固形癌の早期局在診断に有用な膜タンパク質のプロテオーム解析

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22590545
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 病態検査学
• 研究機関: 独立行政法人医薬基盤研究所
• 研究代表者: 久米 秀明 独立行政法人医薬基盤研究所, 創薬基盤研究部, 研究員 (50322714)
• 研究分担者: 朝長 毅 独立行政法人医薬基盤研究所, 創薬基盤研究部, プロジェクトリーダー (80227644) ; 松原 久裕 千葉大学, 医学(系)・研究科(研究院), 教授 (20282486) ; 石濱 泰 京都大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (30439244)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: 腫瘍検査学

研究概要

大腸癌バイオマーカータンパク質の同定を目的として、大腸癌患者組織から調製した膜画分の大規模な網羅的定量解析とその検証をおこなった。同定された5566種類のタンパク質の中で、5287個が遺伝子オントロジー解析により注釈付けされ、3087個は膜に局在することが推定された。また、TMHMM解析により、1567個のタンパク質は膜貫通ドメインを有する膜タンパク質であることが推定された。同定タンパク質には、ポリープと癌組織、または転移のない癌組織と転移のある癌組織間で発現量に有意な差のあるタンパク質が、100種類以上含まれていた。そうしたバイオマーカー候補タンパク質の中の105個について、SRM法を用いて検証した結果、78個は、SRM法でも癌の悪性化に伴う有意な発現変化が確認された。2つの候補タンパク質protein-Xと-Yについては、ウェスタンブロット法や免疫組織染色法を用いた検証もおこなった。さらに14種類の癌組織を含む組織アレイ解析により、protein-Xと-Yは、大腸癌だけでなく、胃癌や乳癌、前立腺癌でも高発現していることが示されたことから、大腸癌だけでなく、他の癌においても有用なバイオマーカーとなる可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] In-depth Membrane Proteomic Study of Breast Cancer Tissues for the Generation of a Chromosome-based Protein List (2012)
  • 著者名/発表者名: Muraoka S, Kume H, Adachi J, Shiromizu T, Watanabe S, Masuda T, Ishihama Y, Tomonaga T
  • 雑誌名: J Proteome Res 巻: 12(1) ページ: 208-13
  • DOI: DOI:10.1021/pr300824m
• [雑誌論文] A strategy for large-scale phosphoproteomics and SRM-based validation of human breast cancer tissue samples (2012)
  • 著者名/発表者名: Narumi R, Murakami T, Kuga T, Adachi J, Shiromizu T, Muraoka S, Kume H, Kodera Y, Matsumoto M, Nakayama K, Miyamoto Y, Ishitobi M, Inaji H, Kato K, Tomonaga T
  • 雑誌名: J Proteome Res 巻: 11(11) ページ: 5311-22
  • DOI: DOI:10.1021/pr3005474
• [雑誌論文] Strategy for SRM-based verification of biomarker candidates discovered by iTRAQ method in limited breast cancer tissue samples (2012)
  • 著者名/発表者名: Muraoka S, Kume H, Watanabe S, Adachi J, Kuwano M, Sato M, Kawasaki N, Kodera Y, Ishitobi M, Inaji H, Miyamoto Y, Kato K, Tomonaga T
  • 雑誌名: J Proteome Res 巻: 11(8) ページ: 4201-10
  • DOI: DOI:10.1021/pr300322q
• [学会発表] 大規模プロテオーム解析による大腸癌バイオマーカーの探索とその検証 (2012)
  • 著者名/発表者名: 久米秀明、村岡賢、小寺義男、松下一之、松原久裕、朝長毅
  • 学会等名: 第71回日本癌学会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2012-09-21
• [学会発表] 大腸癌組織膜タンパク質の大規模プロテオーム解析によるバイオマーカー探索とその検証 (2012)
  • 著者名/発表者名: 久米秀明、渡邊史生、村岡賢、石濱泰、小寺義男、松下一之、松原久裕、朝長毅
  • 学会等名: 第10回日本プロテオーム学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2012-07-26
• [学会発表] 大腸癌組織膜タンパク質の大規模プロテオーム解析によるバイオマーカー探索とSRM/MRM法を用いた定量法の確立および診断への応用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久米秀明, 鳴海良平, 渡邉史生,石濱泰, 松原久裕, 小寺義男, 福岡順也, 朝長毅
  • 学会等名: 第34回分子生物学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] 膜タンパク質の大規模プロテオーム解析による大腸癌バイオマーカーの探索とSRM法を用いた検証 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久米秀明, 松原久裕, 小寺義男, 朝長毅
  • 学会等名: 第70回日本癌学会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2011-10-04
• [学会発表] 大腸癌バイオマーカーとなる膜タンパク質の大規模プロテオーム解析とSRMによる検証 (2011)
  • 著者名/発表者名: 久米秀明, 鳴海良平, 渡邉史生,石濱泰, 松原久裕, 小寺義男, 朝長毅
  • 学会等名: 第9回日本プロテオーム学会
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 2011-07-28
• [学会発表] 大腸癌の新たなバイオマーカーとなる膜タンパク質の探 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久米秀明, 鳴海良平, 石濱泰, 松原久裕, 松下一之, 野村文夫,朝長毅
  • 学会等名: 第33回分子生物学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-04
• [学会発表] 大腸癌組織膜タンパク質のプロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久米秀明, 松原久裕, 松下一之,野村文夫,朝長毅
  • 学会等名: 第69回日本癌学会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-09-24
• [学会発表] 大腸癌組織膜タンパク質のプロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久米秀明、鳴海良平、石濱泰、松原久裕、松下一之、野村文夫、朝長毅
  • 学会等名: 第8回日本プロテオーム学会
  • 発表場所: 舞浜
  • 年月日: 2010-07-27
• [産業財産権] 大腸がんの判定方法 (2012)
  • 発明者名: 朝長毅、久米秀明
  • 権利者名: 独立行政法人医薬基盤研究所
  • 産業財産権番号: 特許
  • 出願年月日: 2012-12-17