選択的スプライシングを制御する核内微小時空間場のバイオプローブを用いた解析

2012 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22657050
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 細胞生物学
• 研究機関: 熊本大学
• 研究代表者: 谷 時雄 熊本大学, 大学院・自然科学研究科, 教授 (80197516)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2012
• キーワード: 遺伝子発現制御 / 核内構造 / 選択的スプライシング / mRNA 核外輸送 / バイオプローブ

研究概要

真核細胞の核内は、 多数の核内構造体によって高度に区画化された空間である。 遺伝子発現は、核スペックルなどの核内構造体によって形成される微小核内空間場を介した制御を受ける。本研究では、放線菌培養上清から分離した核スペックル形成阻害化合物をバイオロジカルプローブに用いて、核内構造体を介して選択的スプライシングや mRNA 核外輸送などの転写後遺伝子発現が如何に制御されるか、その時空間的な場による制御機構を解明した

研究成果

• [雑誌論文] Visual screening for the naturalcompounds that affect the formation of thenuclear structures (2012)
  • 著者名/発表者名: Kaya Shigaki, Kazuaki Tokunaga, YukiMihara, Yota Matsuo, Yamato Kojimoto,Hiroaki Yagi and Tokio Tani
  • 雑誌名: InChembiomolecular Science: at the Fronteirof Chemistry and Biology, Springer ページ: 183-192
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of the ptr5+geneinvolved in nuclear mRNA export in fissionyeast (2012)
  • 著者名/発表者名: Nobuyoshi Watanabe, Terumasa Ikeda,Fumitaka Mizuki and Tokio Tani
  • 雑誌名: Biochem.Biophys. Res. Commun 巻: 69 ページ: 1197-1204
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of the RNA-binding protein Nrd1 instress granule formation and itsimplication in the stress response infission yeast (2012)
  • 著者名/発表者名: Ryosuke Satoh, Akitomo Tanaka, Yhako Kita,Takahiro Morita, Yasuhiro Matumura, NanaeUmeda, Sachiko Hayashi, Tokio Tani, KaoriShinmyozu and Reiko Sugiura
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 7(1) ページ: e29683
  • 査読あり
• [雑誌論文] Diverse functions of nuclear non-codingRNAs in eukaryotic gene expression (2012)
  • 著者名/発表者名: Madoka Chinen and Tokio Tani
  • 雑誌名: Frontiers inBioscience 巻: 17 ページ: 1402-1417
  • 査読あり
• [雑誌論文] スプライシング因子 SF2 の核スペックル局在化阻害化合物の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 八木浩亮、黒木優太郎、松尾陽太、江藤俊志、徳永和明、萩原正敏、五十嵐雅之、谷時雄
  • 雑誌名: ケミカルバイオロジー 巻: 5(1) ページ: 3-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynamic association/dissociation andharboring of endogenous mRNAs in stressgranules (2011)
  • 著者名/発表者名: Junwei Zhang, Kohki Okabe, TokioTani and Takashi Funatsu. J
  • 雑誌名: Cell Sci 巻: 124 ページ: 4087-4095
  • 査読あり
• [雑誌論文] EGD1 (β-NAC) mRNA is localized in anovel cytoplasmic granule inSaccharomyces cerevisiae. (2011)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Hayashi, Tomoko Andoh and TokioTani
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 16(3) ページ: 316-329
  • 査読あり
• [雑誌論文] Real time monitoring of endogenouscytoplasmic mRNA using linear 2'-O-methylRNA probes in living cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Kohki Okabe, Yoshie Harada, Junwei Zhang,Hisashi Tadakuma, Tokio Tani and TakashiFunatsu
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 39(4) ページ: e20
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of the spliceosomal U4 snRNAin heterochromatic gene silencing atfission yeast centromeres (2010)
  • 著者名/発表者名: Madoka Chinen, Misato Morita, KazuhiroFukumura and Tokio Tani. J
  • 雑誌名: Biol. Chem 巻: 285 ページ: 5630-5638
  • 査読あり
• [雑誌論文] Critical role of Pcid2 in B cell survivalthrough the regulation of MAD2 expression (2010)
  • 著者名/発表者名: Teruo Nakaya, Kazuhiko Kuwahara, KazutakaOhta, Masahiro Kitabatake, Teppei Toda,Naoki Takeda, Tokio Tani, Eisaku Kondo andNobuo Sakaguchi. J
  • 雑誌名: Immunol 巻: 185 ページ: 5180-5187
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel ER J-protein DNAJB12 acceleratesER-associated degradation of membraneproteins including CFTR (2010)
  • 著者名/発表者名: Yo-hei Yamamoto,Taiji Kimura, Shuku Momohara, MasatoTakeuchi, Tokio Tani, Yukio Kimata,Hiroshi Kadokura and Kenji Kohno
  • 雑誌名: CellStructure and Function 巻: 35 ページ: 107-116
  • 査読あり
• [学会発表] 核スペックル及び選択的スプライシングに影響を及ぼす天然化合物の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 黒木優太郎、 八木浩亮、 松尾陽太、 三原由揮、鈴木仁、 萩原正敏、 五十嵐雅之、 谷時雄
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡)
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] 核スペックル形成に影響を及ぼす抗癌化合物の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 阿多晃平、 志柿花矢、 三原由揮、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡)
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] 核スペックルの異常形成を引き起こす放線菌培養上清の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松山将太、豊田修吉、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡)
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] 分裂酵母を用いた mRNA 核外輸送機構の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 北畑衣理、 西村侑子、 金田加奈子、谷時雄
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡)
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] セントロメア由来 Satellite I RNA の染色体分離における役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 井手上賢、長裕紀子、西村佳菜子、谷時雄
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡)
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] スプライシング因子 SF2 の核スペックル局在を促進する化合物 Toyocamycin の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 八木浩亮、 黒木優太郎、 松尾陽太、 江藤俊志、萩原正敏、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡)
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] セントロメアヘテロクロマチン形成における dg ncRNA イントロンの役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 牟田園正敏、森田京、弓掛辰洋、塚原千紘、知念まどか、中山潤一、石井浩二郎、井手上賢、 谷時雄
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡)
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] セントロメア dg ncRNA イントロンのスプライシング制御とヘテロクロマチン形成の関連 (2012)
  • 著者名/発表者名: 塚原千紘、牟田園正敏、森田京、弓掛辰洋、知念まどか、中山潤一、石井浩二郎、井手上賢、谷時雄
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡)
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] 選択的に mRNA 核外輸送を阻害する化合物の同定と解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 糀本大和、三原由揮、松尾陽太、前田紗希、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡)
  • 年月日: 2012-12-15
• [学会発表] 核スペックル及び選択的スプライシングに影響を及ぼす天然化合物ツベルシジンの解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 黒木優太郎、八木浩亮、松尾陽太、三原由揮、鈴木仁、萩原正敏、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2012
  • 発表場所: メルパルク熊本(熊本)
  • 年月日: 2012-09-20
• [学会発表] セントロメアヘテロクロマチン形成における dg ncRNA イントロンの役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 牟田園正敏、森田京、弓掛辰洋、塚原千紘、知念まどか、中山潤一、石井浩二郎、井手上賢、谷時雄
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2012
  • 発表場所: メルパルク熊本(熊本)
  • 年月日: 2012-09-20
• [学会発表] スプライシング因子 DHX38 / Prp16 の染色体分離における機能 (2012)
  • 著者名/発表者名: 手上賢、 西村佳菜子、長裕紀子、谷時雄
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2012
  • 発表場所: メルパルク熊本(熊本)
  • 年月日: 2012-09-20
• [学会発表] Novel and conserved roles of thesplicing factor Prp14p RNA helicase in thenoncoding RNA-mediated centromerefunction. (2012)
  • 著者名/発表者名: Masatoshi Mutazono, TakashiIdeue, Misato Morita, Kanako NishimuraChihiro Tsukahara, Madoka Chinen,Jun-ichi Nakayama, Kojiro Ishii and TokioTani
  • 学会等名: Regulatry and non-coding RNAs
  • 発表場所: Cold Spring Harbor LaboratoryGrace Auditorium (New York, USA)
  • 年月日: 2012-08-31
