• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2012 年度 実績報告書

バクテリアの生育に必須な「外来遺伝子群抑制システム」の解析

研究課題

研究課題/領域番号 22510204
研究機関首都大学東京

研究代表者

加藤 潤一  首都大学東京, 理工学研究科, 教授 (10194820)

研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2013-03-31
キーワードrRNA / プロセッシング / 大腸菌 / 必須遺伝子
研究概要

大腸菌の機能未知必須遺伝子yqgFについては、これまでholliday構造の解離に働くRuvCと立体構造の相同性が高いことが報告されており、我々の研究からもRuvCの活性部位に対応するYqgFのアミノ酸残基が、生育に必須な機能に重要であることが確認されていた。我々はyqgF温度感受性変異株を単離して、yqgFが転写終結に関与するrho、nusAと機能的に関連することを遺伝学的に示し、また実際にyqgF温度感受性変異株では遺伝子内または上流に存在するRho依存性終結配列で野生株とは異なり転写終結が起こることを明らかにしてきた。
YqgFの転写終結への関与のメカニズムについては、バクテリアにおける翻訳と転写の直接的、機能的な関連から、YqgFがリボソームの機能に関与する可能性を考え、yqgF温度感受性変異株におけるrRNAについて調べたところ、16S rRNAのプロセッシングが不完全な前駆体(pre-16SrRNA)が蓄積していることがわかった。単離したpre-16S rRNAは精製したYqgFによりin vitroでプロセッシングされなかったが、pre-16S rRNAを含むリボソーム画分を用いるとプロセッシングされることがわかり、YqgFは16S rRNAのプロセッシングに必須なRNaseであることが明らかになった。また変異型YqgFを精製して同様に調べたところ、プロセッシング活性が欠損していることがわかった。切断部位については5’RACE, 3’RACE法により決定した結果、これまでRNase Eが切断すると考えられてきた5’側の部位であることがわかった。16S rRNAがプロセッシングされない場合には、リボソームのS1タンパク質が減少することがわかり、翻訳開始が正常に起こらないことが示唆された。

現在までの達成度 (区分)
理由

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (10件)

すべて 2013 2012

すべて 学会発表 (10件)

  • [学会発表] 大腸菌の生育に必須な機能未知遺伝子yqgFの解析2013

    • 著者名/発表者名
      中西忍
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 年月日
      20130308-20130311
  • [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株の解析とその利用2013

    • 著者名/発表者名
      高木光
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 年月日
      20130308-20130311
  • [学会発表] 大腸菌の定常期の生育に関わるユニバーサルストレスプロテインの機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      岩舘佑未
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 年月日
      20130308-20130311
  • [学会発表] 紅色硫黄光合成細菌Allochromatium vinosum の光合成関連遺伝子群の発現調節因子の同定と解析2013

    • 著者名/発表者名
      藤原弘平
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 年月日
      20130308-20130311
  • [学会発表] 紅色光合成細菌Rubrivivax gelatinosusにおけるバクテリオクロロフィル合成を大腸菌で再構成する試み2013

    • 著者名/発表者名
      川口達也
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 年月日
      20130308-20130311
  • [学会発表] 大腸菌の生育に必須な機能未知遺伝子yqgFの解析2012

    • 著者名/発表者名
      中西忍
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20121211-20121214
  • [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株の作製と利用2012

    • 著者名/発表者名
      久保田希
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20121211-20121214
  • [学会発表] 紅色硫黄光合成細菌Allochromatium vinosumの光合成関連遺伝子群の発現調節因子の同定と解析2012

    • 著者名/発表者名
      藤原弘平
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20121211-20121214
  • [学会発表] 紅色光合成細菌Rubrivivax gelatinosusにおけるバクテリオクロロフィル合成を大腸菌で再構成する試み2012

    • 著者名/発表者名
      川口達也
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20121211-20121214
  • [学会発表] 大腸菌染色体大規模欠失株を用いた合成致死遺伝子群の解析2012

    • 著者名/発表者名
      高木光、北村麻衣子、加藤潤一
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20120000

URL: 

公開日: 2014-07-24  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi