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2012 年度 実績報告書

地理的DNA変異に基づく稲作随伴雑草タイヌビエの日本への侵入・拡散ルートの解明

研究課題

研究課題/領域番号 22580017
研究機関秋田県立大学

研究代表者

保田 謙太郎  秋田県立大学, 生物資源科学部, 准教授 (00549032)

研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2014-03-31
キーワードタイヌビエ / 小穂F-C型 / 地理的変異 / 水田雑草 / 葉緑体DNA
研究概要

稲作とともに日本国内に拡がったとされる稲作随伴雑草タイヌビエを研究対象として、葉緑体非コード領域DNA の広域シークエンス分析(約7000bp)を行い、日本国内および近隣諸国に分布するタイヌビエの遺伝的類縁性を明らかにする。さらに、得られた変異をSNPS 法で検出する方法を開発し、日本および近隣諸国の多数のタイヌビエの地理的遺伝変異を分析する。稲作随伴雑草タイヌビエが本当に稲作の伝播とともに日本に侵入し、拡散したのかという雑草学における根本的問題の解明を目指す。
本年度は、九州地方中部、四国地方、近畿地方、東北地方の一部でタイヌビエを収集した。収集した日本産サンプルの小穂の形態変異(F-C型)を分析し、F型は北海道道央部、東北地方と中部地方の日本海側、C型は近畿地方、四国地方、九州地方北部に多いことを明らかにした。さらに、開発したSNPS法によって、日本産(460系統)と外国産(212系統)のタイヌビエの地理的DNA変異を分析した。日本では1型の頻度が高く(53.9%、248系統)、近畿、四国、九州地方に多くある。2型は、1型に次いで頻度が高く(27.8%、128系統)、北海道と東日本に多くある。3a型の頻度は15.7%(72系統)であり、東北地方に多くある。3bの頻度は2.6%(12系統)である。4型はない。葉緑体DNA型の地理的分布が日本国内で異なっていることを明らかにした。また、中国、ミャンマー、タイ、フィリピンでは1型の頻度が高く、韓国では1型、2型と3型の頻度がほぼ同じである。また、栽培タイヌビエ(中国産)は1型であることを明らかにした。日本国内では1型は小穂C型に多くあり、2、3a、3b型はF型に多くある傾向も解明した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

日本国内でのタイヌビエの収集が順調に進んだことと、学内資金が採択され、十分な研究費によって収集調査と分析が効率に行えたことによる。

今後の研究の推進方策

未調査地でタイヌビエを収集し、新規材料についてSNPS分析を行う。
研究成果をまとめて投稿論文として公表する。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] 石川県から青森県までの日本海沿岸地域における帰化アサガオ類(Ipomoea spp.)の分布2012

    • 著者名/発表者名
      保田謙太郎
    • 雑誌名

      雑草研究

      巻: 57 ページ: 123~126

    • 査読あり
  • [学会発表] ヒエ属植物の地理的変異について2. 日本産タイヌビエの葉緑体DNA変異2013

    • 著者名/発表者名
      保田謙太郎・青木大輔・中山祐一郎・山口裕文
    • 学会等名
      日本雑草学会
    • 発表場所
      京都府京都市
    • 年月日
      20130413-20130414
  • [学会発表] タイヌビエの葉緑体DNAハプロタイプの地理的変異 東北と九州地域との比較2012

    • 著者名/発表者名
      保田謙太郎
    • 学会等名
      東北育種研究集会
    • 発表場所
      秋田県秋田市
    • 年月日
      20120820-20120820
  • [学会発表] ヒエ属植物の地理的変異について1. タイヌビエ小穂F-Cタイプの日本国内での分布2012

    • 著者名/発表者名
      保田謙太郎・中山祐一郎
    • 学会等名
      日本雑草学会
    • 発表場所
      茨城県つくば市
    • 年月日
      20120405-20120405

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公開日: 2014-07-24  

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