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2012 年度 実績報告書

ゲノム不安定性を導くトポイソメラーゼ1の小RNA分子による調節機構

研究課題

研究課題/領域番号 22570169
研究機関京都大学

研究代表者

小林 牧  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (20400690)

研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2013-03-31
キーワードmiRNA / 免疫グロブリン遺伝子 / DNA切断
研究概要

本年度は、Topoisomerase1 (Top1) のmRNAに結合するAgo2の結合部位について同定を進めた。4-thiouridine(4-SU)を用いたRNA-IPにおいては、Top1の3'UTRの2カ所にAgo2の結合が認められ、そのうちの一カ所はAIDに依存せず、AIDの非誘導時にもAgo2の結合が認められたが、coding regionにより近いもう一カ所はAIDに依存性であり、非誘導時にはゼロレベルだが、誘導時には比較的高い結合が認められた。それに一致して、BrUを用いたプローブラベルによるトラップ実験の結果、3'UTRとcoding領域の末端に、Ago2の結合部位が認められた。AIDに非依存性のAgo2結合部位にて機能すると予想された4つのmiRNA(これらはいずれも共通するseed配列を持つ)のノックダウン実験や過剰発現実験は、実際にクラススイッチに対して予想される効果を持ち、これらが生体内で機能していることが伺われた。また、AIDに依存性のAgo2結合領域にて機能するmiRNAは現在同定中である。また、Ago2と協調して働くTNRC6aのノックダウンによりクラススイッチが抑制され、miRNAによるTop1mRNAの翻訳修飾効果は確実なものであると考えられる。
また、上記の結果をふまえ、Luciferase assayにより、このTop1 mRNA領域の翻訳抑制機序を再現できるassay系を構築している。

現在までの達成度 (区分)
理由

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] In vivo analysis of Aicda gene regulation: a critical balance between upstream enhancers and intronic silencers governs appropriate expression2013

    • 著者名/発表者名
      Le Thi Huong
    • 雑誌名

      PLosONE

      巻: 未定 ページ: 未定

    • 査読あり
  • [雑誌論文] An evolutionary view of the mechanism for immune and genome diversity2012

    • 著者名/発表者名
      Lucia Kato, Andre Stanlie, Nasim A Begum, Maki Kobayashi, Masatoshi Aida, Tasuku Honjo
    • 雑誌名

      J Immunol

      巻: vol. 188 ページ: 3559-3566

    • DOI

      doi:10.4049/jimmunol.1102397

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The AID Dilemma: Infection, or Cancer?2012

    • 著者名/発表者名
      Tasuku Honjo
    • 雑誌名

      Advances in Cancer Research

      巻: 113 ページ: 1-44

    • 査読あり
  • [学会発表] Activation-induced cytidine deaminase regulates Topoisomerase1 protein by miRNA during immnoglobulin gene recombination2013

    • 著者名/発表者名
      Maki Kobayashi et al
    • 学会等名
      Keystone Meeting, Noncoding RNAs in Development and Cancer
    • 発表場所
      Fairmont Hotel Vancouver
    • 年月日
      2013-01-22
  • [学会発表] Activation-induced cytidine deaminase regulates Topoisomerase1 protein by miRNA during immnoglobulin gene recombination2012

    • 著者名/発表者名
      Maki Kobayashi et al
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2012-12-14
  • [学会発表] Activation-induced cytidine deaminase regulates Topoisomerase1 protein by miRNA during immnoglobulin gene recombination2012

    • 著者名/発表者名
      Maki Kobayashi et al
    • 学会等名
      第41回日本免疫学会学術集会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 年月日
      2012-12-06

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公開日: 2014-07-24  

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