• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2010 年度 実績報告書

アクチンフィラメントの分子構造ダイナミクス解析によるメカノセンサー機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 22616002
研究機関京都大学

研究代表者

井上 康博  京都大学, 工学研究科, 助教 (80442929)

研究分担者 安達 泰治  京都大学, 再生医科学研究所, 教授 (40243323)
北條 正樹  京都大学, 工学研究科, 教授 (70252492)
キーワードアクチン / 分子構造ダイナミクス / 熱ゆらぎ / メカノセンサー / メカノバイオロジー
研究概要

アクチンフィラメントには,アクチン脱重合因子コフィリンの結合そのものが,フィラメントに作用する張力によって調節されるメカノセンサーとしての機能が存在する.メカノセンサーの作動機構は,力学的場における熱ゆらぎスケールの分子構造ダイナミクスに関連すると考えられる.本研究は,このメカノセンサーの実体について,アクチンフィラメントの分子構造ダイナミクスの観点から迫るものである.本年度は,これまでに我々が構築してきたアクチンフィラメントの全原子動力学モデルを用い,熱平衡状態におけるアクチンフィラメントの分子構造ゆらぎを評価した.その結果,アクチンフィラメントは,ナノ秒の時間スケールにおいて,様々な準安定構造を経巡ることがわかった.特に,フィラメントの捻り方向のゆらぎは,詳細な時間・空間スケールに迫るほど,離散的な角度変化となることが観察された.さらに伸長方向と捻り方向のゆらぎがカップリングしている可能性があることが示唆された.巨視的な時間スケールにおけるタンパク質問結合を分子構造ダイナミクスから考察するため,統計物理学を用いた理論モデルを構築した.理論モデルによる予測の結果,捻り方向の構造変化は,結合親和性を表す化学ポテンシャルを変化させることが示唆された.これらの成果は,J.Biomech.などの査読論文誌として4報,招待講演1件により発表された

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Coarse-grained Brownian ratchet model of membrane protrusion on cell ular scale2011

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Inoue, Taiji Adachi
    • 雑誌名

      Biomechanics and Modeling in Mechanobiology

      巻: (印刷中)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Simulation of dynamics of actin filaments by remodeling them in shear flows2010

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Inoue, Takeji Deji, Yoshitaka Shimada, Masaki Hojo, Taiji Adachi
    • 雑誌名

      Computers in Biology and Medicine

      巻: 40 ページ: 876-882

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of Extensional and Torsional Stiffness of Single Actin Filaments by Molecular Dynamics Analysis2010

    • 著者名/発表者名
      Shinji Matsushita, Taiji Adachi, Yasuhiro Inoue, Masaki Hojo, Masahiro Sokabe
    • 雑誌名

      Journal of Biomechanics

      巻: 43 ページ: 3162-3167

    • 査読あり
  • [雑誌論文] アクチンフィラメントに対する結合タンパク質分子の接近挙動解析2010

    • 著者名/発表者名
      安達泰治, 島田義孝, 井上康博, 北條正樹
    • 雑誌名

      日本機械学会論文集

      巻: 76 ページ: 1119-1127

    • 査読あり
  • [学会発表] Theoretical Study on Mechanochemical Modulation of Binding between Actin and its Accessory Proteins : A Thermodynamic Perspective2010

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Inoue
    • 学会等名
      6^<th> World Congress on Biomechanics
    • 発表場所
      シンガポールSuntec Convention Center(招待講演)
    • 年月日
      2010-08-03

URL: 

公開日: 2012-07-19  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi