トランスポゾン様遺伝子の進化的多様化と機能性非翻訳RNA解析

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22580005
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 育種学
• 研究機関: 鳥取大学
• 研究代表者: 富田 因則 鳥取大学, 農学部, 准教授 (70207611)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: ムギ類 / トランスポゾン / 進化 / RNA / 構造変異 / 翻訳領域 / 染色体 / クラスター

研究概要

トランスポゾンRevolverの進化的な動きを、イスラエルのエボリューション・キャニオンの温暖乾燥斜面、冷涼湿潤斜面に自生するオオムギ野生種で調べた。温暖乾燥斜面では一定の0.7 kb RNAの強い発現、冷涼湿潤斜面では1 ～2 kbの多様なRNAが弱い発現が見られ、環境による劇的変異と最近の増幅活性が示唆された。第1エキソンの長短や第2イントロン欠失など多様なノンコーディングRNAの単離、転写開始点決定、大腸菌でのタンパク質合成、染色体クラスターの検出を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Rye chromosome- specific polymerase chain reaction products developed by primers designed from the EcoO109I recognition site (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M., and Seno, A.
  • 雑誌名: Genome 巻: 55(5) ページ: 370-382
• [雑誌論文] Genomic, RNA, and ecological divergences of the Revolvertransposon- like multi-gene family in Triticeae (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M., Okutani, A., Beiles, A., and Nevo, E.
  • 雑誌名: BMC Evolutionary Biology 巻: 11 ページ: 269
  • DOI: DOI:10.1186/1471-2148-11-269
• [学会発表] Divergent PCR products of Revolver transposon showing cluster-like chromosomal distribution (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M., and Tanaka, E
  • 学会等名: 日本育種学会第123回講演会, 育種学研究15
  • 発表場所: 東京農業大学
  • 年月日: 20130300
• [学会発表] Cluster-like chromosomal distribution of Revolver transposon and its transcription initiation site in Secale cereale (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M., and Kanzaki, T
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡
  • 年月日: 20121200
• [学会発表] Revolverトランスポゾン様多重遺伝子族のゲノム、RNAおよび生態における多様な変異, 育種学研究14 (2012)
  • 著者名/発表者名: 富田因則、Nevo, E
  • 学会等名: 日本育種学会第120回講演会
  • 発表場所: 宇都宮大学
  • 年月日: 20120300
• [学会発表] Sequence-tagged rye chromosome-specific polymerase chain reaction products developed by primers designed from the Eco0109I recognition site (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M., and Seno, A.
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 20111200
• [図書] 植物のゲノム育種.新バイオの扉 "未来に拓く生物工学" (2013)
  • 著者名/発表者名: 富田因則, 高木正道・池田友久
  • 出版者: 裳華房
• [図書] Recent patent on Revolver-2: a novel transposon-like gene useful for chromosome tags of rye. In New Developments in Chromatin Research (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M, Eds. Neil M. Simpson and Valerie J. Stewart
  • 出版者: Nova Science Publishers