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2011 年度 実績報告書

葉緑体で見出された新しい翻訳様式の分子機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 22570050
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

杉浦 昌弘  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 名誉教授 (80027044)

キーワード葉緑体 / 翻訳 / mRNA / in vitro系 / タバコ / 重複遺伝子
研究概要

葉緑体のNADH脱水素酵素の2種のサブユニットをコードするタバコ葉緑体のndhCとndhKのシストロンは、一部重複している。一般的には下流のシストロンの翻訳は上流シストロンに比べ極めて低いので、ndhKの翻訳が低いと想定される。
mdhC/ndhK mRNAを、われわれが開発したin vitro系で翻訳したところ、意外にもNdhCサブユニットとNdhKサブユニットが等量合成された。上流のndhCの終止コドンを除くと下流のndhKの翻訳は起きないこと、更に、上流の5'UTRとそれに続くAUG開始コドンを除いてndhCの翻訳を止めても、ndhKがかなり翻訳されることを最近発見した。この知見から、ndhKシストロンは二つの機構で翻訳されるとする『1シストロン2翻訳機構』仮説を立てた。本研究では、この仮説の基づく新しい第2の機構の分子機構を、我々の葉緑体in vitro翻訳系を用いて明らかにする。
本年度は、緑色蛍光タンパク質コード領域(GFP)を翻訳活性の指標とした解析を行い、以下の進捗があった。
1)ndhCシストロン(360nt)の中心部の更なる欠失実験から、リボソームの入口の配列をおよそ20ヌクレオチドに絞り込んだ。
2)上の必須領域のすぐ下流にndhCシストロンと同じフレームのAUGが1個あり、このAUGからリボソームが翻訳しながら進んでいくと考えられる。
3)ndhK開始コドン直前の必須領域に存在するShine-Dalgarno(SD)様配列に変異を導入するとndhKの翻訳が影響を受けることから、この配列がシス配列であると考えられる。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

ndhKシストロンは二つの機構で翻訳されるとする『1シストロン2翻訳機構』仮説のうち、他には例を見ない新しい第2の機構の分子機構を、我々の葉緑体in vitro翻訳系を用いて明らかにすることが本研究の目的であるが、これまでに、2つの必須領域を同定しており、両者はリボソームの入り口と翻訳再開始のシス配列を含んでいると考えられる。これまでの期間にこのような成果を得たことで目標は十分に達成できており、本研究はおおむね順調に進展しているといえる。

今後の研究の推進方策

本年は、主に、蛍光標識リジンtRNAを用いて、必須領域内にあるndhCシストロンと同フレームのAUGからの翻訳産物の検出を行い、リボソームが翻訳しながら進むかあるいはスキャンしているだけなのかを明らかにする。同時にこのAUGからの翻訳とndhKの翻訳の比率を確認する。
また、本年は最終年度であるのでこれまでの解析結果をまとめ論文として成果を発表する。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (10件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] A novel hypoxic stress-responsive long non-coding RNA transcribed by RNA polymerase III in Arabidopsis2012

    • 著者名/発表者名
      Wu, J., T.Okada, T.Fukushima, T.Tsudzuki, M.Sugiura, Y.Yukawa
    • 雑誌名

      RNA Biology

      巻: Vol.9 ページ: 302-313

    • DOI

      doi:10.4161/rna.9.3.19101

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The downstream atpE cistron is efficiently translated via its own cis-element in partially overlapping atpB-atpE dicistronic mRNAs in chloroplasts2011

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, H., H.Kuroda, Y.Yukawa, M.Sugiura
    • 雑誌名

      Nucl.Acids.Res.

      巻: Vol.39 ページ: 9405-9412

    • DOI

      doi:10.1093/nar/gkr644

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Translation of partially overlapping pshD-psbC mRNAs in chloroplasts : the role of 5'-processing and translational coupling2011

    • 著者名/発表者名
      Adachi, Y., H.Kuroda, Y.Yukawa, M.Sugiura
    • 雑誌名

      Nucl.Acids.Res.

      巻: Vol.40 ページ: 3152-3158

    • DOI

      doi:10.1093/nar/gkr1185

    • 査読あり
  • [学会発表] タバコ葉緑体rps16 mRNAの翻訳抑制のin vitro解析2012

    • 著者名/発表者名
      中邨真之、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第53回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      京都産業大学(京都府)
    • 年月日
      20120316-20120318
  • [学会発表] In vitro転写系によるGSTおよびノンコーディングRNA遺伝子転写の相互作用2011

    • 著者名/発表者名
      山本恵子、杉浦昌弘、湯川泰
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      20111213-20111216
  • [学会発表] 顕花植物光合成遺伝子の光依存転写制御のin vitro解析2011

    • 著者名/発表者名
      宮崎綾香、岩田真也、杉浦昌弘、湯川泰
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      20111213-20111216
  • [学会発表] タバコ葉緑体psbD-psbC発現における翻訳開始機構の解析2011

    • 著者名/発表者名
      足達由佳、黒田洋詩、湯川泰、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      20111213-20111216
  • [学会発表] タバコ葉緑体in vitro翻訳系を用いたrbcL翻訳開始機構の解析2011

    • 著者名/発表者名
      黒田恵、黒田洋詩、湯川泰、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      20111213-20111216
  • [学会発表] 植物培養細胞からの細胞質in vitro翻訳解析法の開発2011

    • 著者名/発表者名
      Xin He、山本裕子、湯川眞希、杉浦昌弘、湯川泰
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      20111213-20111216
  • [学会発表] タバコ葉緑体ndhC-K mRNAに見られる新しい終止コドン依存型翻訳2011

    • 著者名/発表者名
      湯川眞希、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      20111213-20111216
  • [学会発表] Analysis of the gene for choloroplast 30S ribosomal protein S16 in tobacco2011

    • 著者名/発表者名
      M.Nakamura, M.Sugiura
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      20111213-20111216
  • [学会発表] Characterization of a novel long non-coding RNA transcribed by RNA polymerase III in Arabidopsis2011

    • 著者名/発表者名
      Juan Wu、岡田敏浩、福島徹、續伯彦、杉浦昌弘、湯川泰
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      20111213-20111216
  • [学会発表] rps16 gene in tobacco choloroplasts is well transcribed and its transcripts is correctly spliced, but mRNA is not translated2011

    • 著者名/発表者名
      M.Nakamura, M.Sugiura
    • 学会等名
      The EMBO Meeting 2011
    • 発表場所
      Austria Center Vienna (Vienna)
    • 年月日
      20110910-20110913
  • [備考]

    • URL

      http://www.nsc.nagoya-cu.ac.jp/profile/sugiura.html

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公開日: 2013-06-26  

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