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2011 年度 実績報告書

耐熱性DNA修復促進タンパク質の構造機構解析による実用化アプローチ

研究課題

研究課題/領域番号 22580098
研究機関独立行政法人日本原子力研究開発機構

研究代表者

鳴海 一成  独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究主幹 (90343920)

キーワード放射線 / 遺伝子 / 微生物 / タンパク質 / DNA修復 / 耐熱性
研究概要

放射線抵抗性細菌由来のDNA修復促進タンパク質PprAの構造解析を進め、PprAのホモポリマー形成に関わるアミノ酸残基に変異を導入し、ホモ2量体を形成するタンパク質変異体の結晶を用いて、2.5Å分解能のX線回折データを取得し、分子置換法により結晶構造解析に成功した。この構造をもとに、PprAのホモポリマー形成のモデルを構築した。このモデルでは、PprAがホモポリマーを形成したときタンパク質モノマー8分子で螺旋1回転し、その距離は約400から420Åであった。また、この螺旋構造の内側に正電荷を持つアミノ酸残基が集積していた。この結果から、PpfAタンパク質はDNAを取り巻くように結合し、上記の正電荷を持つアミノ酸が集積する領域がDNAとの結合ドメインを形成しているものと考えられた。一方、相同組換え修復経路で機能するRecF、RecO、RecRの機能解析を進め、RecFORタンパク質複合体の中でも、RecFタンパク質が組換え修復に一番重要で、相同組換え修復機構の初期過程において、相同組換え反応を司るRecAタンパク質の活性化を担っていることを明らかにした。また、RecRタンパク質は組換え反応の基質となるDNAの安定性に寄与していることが分かった。さらに、RecAタンパク質について、機能の類似性を評価するための方法を開発し、放射線抵抗性の好熱菌デイノコッカス・ジオサーマリス(Deinococcus geothermalis)、常温菌デイノコッカス・ラジオデュランス(Deinococcus radiodurans)並びに高度好熱菌サーマス・サーモフィルス(Thermus thermophilus)のRecAタンパク質の機能類似性を評価した。その結果、デイノコッカス・ジオサーマリスのRecAタンパク質をサーマス・サーモフィルスで発現させた場合に、十分に機能が発現するであろうことが予測できた。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

当初の計画通り、DNA修復促進タンパク質PprAの構造・機能について、分子遺伝学及び構造生物学的解析を実施した。これに加えて、組換え修復経路に関わるRecFORタンパク質複合体及びRecAタンパク質の機能性についての研究をとりまとめ、当初の計画以上に研究が進展した。

今後の研究の推進方策

DNA修復促進タンパク質PprAの野生型タンパク質に加えて変異型タンパク質を含めた生化学的解析を実施するとともに、高度好熱菌でのPprA遺伝子発現実験を行うことで、PprAタンパク質の構造・機能の解明及び応用に向けた研究を推進する。

  • 研究成果

    (17件)

すべて 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (13件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] The role of Deinococcus radiodurans RecFOR proteins in homologous recombination2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤勝也、菊地正博、Abu M. Ishaqu、大庭寛史、山田貢、手島光平、小野寺威文、鳴海一成
    • 雑誌名

      DNA Repair

      巻: 11巻 ページ: 410-418

    • DOI

      DOI:10.1016/j.dnarep.2012.01.008

    • 査読あり
  • [雑誌論文] In silico method to predict functional similarity between two RecA orthologs2011

    • 著者名/発表者名
      Haitham Sghaier、佐藤勝也、鳴海一成
    • 雑誌名

      J. Biomol. Screen

      巻: 16巻 ページ: 457-459

    • DOI

      DOI:10.1177/1087057111400909

  • [雑誌論文] 放射性抵抗性細菌2011

    • 著者名/発表者名
      小野寺威文
    • 雑誌名

      日本微生物生態学会誌

      巻: 26 ページ: 75-77

  • [学会発表] Analysis of radioresistant bacterium and its application2012

    • 著者名/発表者名
      Issay Narumi
    • 学会等名
      日本農芸化学会2012年度大会シンポジウム「特殊環境下における微生物の潜在能力とその応用」
    • 発表場所
      京都府、京都女子大学(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-26
  • [学会発表] 月における生命探査の可能性の検討2012

