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2012 年度 実績報告書

若年性骨髄単球性白血病と小児骨髄異形成症候群の網羅的ゲノム・エピゲノム解析

研究課題

研究課題/領域番号 22591171
研究機関群馬県衛生環境研究所

研究代表者

外松 学  群馬県衛生環境研究所, その他部局等, 研究員 (70251113)

研究分担者 林 泰秀  群馬県衛生環境研究所, その他部局等, 研究員 (30238133)
大木 健太郎  群馬県衛生環境研究所, その他部局等, 研究員 (50400966)
朴 明子  群馬県衛生環境研究所, その他部局等, 研究員 (50450375)
研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2013-03-31
キーワード遺伝子 / ゲノム / マイクロアレイ / 癌 / 臨床
研究概要

Juvenile myelomonocytic leukemia(JMML)と小児myelodysplastic syndrome(MDS)に対して、Affymetrixのゲノムとエピゲノムのアレイを用いた網羅的解析により候補遺伝子を抽出し、発症、進展に関与する遺伝子をみい出す。近年、成人の急性骨髄性白血病(AML)とMDSでASXL1、IDH1、IDH2、DNAメチルトランスフェラーゼ3A(DNMT3A)遺伝子等の変異がみられ、予後と相関することが報告された。昨年度は、polycomb関連遺伝子のASXL1遺伝子とDNAメチル化に関与するIDH1、IDH2、DNMT3A遺伝子についての検討を行った。今年度はJMML 40例とMDS 20例、AML 157例とALL 30例および白血病細胞株 20株でPCR法と直接塩基決定法にてSETBP1とGATA2遺伝子変異の有無の解析を行った。SETBP1遺伝子変異はJMML 40例の検討では、3例(7.5%) にみられ、これらの症例はPTPN11やRAS遺伝子の変異はみられず、SETBP1遺伝子はJMMLの原因遺伝子の1つであることが示唆された。SETBP1遺伝子変異はAMLとALLではみられなかった。またGATA2遺伝子の変異はJMML、MDS、ALLと白血病細胞株ではみられなかった。SETBP1遺伝子の高発現は成人のAMLでは予後不良とされ、その変異は成人の非定型的骨髄増殖症では約20%に変異がみられると報告されているが、JMMLではまだ報告がない。今回の結果は、SETBP1遺伝子の変異はJMMLの一部の発症と進展に関与するものと思われた。またGATA2遺伝子はこれらの疾患に関与しないものと思われた。現在、CSF3R遺伝子の解析を予定している。

現在までの達成度 (区分)
理由

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (55件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 14件) 学会発表 (41件)

  • [雑誌論文] Cytomegalovirus retinitis during maintenance therapy for T-cell acute lymphoblastic leukemia.2013

    • 著者名/発表者名
      Wakai K, et al.
    • 雑誌名

      J Pediatr Hematol Oncol

      巻: 35 ページ: 162-163

    • DOI

      doi: 10.1097/MPH.0b013e318279e920

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Novel splicing factor mutations in juvenile myelomonocytic leukemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Takita J, Yoshida K, Sanada M, Nishimura R, Okubo J, Motomura A, Hiwatari M, Oki K, Igarashi T, Hayashi Y, Ogawa S
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 26 ページ: 1879-1898

    • DOI

      doi: 10.1038/leu.2012.45

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Naturally occurring oncogenic GATA1 mutants with internal deletions in transient abnormal myelopoiesis in Down syndrome.2012

    • 著者名/発表者名
      Toki T, et al.
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 12 ページ: 3181-3184

    • DOI

      doi: 10.1182/blood-2012-01-405746

    • 査読あり
  • [雑誌論文] An Inv(16)(p13.3q24.3)-encoded CBFA2T3-GLIS2 fusion protein defines an aggressive subtype of pediatric acute megakaryoblastic leukemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Gruber TA, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Cell.

      巻: 22 ページ: 683-697

    • DOI

      doi: 10.1016/j.ccr.2012.10.007

    • 査読あり
  • [雑誌論文] High WT1 mRNA expression after induction chemotherapy and FLT3-ITD have prognostic impact in pediatric acute myeloid leukemia: a study of the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group.2012

    • 著者名/発表者名
      Shimada A, et al.
    • 雑誌名

      Int J Hematol

      巻: 96 ページ: 469-476

    • DOI

      doi: 10.1007/s12185-012-1163-1

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Somatic mosaicism for oncogenic NRAS mutations in juvenile myelomonocytic leukemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Doisaki S, et al.
    • 雑誌名

      Blood.

