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2011 年度 研究成果報告書

Protein Folding Codonによるタンパク質機能調節機構の解明

研究課題

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研究課題/領域番号 22655057
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 生体関連化学
研究機関甲南大学

研究代表者

杉本 直己  甲南大学, フロンティアサイエンス学部, 教授 (60206430)

研究分担者 遠藤 玉樹  甲南大学, 先端生命工学研究所, 講師 (90550236)
長門石 曉  甲南大学, 先端生命工学研究所, 助教 (30550248)
研究期間 (年度) 2010 – 2011
キーワードProtein Folding Codon / 翻訳速度 / mRNA高次構造 / 熱力学的安定性 / タンパク質構造 / 分子クラウディング
研究概要

本研究では、翻訳の伸長反応に焦点をあて、反応の進行を継時的に解析できる手法を確立した。その手法を適用した結果、mRNA中に存在するレアコドン(存在比率が低いコドン)や安定なRNA構造が、翻訳伸長反応を停滞させることを見出した。また、核酸結合タンパク質による核酸の熱安定性への寄与を定量的に解析した。これらの結果は、mRNAの構造安定性や、タンパク質の結合に伴うRNA構造の安定性変化が、翻訳伸長反応への影響を介してタンパク質の構造にまで影響を及ぼす可能性を示している。さらに、転写により産生されるmRNAの熱安定性と転写反応産物量との相関についても明らかにした。

  • 研究成果

    (24件)

すべて 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (16件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] The yield of transcripts for RNA polymerase regulated by hairpin structures in nascent RNA2012

    • 著者名/発表者名
      S. Nagatoishi, R. Ono, and N. Sugimoto
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: 48 ページ: 5121-5123

    • DOI

      DOI:10.1039/c2cc31657a

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synchronized Translation for Detection of Temporal Stalling of Ribosome during Single-Turnover Translation2012

    • 著者名/発表者名
      T. Endoh, Y. Kawasaki and N. Sugimoto
    • 雑誌名

      Anal. Chem.

      巻: 84 ページ: 857-861

    • DOI

      DOI:10.1021/ac202712g

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hydration is required in DNA G-quadruplex-protein binding2011

    • 著者名/発表者名
      S. Nagatoishi, N. Isono, K. Tsumoto, N. Sugimoto
    • 雑誌名

      Chem. BioChem

      巻: 12 ページ: 1822-1826

    • DOI

      DOI:10.1002/cbic.201100264

    • 査読あり
  • [雑誌論文] ポストゲノム時代の生命化学と次世代スパコン2011

    • 著者名/発表者名
      杉本直己
    • 雑誌名

      化学

      巻: 4 ページ: 31-33

  • [雑誌論文] Loop residues of thrombin-binding DNA aptamer impact G-quadruplex stability and thrombin binding2011

    • 著者名/発表者名
      S. Nagatoishi, N. Isono, K. Tsumoto, and N. Sugimoto
    • 雑誌名

      Biochimie

      巻: 93 ページ: 1231-1238

    • DOI

      DOI:10.1016/j.biochi.2011.03.013

    • 査読あり
  • [雑誌論文] タンパク質の合成を制御する環境-分子クラウディングによる時間概念2010

    • 著者名/発表者名
      杉本直己、遠藤玉樹
    • 雑誌名

      現代化学

      巻: 472 ページ: 26-31

  • [学会発表] 天然mRNAの翻訳領域におけるRNA四重鎖の形成2012

    • 著者名/発表者名
      川崎悠・遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      日本化学会第91春季年会
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      20120326-29
  • [学会発表] 天然mRNAの翻訳領域中に形成されるRNA四重鎖構造を介した翻訳伸長反応の抑制2012

    • 著者名/発表者名
      遠藤玉樹・川崎悠・杉本直己
    • 学会等名
      日本化学会第91春季年会
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      20120326-29
  • [学会発表] 標的核酸や核酸医薬の構造と機能に及ぼす分子環境の影響2012

    • 著者名/発表者名
      杉本直己
    • 学会等名
      第9回分子複合医薬研究会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2012-03-07
  • [学会発表] 天然mRNAのグアニンリッチ配列によるRNA四重鎖構造を介した翻訳伸長反応の抑制2011

    • 著者名/発表者名
      川崎悠・遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      第6回無細胞生命科学研究会
    • 発表場所
      兵庫
    • 年月日
      20111116-17
  • [学会発表] Role of hydration effect in interaction between DNA G-quadruplex and thrombin2011

    • 著者名/発表者名
      S. Nagatoishi, N. Isono and N. Sugimoto
    • 学会等名
      The 38th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2011
    • 発表場所
      Hokkaido
    • 年月日
      20111109-11
  • [学会発表] RNAのhairpin構造形成による転写活性変化2011

    • 著者名/発表者名
      小野領也・長門石曉・杉本直己
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      茨城
    • 年月日
      20110912-14
  • [学会発表] Synchrinized translationによるmRNA構造と翻訳反応の相関評価2011

    • 著者名/発表者名
      川崎悠・遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      茨城
    • 年月日
      20110912-14
  • [学会発表] Effect of Loop residues of thrombin-binding DNA aptamer on its G-quadruplex stability and thrombin binding2011

    • 著者名/発表者名
      S. Nagatoishi, N. Isono, and N. Sugimoto
    • 学会等名
      4th European Conference on Chemistry for Life Sciences
    • 発表場所
      Hungary
    • 年月日
      20110831-0903
  • [学会発表] Interaction of DNA G-quadruplex with Water, Cations, and its Binding Protein2011

    • 著者名/発表者名
      N. Sugimoto
    • 学会等名
      The 3rd International Meeting on G-Quadruplex and G-assembly(招待講演)
    • 発表場所
      Italy
    • 年月日
      20110628-0701
  • [学会発表] Thrombin結合によるDNA四重鎖構造の安定化メカニズムの解明2011

    • 著者名/発表者名
      長門石曉・磯野伸・津本浩平・杉本直己
    • 学会等名
      日本化学会第91春季年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20110326-29
  • [学会発表] mRNAの高次構造が影響する翻訳伸長反応の解析手法の構築2011

    • 著者名/発表者名
      川崎悠・遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      日本化学会第91春季年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20110326-29
  • [学会発表] DNA G-quadruplexformation with its binding protein in crowded environment2010

    • 著者名/発表者名
      S. Nagatoishi, N. Isono, K. Tsumoto, and N. Sugimoto
    • 学会等名
      The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2010
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      20101110-12
  • [学会発表] タンパク質と四重鎖DNAの相互作用における分子クラウディング効果2010

    • 著者名/発表者名
      長門石曉・磯野伸・津本浩平・杉本直己
    • 学会等名
      第4回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      20100924-26
  • [学会発表] mRNAの熱安定性が及ぼす翻訳反応への影響2010

    • 著者名/発表者名
      川崎悠・村上健太郎・遠藤玉樹・杉本直己
    • 学会等名
      第4回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      20100924-26
  • [学会発表] G-quadruplex stability in the presence of its binding protein under a molecular crowding condition2010

    • 著者名/発表者名
      S. Nagatoishi, N. Isono, and N. Sugimoto
    • 学会等名
      IRT 2010-XIX International Round Table on Nucleosides
    • 発表場所
      France
    • 年月日
      20100829-0903
  • [学会発表] RNAサイレンシング関連蛋白質の核酸結合における溶媒効果2010

    • 著者名/発表者名
      長門石曉・杉本直己
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      20100616-18
  • [図書] 核酸化学の定量的基礎と仮説:核酸化学のニュートレンド(CSJカレントビュー)2011

    • 著者名/発表者名
      杉本直己
    • 総ページ数
      10-17
    • 出版者
      化学同人
  • [備考]

    • URL

      http://www.konan-fiber.jp/activities/search.php

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公開日: 2013-07-31  

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