    • 著者名/発表者名
      横堀伸一
    • 学会等名
      第28回宇宙利用シンポジウム
    • 発表場所
      東京都、日本学術会議
    • 年月日
      2012-01-24
  • [学会発表] DeinococcusとThermusに共通する新規DNA修復遺伝子の機能解析2011

    • 著者名/発表者名
      小野寺威文
    • 学会等名
      第12回極限環境生物学会年会
    • 発表場所
      長崎市、長崎大学医学部
    • 年月日
      2011-11-27
  • [学会発表] 放射線抵抗性細菌と高度好熱菌のDNA修復におけるygjD及びyeaZオルソログの機能解析2011

    • 著者名/発表者名
      小野寺威文
    • 学会等名
      日本環境変異原学会第40回大会
    • 発表場所
      東京都、学術総合センター
    • 年月日
      2011-11-21
  • [学会発表] 放射線抵抗性細菌のygjD及びyeaZオルソログとDNA修復機構との関連性2011

    • 著者名/発表者名
      小野寺威文
    • 学会等名
      日本農芸化学会関東支部2011年度大会
    • 発表場所
      板倉町、東洋大学生命科学部
    • 年月日
      2011-10-15
  • [学会発表] 放射線抵抗性細菌のDNA修復機構におけるygjDlyeaZ遺伝子ファミリーの役割2011

    • 著者名/発表者名
      小野寺威文
    • 学会等名
      第6回高崎量子応用研究シンポジウム
    • 発表場所
      高崎市、高崎シティーギャラリー
    • 年月日
      2011-10-13
  • [学会発表] 放射線抵抗性細菌の遺伝子破壊株における異なるLET放射線に対する致死効果2011

    • 著者名/発表者名
      佐藤勝也
    • 学会等名
      第6回高崎量子応用研究シンポジウム
    • 発表場所
      高崎市、高崎シティーギャラリー
    • 年月日
      2011-10-13
  • [学会発表] 生物の乾燥耐性と放射線耐性2011

    • 著者名/発表者名
      鳴海一成
    • 学会等名
      新世代研究所バイオ単分子・水和ナノ構造合同研究会
    • 発表場所
      箱根町、パウエル箱根
    • 年月日
      2011-09-22
  • [学会発表] 生命と放射線耐性2011

    • 著者名/発表者名
      鳴海一成
    • 学会等名
      諏訪シンポジウム「生命現象素過程の時空間軸上への展開と統合」
    • 発表場所
      諏訪市、かんぽの宿諏訪(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-29
  • [学会発表] Capture and space exposure experiments of microorganisms on the ISS orbit proposed in "TANPOPO" mission2011

    • 著者名/発表者名
      Shin-ichi Yokobori
    • 学会等名
      11th European Workshop on Astrobiology (EANA2011)
    • 発表場所
      Cologne, Germany
    • 年月日
      2011-07-12
  • [学会発表] 機能未知ygjDlyeaZ遺伝子ファミリーの機能解析2011

    • 著者名/発表者名
      小野寺威文
    • 学会等名
      変異機構研究会第24回夏の学校
    • 発表場所
      小牧市、愛知県小牧勤労センター
    • 年月日
      2011-07-10
  • [学会発表] たんぽぽ計画における蛍光染色法によるエアロゲル内の微生物検出2011

    • 著者名/発表者名
      杉野朋弘
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合2011年大会
    • 発表場所
      幕張市、幕張メッセ
    • 年月日
      2011-05-23
  • [学会発表] 「タンポポ」計画における国際宇宙ステーション上での微生物暴露実験2011

    • 著者名/発表者名
      横堀伸一
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合2011年大会
    • 発表場所
      幕張市、幕張メッセ
    • 年月日
      2011-05-23
  • [備考]

    • URL

      http://www.taka.jaea.go.jp/rab_div/grr/index_j.html

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公開日: 2013-06-26  

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