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2012 年度 実績報告書

遺伝子制御ネットワークに着目した超好熱菌からの有用遺伝子探索

研究課題

研究課題/領域番号 22550151
研究機関京都大学

研究代表者

金井 保  京都大学, 工学(系)研究科(研究院), 講師 (10346083)

研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2013-03-31
キーワード超好熱菌 / アーキア / 遺伝子 / 転写制御因子
研究概要

精製したTK1136タンパク質に対して、様々なα多糖やp-Nitrophenyl基等の吸光基で修飾された糖基質など、総計40種類の基質と反応させ、その糖加水分解活性・糖転移活性をTLC解析で観察した。しかしながら、これまでに明確な活性を確認するには至っていない。
続いてTK1136遺伝子破壊株を作製した。作成した遺伝子破壊ベクターを用いて、T. kodakarensis KUW1株を形質転換し、ウラシル非要求性を指標として、シングルクロスオーバー相同組換株を単離した。その後、5-フルオロオロチン酸耐性を指標とした単離により、pyrFマーカー脱離して本ORFのみがゲノムより除去された遺伝子破壊株を得た。この遺伝子破壊株の生育が培地中に含まれる炭素源により異なるかを調べるために、基本培地(人工海水塩に酵母エキスとトリプトンを添加)にピルビン酸ナトリウムを添加した培地と、基本培地にマルトデキストリンを添加した培地でそれぞれ生育測定を行った。その結果、TK1136破壊株はどちらの条件でもホスト株と同様に生育し、明確な差は観察されなかった。

現在までの達成度 (区分)
理由

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Genetic studies on the virus-like regions in the genome of hyperthermophilic archaeon, Thermococcus kodakarensis2013

    • 著者名/発表者名
      Tagashira, K., W. Fukuda, M. Matsubara, T. Kanai, H. Atomi, and T. Imanaka
    • 雑誌名

      EXTREMOPHILES

      巻: 17 ページ: 153-160

    • DOI

      10.1007/s00792-012-0504-6

    • 査読あり
  • [雑誌論文] An archaeal histone is required for transformation of Thermococcus kodakarensis2012

    • 著者名/発表者名
      Cubonova, L., M. Katano, T. Kanai, H. Atomi, J. N. Reeve, and T. J. Santangelo
    • 雑誌名

      J. Bacteriol

      巻: vol.194 ページ: 6864-6874

    • DOI

      DOI:10.1128/JB.01523-12

    • 査読あり
  • [学会発表] 超好熱性アーキアの環境適応に関わる転写調節因子の解析2013

    • 著者名/発表者名
      金井保、武富尚吾、小谷徹、釜下知之、中之庄正弘、今中忠行、跡見晴幸
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      東北大学川内キャンパス
    • 年月日
      20130327-20130327
    • 招待講演
  • [学会発表] 超好熱性アーキアにおける熱ショック応答転写制御因子の機能解析2012

    • 著者名/発表者名
      金井保、小谷徹、釜下知之、今中忠行、跡見晴幸
    • 学会等名
      日本生物工学会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 年月日
      20121022-20121022
  • [学会発表] 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisゲノムからの新規転写制御因子の同定2012

    • 著者名/発表者名
      山本康之、金井保、跡見晴幸
    • 学会等名
      日本生物工学会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 年月日
      20121022-20121022
  • [図書] Protein Engineering Handbook, vol.3 chap.72013

    • 著者名/発表者名
      Kanai, T., H. Atomi
    • 総ページ数
      18
    • 出版者
      Wiley-VCH

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公開日: 2014-07-24  

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