三連四重極型質量分析計による尿バイオマーカーのハイスループット多項目同時定量

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22590881
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 腎臓内科学
• 研究機関: 新潟大学
• 研究代表者: 吉田 豊 新潟大学, 医歯学系, 講師 (40182795)
• 研究分担者: 山本 格 新潟大学, 医歯学系, 教授 (30092737)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: 腎臓学 / 尿バイオマーカー

研究概要

尿のプロテオミクス解析と、尿に出現する糸球体局在タンパク質の探索により、尿細管傷害マーカー(NGAL、 L-FABP、 KIM-1、 Megalin)、糸球体傷害マーカー(podocalyxin、 SHPS-1、 Crumbs-like protein 2)をバイオマーカーとして選択し、三連四重極型質量分析計のSRMモードで定量するための条件を決定し、同時多項目定量法の至適化を行うところまで到達した。

研究成果

• [雑誌論文] Profiling and annotation of human kidney glomerulus proteome (2013)
  • 著者名/発表者名: Cui Z, Yoshida Y, Xu B, Zhang Y, Nameta M, Magdeldin S, Makiguchi T, Ikoma T, Fujinaka H, Yaoita E, Yamamoto T
  • 雑誌名: Proteome Sci 巻: 11 ページ: 13
  • DOI: doi:10.1186/1477-5956-11-13
  • 査読あり
• [雑誌論文] Profiling of kidney vascular endothelial cell plasma membrane proteins by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (2012)
  • 著者名/発表者名: Liu Z, Xu B, Nameta M, Zhang Y, Magdeldin S, Yoshida Y, Yamamoto K, Fujinaka H, Yaoita E, Tasaki M, Nakagawa Y, Saito K, Takahashi K, Yamamoto T
  • 雑誌名: Clin Exp Nephrol
  • DOI: doi:10.1007/s10157-012-0708-1
  • 査読あり
• [雑誌論文] Murine colon proteome and characterization of the protein pathways (2012)
  • 著者名/発表者名: Magdeldin S, Yoshida Y, Li H, Maeda Y, Yokoyama M, Enany S, Zhang Y, Xu B, Fujinaka H, Yaoita E, Sasaki S, Yamamoto T
  • 雑誌名: BioData Min 巻: 5 ページ: 11
  • DOI: doi:10.1186/1756-0381-5-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteomic approach to human kidney glomerulus prepared by laser microdissection from frozen biopsy specimens: exploration of proteome after removal of blood-derived proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Y, Nameta M, Kuwano M, Zhang Y, Bo X, Magdeldin S, Cui Z, Fujinaka H, Yaoita E, Tomonaga T, Yamamoto T
  • 雑誌名: Proteomics Clin Appl 巻: 6 ページ: 412-417
  • DOI: doi:10.1002/prca.201200016
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of human glomerulus proteomic profiles obtained from low quantities of samples by different mass spectrometry with the comprehensive database (2011)
  • 著者名/発表者名: Zhang Y, Yoshida Y, Xu B, Magdeldin S, Fujinaka H, Liu Z, Miyamoto M, Yaoita E, Yamamoto T
  • 雑誌名: Proteome Sci 巻: 9 ページ: 47
  • DOI: doi:10.1186/1477-5956-9-47
  • 査読あり
• [雑誌論文] Usage of electrostatic eliminator reduces human keratin contamination significantly in gel-based proteomics analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: Xu B, Zhang Y, Zhao Z, Yoshida Y, Magdeldin S, Fujinaka H, Ismail TA, Yaoita E, Yamamoto T
  • 雑誌名: J Proteomics 巻: 74 ページ: 1022-10299
  • DOI: doi:10.1016/j.jprot.2011.03.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel expression of claudin-5 in glomerular podocytes (2011)
  • 著者名/発表者名: Koda R, Zhao L, Yaoita E, Yoshida Y, Tsukita S, Tamura A, Nameta M, Zhang Y, Fujinaka H, Magdeldin S, Xu B, Narita I, Yamamoto T
  • 雑誌名: Cell Tissue Res 巻: 343(3) ページ: 637-48
  • DOI: doi:10.1007/s00441-010-1117-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differential proteomic shotgun analysis elucidates involvement of water channel aquaporin 8 in presence of α-amylase in the colon (2010)
  • 著者名/発表者名: Magdeldin S, Li H, Yoshida Y, Satokata I, Maeda Y, Yokoyama M, Enany S, Zhang Y, Xu B, Fujinaka H, Yaoita E, Yamamoto T
  • 雑誌名: J Proteome Res 巻: 9 ページ: 6635-46
  • DOI: doi:10.1021/pr100789v
  • 査読あり
• [学会発表] Increased identification of low-abundance, insoluble proteins of glomerulus laser-microdissected from frozen tissue sections exposed to repeated PBS washing (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Y et al
  • 学会等名: 第11回国際ヒトプロテオーム機構学術集会
  • 発表場所: ボストン(アメリカ合衆国)
  • 年月日: 20120909-13
• [学会発表] HKUPP: Human Kidney andUrine Proteome Project (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉田 豊
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2012年大会(第10回日本ヒト プロテオーム機構)
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20120726-27
• [学会発表] 凍結腎生検試料からLaser microdissectionにより調製した糸球体のプロテオーム解析:血液由来タンパク質の除去 (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉田豊他
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2012年大会(第10回日本ヒトプロテオーム機構)
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 20120726-27
• [学会発表] Extensive profiling of human urine proteome: construction of SRM transitions for quantification of urinary biomarkers for acute and chronic kidney diseases (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Y et al
  • 学会等名: 第10回国際ヒトプロテオーム機構学術集会
  • 発表場所: ジュネーブ(スイス連邦)
  • 年月日: 20110904-07
• [学会発表] 正常ヒト尿プロテオームの特徴:AKIバイオマーカーの多項目同時測定の基礎的検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉田豊他
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会2011年大会(第9回日本ヒトプロテオーム機構)
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 20110728-30
• [学会発表] Verification and standardization of comparative proteome analysis of human glomeruli prepared by laser microdissectionfrom frozen block (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshida Y
  • 学会等名: 第9回国際ヒトプロテオーム機構学術集会
  • 発表場所: シドニー(オーストラリア連邦)
  • 年月日: 20100919-23
• [学会発表] Laser microdissectionとLC-MSを用いた腎生検試料の糸球体プロテオーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉田豊他
  • 学会等名: 第53回日本腎臓学会学術総会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 20100616-18
• [備考]
  • URL: http://hkupp.kir.jp