Haga A, Ohtsu M, Murakami Y
  • 学会等名: Human Proteome Organisation, 10th Annual World Congress
  • 発表場所: Geneva, Switzerland
  • 年月日: 20110903-07
• [学会発表] プロテオーム解析による個別化医療のためのがんバイオマーカー開発. Proteomic approach to biomarker development toward personalized medicine (2011)
  • 著者名/発表者名: 近藤 格
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構第9回大会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 20110728-30
• [学会発表] プロテオーム解析による個別化医療のためのバイオマーカー開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 近藤 格
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20101207-10
• [学会発表] Biomariker development by sarcoma proteomics (2010)
  • 著者名/発表者名: Kondo T, Suehara Y, Kikuta K, Kubota D, Hosono A, Yoshida A, Tsuta K, Gotoh M, Hirohashi S, Kawai A
  • 学会等名: 16th Annual Connective Tissue Oncology Society Meeting
  • 発表場所: Paris, France
  • 年月日: 20101111-13
• [学会発表] GeMDBJ Proteomics (2010)
  • 著者名/発表者名: Kondo T
  • 学会等名: 4th The European Proteomics Association/British Society for Proteome Research Meeting, 6th ProCura Meeting
  • 発表場所: Estoril, Portugal
  • 年月日: 20101023-27
• [学会発表] Canncer proteomics for biomarker development toward personalized Medicine (2010)
  • 著者名/発表者名: Kondo T, Hirohashi S
  • 学会等名: 第69回日本癌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 20100922-24
• [学会発表] 電気泳動法を用いたがん個別化医療のためのバイオマーカー開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 近藤 格
  • 学会等名: 第61回日本電気泳動学会総会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 20100918-19
• [学会発表] Cancer proteomics for biomarker development (2010)
  • 著者名/発表者名: 近藤 格
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構第8回大会・第6回日本臨床プロテオーム研究会連合大会
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 20100726-27
• [学会発表] 蛍光二次元電気泳動法と抗体を用いたプロテオーム解析による大腸がんバイオマーカーの開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 近藤 格, 谷口 浩和, 杉原 豊, 陳 臣, 中村 友紀子, 坂本 華乃, 九嶋 亮治, 朝長 毅, 礒辺 俊明, 廣橋 説雄, 藤田 伸
  • 学会等名: 第73回大腸癌研究会
  • 発表場所: 鹿児島
  • 年月日: 2010-07-02
• [図書] プロテオーム解析 新臨床腫瘍学 (2012)
  • 著者名/発表者名: 近藤格
  • 出版者: 南江堂
• [図書] 探索的解析手法 臨床プロテオミクス (2012)
  • 著者名/発表者名: 近藤格
  • 出版者: 金原出版
• [備考]
  • URL: http://www.ncc.go.jp/jp/nccri/divisions/p09prote/index.html
• [産業財産権] 分析方法 (2013)
  • 発明者名: 木下英樹、鵜沼豊、近藤格
  • 権利者名: 国立がん研究センター、シャープ株式会社
  • 産業財産権番号: 特許,特願2013-71753
  • 出願年月日: 2013-03-29
• [産業財産権] APC-binding protein EB1を用いた大腸癌の診断、治療法 (2011)
  • 発明者名: 木下英樹、鵜沼豊、近藤格
  • 権利者名: 国立がん研究センター、バイオマトリックス研究所
  • 産業財産権番号: 特許,特願2011-94972
  • 出願年月日: 2011-04-21