      巻: 120 ページ: 1485-1488

    • DOI

      doi: 10.1182/blood-2012-02-406090

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Childhood acute myeloid leukemia with bone marrow eosinophilia caused by t(16;21)(q24;q22).2012

    • 著者名/発表者名
      Kawashima N, et al.
    • 雑誌名

      Int J Hematol.

      巻: 95 ページ: 577-580

    • DOI

      doi: 10.1007/s12185-012-1044-7

    • 査読あり
  • [雑誌論文] RAS mutations are frequent in FAB type M4 and M5 of acute myeloid leukemia, and related to late relapse: a study of the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group.2012

    • 著者名/発表者名
      Sano H, et al.
    • 雑誌名

      Int J Hematol

      巻: 95 ページ: 509-515

    • DOI

      doi: 10.1007/s12185-012-1033-x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of TRIB1 R107L gain-of-function mutation in human acute megakaryocytic leukemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama T, et al.
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 119 ページ: 2608-2611

    • DOI

      doi: 10.1182/blood-2010-12-324806

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Aberrant activation of ALK kinase by a novel truncated form ALK protein in neuroblastoma.2012

    • 著者名/発表者名
      Okubo J, et al.
    • 雑誌名

      Oncogene.

      巻: 31 ページ: 4667-4676

    • DOI

      doi: 10.1038/onc.2011.616

    • 査読あり
  • [雑誌論文] CBL mutation in chronic myelomonocytic leukemia secondary to familial platelet disorder with propensity to develop acute myeloid leukemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 119 ページ: 2612-2614

    • DOI

      doi: 10.1182/blood-2011-02-333435

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clinical significance of early T-cell precursor acute lymphoblastic leukaemia: Results of the Tokyo Children’s Cancer Study Group Study L99-15.2012

    • 著者名/発表者名
      Inukai T, et al.
    • 雑誌名

      Brit J Haematol

      巻: 156 ページ: 358-365

    • DOI

      doi: 10.1111/j.1365-2141.2011.08955.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNMT3A mutations are rare in childhood acute myeloid leukaemia, myelodysplastic syndromes and juvenile myelomonocytic leukaemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 雑誌名

      Br J Haematol

      巻: 156 ページ: 413-414

    • DOI

      doi: 10.1111/j.1365-2141.2011.08900.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] CBL mutations in infant acute lymphoblastic leukaemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 雑誌名

      Br J Haematol

      巻: 156 ページ: 672-674

    • DOI

      doi: 10.1111/j.1365-2141.2011.08900.x

    • 査読あり
  • [学会発表] 先端的ゲノムスキャニングを用いた難治性小児固形腫瘍における標的分子の探索.

    • 著者名/発表者名
      滝田順子, 他
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] 次世代シークエンサーを用いた神経芽腫のエクソーム解析.

    • 著者名/発表者名
      西村力, 他.
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたEwing肉腫のエクソーム解析.

    • 著者名/発表者名
      大久保純, 他
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] 発現アレイを用いた小児急性骨髄性白血病における、NUP98-NSD1融合遺伝子の解析.

    • 著者名/発表者名
      柴 徳生, 他
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] TCCSGの小児B前駆細胞型急性リンパ性白血病におけるCRLF2とIKZF1、JAK遺伝子解析.

    • 著者名/発表者名
      大木健太郎, 他
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] 第2再発時に初めてMLL-AF4陽性となったB前駆型急性リンパ性白血病1例におけるクローン構造の検討.

    • 著者名/発表者名
      大木健太郎, 他
    • 学会等名
      第8回北関東小児がんセミナー
    • 発表場所
      高崎
  • [学会発表] TAMに合併する肝機能障害について.

    • 著者名/発表者名
      朴 明子, 他
    • 学会等名
      第48回日本周産期・新生児医学会学術集会
    • 発表場所
      さいたま
  • [学会発表] 2遺伝子の発現に基づく高リスク小児急性骨髄性白血病の同定.

    • 著者名/発表者名
      三谷幸代, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] BLNK欠損preB-ALLとB細胞分化におけるC/Ebpbの働き.