• [学会発表] 選択的に mRNA 核外輸送を阻害する化合物の同定と解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 糀本大和、三原由揮、松尾陽太、前田紗希、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: 第14回 RNA ミーティング
  • 発表場所: 東北大学川内萩ホール(仙台)
  • 年月日: 2012-07-18
• [学会発表] Characterization of Natural Compoundsthat Affect Nuclear Speckle Formation andAlternative Pre-mRNA Splicing in MammalianCells (2012)
  • 著者名/発表者名: Yutaro Kurogi, Yota Matsuo, HiroakiYagi, Yuki Mihara, Haruka Iwamoto, HafizeA. Demirkol, Yamato Kojimoto, Yuya Uehara,Hitoshi Suzuki, Masatoshi Hagiwara,Masayuki Igarashi, and Tokio Tani
  • 学会等名: The 22nd CDB Meeting "RNA Sciences in Cell andDevelopmental Biology II"
  • 発表場所: 理研CDB(神戸)
  • 年月日: 2012-06-13
• [学会発表] 核スペックル形成に影響を及ぼす抗癌化合物の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 阿多晃平、 志柿花矢、 三原由輝、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: 第7回日本ケミカルバイオロジー学会
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館 百周年記念ホール(京都)
  • 年月日: 2012-06-07
• [学会発表] スプライシング装置を介したセントロメアヘテロクロマチン形成の制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 牟田園正敏、森田京、弓掛辰洋、知念まどか、中山潤一、石井浩二郎、井手上賢、谷時雄
  • 学会等名: 第6回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 学術総合センター(東京)
  • 年月日: 2012-05-14
• [学会発表] スプライシング因子 SF2 の核スペックル局在を促進する化合物 Toyocamycin の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 八木浩亮、 黒木優太郎、 松尾陽太、 江藤俊志、萩原正敏、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] Screening and Characterization ofNatural Compounds that Affect NuclearSpeckle Formation and AlternativePre-mRNA Splicing in Mammalian Cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Yota Matsuo, Yutaro Kurogi, Hiroaki Yagi,Yuki Mihara, Haruka Iwamoto, Hafize A.Demirkol, Yamato Kojimoto, Yuya Uehara,Hitoshi Suzuki, Masatoshi Hagiwara,Masayuki Igarashi, and Tokio Tani
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
  • 年月日: 2011-12-15
• [学会発表] pre-mRNA スプライシング/mRNA 核外輸送装置によるクロマチンサイレンシングの多元的制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 知念まどか、水谷文哉、牟田園正敏、弓掛辰洋、塚原千紘、森田京、谷時雄
  • 学会等名: 第84回日本生化学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都)
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] poly(A)+RNA の核スペックル集積阻害化合物 tubercidin の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松尾陽太、黒木優太郎、三原由揮、萩原正敏、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: RNA フロンティアミーティング 2011
  • 発表場所: 愛知健康プラザ (名古屋)
  • 年月日: 2011-08-30
• [学会発表] スプライシング因子の核スペックル局在に影響を与える化合物の作用解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 八木浩亮、黒木優太郎、 松尾陽太、 江藤俊志、 萩原正敏、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: RNA フロンティアミーティング 2011
  • 発表場所: 愛知健康プラザ (名古屋)
  • 年月日: 2011-08-30
• [学会発表] 核スペックルへの poly(A)+RNA 局在に影響を与える化合物のスクリーニング (2010)
  • 著者名/発表者名: 三原由揮、松尾陽太、豊田修吉、江藤俊志、志柿花矢、東祐子、徳永和明、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸国際会議場(神戸)
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] バイオプローブを用いた核スペックルの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松尾陽太、三原由揮、八木浩亮、東祐子、志柿花矢、豊田修吉、江藤俊志、岩本はる香、糀本大和、上原裕也、徳永和明、荻原正敏、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸国際会議場(神戸)
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] 核内構造体(核スペックル)形成阻害化合物のスクリーニングと転写後遺伝子発現制御機構解析への応用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松尾陽太、三原由揮、江藤俊志、 豊田修吉、 徳永和明、 岩本はる香、萩原正敏、五十嵐雅之、谷時雄
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー学会
  • 発表場所: 東京工業大学 70 周年記念講堂(東京)
  • 年月日: 2010-05-19
• [備考] ホームページ等, 谷研究室ホームページ(研究成果)
  • URL: http://www.sci.kumamoto-u.ac.jp/bio/staff/tani/index.htm