LysRタイプ転写調節因子による遺伝子発現調節機構と自己認識基盤の解明

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22580078
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用微生物学
• 研究機関: 静岡大学
• 研究代表者: 小川 直人 静岡大学, 農学部, 教授 (60354031)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: 遺伝子発現 / LysRタイプ転写調節因子 / 転写 / プロモーター

研究概要

細菌の転写調節因子で最大のグループを構成する LysR タイプ転写調節因子について、被制御プロモーターDNA 結合と誘導物質認識に重要なアミノ酸を明らかにして、立体構造との関係から転写活性化機構において重要な役割を果たすと考えられるアミノ酸を同定した。また、この転写因子とプロモーターDNA との共結晶作製のための系を構築、タンパク質精製法を確立することで、共結晶の作製、その立体構造の解明に先鞭をつけた。

研究成果

• [雑誌論文] Specific gene responses of a gram-positive polychlorinated- biphenyl degrader (2012)
  • 著者名/発表者名: Toju Iino, Yong Wang, Keisuke Miyauchi, Daisuke Kasai, Eiji Masai, Takeshi Fujii, Naoto Ogawa, and Masao Fukuda
  • 雑誌名: Rhodococcus jostiiRHA1 during growth in soil. Appl. Environ. Microbiol 巻: Vol.78 ページ: 6954-6962
  • 査読あり
• [雑誌論文] A survey of the cellular responses in Pseudomonas putida KT2440 growing in sterilized soil by microarray analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: Yong Wang, Sho Morimoto, Naoto Ogawa, and Takeshi Fujii
  • 雑誌名: FEMS Microbiol. Ecol. 巻: Vol.78 ページ: 220-232
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of a strain for efficient degradation of polychlorinated biphenyls by patchwork assembly of degradation pathways (2011)
  • 著者名/発表者名: Tsuneo Ohmori, Hirokazu Morita, Megumi Tanaka, Keisuke Miyauchi, Daisuke Kasai, Kensuke Furukawa, Kiyotaka Miyashita, Naoto Ogawa, Eiji Masai, and Masao Fukuda
  • 雑誌名: J. Biosci. Bioeng 巻: Vol.111 ページ: 437-442
  • 査読あり
• [雑誌論文] 日本土壌肥料学雑誌進歩総説「土壌生物」 (2011)
  • 著者名/発表者名: 佐伯和利、村上弘治、佐伯雄一、坂本一憲、村瀬潤、鮫島玲子、小川直人、浅川晋
  • 雑誌名: 日本土壌肥料学雑誌 巻: 第82巻 ページ: 479-494
• [学会発表] Analysis of CbnR, a bacterial LysR-type transcriptional regulator, indicates a conserved aspect of DNA binding and distinctive schemes of inducer recognition (2012)
  • 著者名/発表者名: Naoto Ogawa, Kaori Takada, Masae Takabayashi.
  • 学会等名: 日本微生物生態学会第28回大会
  • 発表場所: 豊橋技術科学大学
  • 年月日: 20120919-22
• [学会発表] Cupriavidus necatorNH9 株の LysR タイプ転写調節因子CbnR のDNA 結合領域の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 高田香織、下平潤、黒田直子、秋山絵弥子、千田俊哉、小川直人.
  • 学会等名: 日本農芸化学会
  • 発表場所: 震災の影響で要旨集の発刊をもって開催に代えた
  • 年月日: 2011-03-27
• [学会発表] Cupriavidus necatorNH9 株の LysR タイプ発現調節因子 CbnR の誘導物質認識部位の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 高林正恵、郎剛華、小川直人
  • 学会等名: 日本農芸化学会
  • 発表場所: 震災の影響で要旨集の発刊をもって開催に代えた
  • 年月日: 2011-03-27