    • 著者名/発表者名
      倉田盛人, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] 神経芽腫におけるエピジェネティック関連遺伝子の網羅的ゲノム解析

    • 著者名/発表者名
      星野諭子, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] 全エクソーム解析による小児急性骨髄性白血病の新規発症原因遺伝子変異の同定,

    • 著者名/発表者名
      柴 徳生, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] 次世代シーケンサーによる再発肺芽腫のエクソーム解析.

    • 著者名/発表者名
      関 正史, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] SNPアレイをエクソーム解析を用いた横紋筋肉腫の初発・再発/転移巣のクローン比較.

    • 著者名/発表者名
      西村 力, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたユーイング肉腫発生の分子生物学的検討.

    • 著者名/発表者名
      樋渡光輝, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] Fusion gene-specific signature of microRNR expression in childhood ALL.

    • 著者名/発表者名
      Kiyokawa N, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] Gene expression profile related to prognosis of childhood ALL without fusion genes.

    • 著者名/発表者名
      Iijima K, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] IL-7R gene mutations in childhood T-cell acute lymphoblastic leukemia.

    • 著者名/発表者名
      Park MJ, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] Analysisi of CRLF2 and IKZF1, JAK, IL7R genes in pediatric B-precursor ALL treated on TCCSG protocol.

    • 著者名/発表者名
      Oki K, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] JAK2 V617F mutation in pediatric myeloproliferative neoplasm.

    • 著者名/発表者名
      Shimada A, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] Clonal architecture and evolution of pediatric AML.

    • 著者名/発表者名
      Okuno Y, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] Whole exome resequencing reveals novel gene mutations in pediatric AML.

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] Characteristics and prognostic impacts of structural chromosomal abnormalities in childhood ALL.

    • 著者名/発表者名
      Takahashi H, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] NUP98-NSD1 related gene expression signature is associated with a poor prognosis in pediatric AML.

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] 小児B前駆細胞型急性リンパ性白血病におけるclonal evolutionの解析.

    • 著者名/発表者名
      大木健太郎,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 進行期T細胞性リンパ芽球性リンパ腫の染色体異常解析―JPLSGからの報告.

    • 著者名/発表者名
      関水匡大,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 先端的ゲノム解析技術を用いた胸膜肺芽腫における発症分子機構の解明.

    • 著者名/発表者名
      関 正史,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] MLPA法を用いたT-ALL遺伝子異常についての解析.

    • 著者名/発表者名
      朴 明子,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] t(17;19)(q22;p13.3)を含む染色体異常を呈したT細胞性急性リンパ性白血病の1例.

    • 著者名/発表者名
      西 眞範,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 神経芽腫におけるエピジェネティック関連遺伝子の網羅的ゲノム解析

    • 著者名/発表者名
      星野諭子,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 神経芽腫における網羅的メチル化解析

    • 著者名/発表者名
      関 正史,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 全エクソーム解析による小児急性骨髄性白血病の新規発症原因遺伝子変異の同定

    • 著者名/発表者名
      柴 徳生,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 小児急性骨髄性白血病におけるGATA2遺伝子変異同定.

    • 著者名/発表者名
      柴 徳生,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] TAM芽球におけるCD117発現と末梢血中芽球割合の相関.

    • 著者名/発表者名
      出口隆生,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] ダウン症候群に合併した一過性骨髄異常増殖症に対する少量シタラビン療法による腫瘍崩壊症候群.

    • 著者名/発表者名
      村松秀城,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 小児骨髄増殖疾患におけるJAK2V617F遺伝子変異.

    • 著者名/発表者名
      嶋田 明,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] CD66c陽性小児急性リンパ芽球性白血病の特徴.

    • 著者名/発表者名
      富田 理,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 小児リンパ腫における遺伝子異常の解析.

    • 著者名/発表者名
      大木健太郎,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 次世代シーケンサとSNPアレイを用いた横紋筋肉腫3例における初発/再発・転移巣の比較.

    • 著者名/発表者名
      西村 力,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] NUP98-NSD1 related gene expression signature is strongly associated with a poor prognosis in pediatric acute myeloid leukemia.,

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      54rd Annual Meeting of the American Society of Hematology
    • 発表場所
      Atlanta
  • [学会発表] Shiba N, et al.

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      54rd Annual Meeting of the American Society of Hematology
    • 発表場所
      Atlanta
  • [学会発表] Whole exome sequencing reveals spectrum of gene mutations in pediatric AML.

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      54rd Annual Meeting of the American Society of Hematology
    • 発表場所
      Atlanta

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公開日: 2014-07-24  

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