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2012 年度 研究成果報告書

南米全域のモンゴロイド系先住民族における遺伝的差異の比較解析

研究課題

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研究課題/領域番号 22570231
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用人類学
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

檀上 稲穂  独立行政法人理化学研究所, 細胞材料開発室, 協力研究員 (30415228)

研究期間 (年度) 2010 – 2012
キーワード南米 / 先住民族 / 少数民族 / B-LCL / B細胞株 / ゲノム解析 / マイクロサテライト / アレイCGH
研究概要

南米全土の純粋な先住民族2,500個体より採取した末梢血単核球検体について、Epstein-Barrウイルスを用いて550個体分のB細胞株(EBV-B細胞)を樹立し、南米各部族の遺伝的特徴の解明と部族間類縁関係の解析を実施した。人類遺伝学的解析に先立ち、アレイCGH解析を行いEBV-B細胞の樹立過程および長期培養時のゲノム安定性を確認できた。人類遺伝学的解析として、性による影響を排除するために常染色体マイクロサテライト8領域を用いて地理的な位置関係に基づいて南米全土を5グループに分類し、各グループ間で遺伝的特徴に差異があることを明らかにできた。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2013 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (7件) 図書 (4件)

  • [雑誌論文] Dominant expansion of a cryptic subclone possessing an abnormal karyotype occurs in B lymphoblastoid cell lines during culture2013

    • 著者名/発表者名
      I.Danjoh, R.Shirota, T.Hiroyama, Y. Nakamura
    • 雑誌名

      Cytogenetics and Genome Research

      巻: 139 ページ: 88-96

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of a robust method for establishing B cell lines using Epstein-Barr Virus2012

    • 著者名/発表者名
      I.Danjoh, H.Sone, R.Shirota, T. Hiroyama, Y.Nakamura
    • 雑誌名

      In Vitro Cellular and Developmental Biology - Animal

      巻: 48 ページ: 393-402

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Sonoda-Tajima Cell Collection, a human genetics research resource with emphasis on South American indigenous populations2011

    • 著者名/発表者名
      I.Danjoh, K.Saijo, T.Hiroyama, Y. Nakamura
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 3 ページ: 272-283

    • 査読あり
  • [学会発表] Epstein-Barr virusを用いたB細胞株樹立の効率に影響を与える因子の探索2012

    • 著者名/発表者名
      檀上稲穂、城田涼子、中村幸夫
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      福岡市
    • 年月日
      20121211-14
  • [学会発表] Development of a robust method for establishing B cell lines using Epstein-Barr Virus2012

    • 著者名/発表者名
      I.Danjoh, R.Shirota Y.Nakamura
    • 学会等名
      The American Society of Human Genetics Annual Meeting, San Francisco
    • 発表場所
      USA
    • 年月日
      20121106-11
  • [学会発表] Development of a robust method for establishing B cell lines using Epstein-Barr Virus2012

    • 著者名/発表者名
      I.Danjoh, Y.Nakamura
    • 学会等名
      日本癌学会
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      20120919-21
  • [学会発表] Genomic stability of B lymphoblastoid cell lines established from the Sonoda-Tajima Cell Collection, the collection of South American indigenous populations2011

    • 著者名/発表者名
      I.Danjoh, K.Saijo, M.Nagayoshi, Y. Nakamura
    • 学会等名
      International Congress of Human Genetics
    • 発表場所
      Montreal, Canada
    • 年月日
      20111011-15
  • [学会発表] 南米モンゴロイド系先住民族コレクションより樹立したB細胞株のゲノム安定性2010

    • 著者名/発表者名
      檀上稲穂、西條薫、永吉満利子、中村幸夫
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      20101207-10
  • [学会発表] Collection of peripheral blood mononuclear cells obtained from Amerindians and other Mongoloid minority groups2010

    • 著者名/発表者名
      I.Danjoh, K.Saijo, K.Fukami-Kobayashi, Y.Nakamura
    • 学会等名
      The American Society of Human Genetics Annual Meeting
    • 発表場所
      Washington D.C. USA
    • 年月日
      20101102-06
  • [学会発表] 南米モンゴロイド系先住民族コレクションより樹立したB細胞株のゲノム安定性2010

    • 著者名/発表者名
      檀上稲穂、西條薫、永吉満利子、中村幸夫
    • 学会等名
      日本人類学会
    • 発表場所
      北海道伊達市
    • 年月日
      20101001-1003
  • [図書] がん細胞株・不死化細胞を用いた研究, 目的別で選べる細胞培養プロトコール、中村幸夫編2012

    • 著者名/発表者名
      檀上稲穂
    • 総ページ数
      40-45
    • 出版者
      羊土社
  • [図書] ゲノムインキュベーターとしての細胞を用いた研究, 目的別で選べる細胞培養プロトコール、中村幸夫編2012

    • 著者名/発表者名
      檀上稲穂
    • 総ページ数
      46-51
    • 出版者
      羊土社
  • [図書] Bリンパ芽球様細胞株(B-LCL)-樹立培養方法および維持培養方法, 目的別で選べる細胞培養プロトコール、中村幸夫編2012

    • 著者名/発表者名
      檀上稲穂
    • 総ページ数
      176-186
    • 出版者
      羊土社
  • [図書] Clinical application of molecular diagnosis in cancer, radiation effect, and human diseases2010

    • 著者名/発表者名
      K.Hiyama, E.Hiyama, I.Danjoh
    • 総ページ数
      21-34
    • 出版者
      Public databases useful for molecular diagnosis. Edited by Eiso Hiyama and Keiko Hiyama

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公開日: 2014-08-29  

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