• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2011 年度 実績報告書

ヒト病理組織のアダクトーム解析

研究課題

研究課題/領域番号 22659072
研究機関浜松医科大学

研究代表者

椙村 春彦  浜松医科大学, 医学部, 教授 (00196742)

キーワードDNA付加体 / adductome / 炎症 / 脂質過酸化物 / 胃がん / 塩基除去修復 / LC-MS / ゲノム
研究概要

がん周囲組織にあるDNA付加体10種類(すでにannotation済み)の量と分布をhigh performance liquid chromatographyとtandem mass spectrometryを使用することによって、明らかにし、腫瘍の種類、腫瘍におこる変異のパターン、生活習慣(喫煙歴、アルコール歴)などと比較を行い、病理学的意義を明らかにすることをおこなったが、とくに、環境要因の異なる地域中国と日本で発生した胃がんの非腫瘍胃粘膜22例について上記のうち下記の7種について解析を行った。
Seven lipid peroxidation related DNA adducts, 1, N6-etheno-2'-deoxyadenosine(εdA), butanone-etheno-2'-deoxycytidine (BεdC), butanone-etheno-2'-deoxy-5-methylcytidine (BεmedC), butanone-etheno-2'-deoxyadenosine (BεdA), heptanone-etheno-2'-deoxycytidine (HεdC), heptanone-etheno-2'-deoxyadenosine (HεdA), and heptanone-etheno-2'-deoxyguanosine (HεdG)これらの7種の付加体レベルは0から3万個/10^9塩基対の範囲でヒト胃粘膜に存在したが、そのprofileを判別解析することによって、日本と中国のoriginを判別することができた。
上記の課程であきらかになった6個の主として脂質代謝の結果生じた修飾塩基を含む30merのオリゴヌクレオチドを合成し、大腸菌で精製した以下の修復酵素タンパクと混和し、修復活性のある組み合わせを同定し、gene-environmental interactionの生物学的基礎を調べたところ、TDG (Thymine DNA glycosylase)の関与が推定され、その機能的解析のために、制御発現システムを作成した。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2011

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (1件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Germline alterations of the CDH1 gene in familial gastric cancer in the Japanese population2011

    • 著者名/発表者名
      Yamada H, Sugimura H, et al
    • 雑誌名

      Cancer Sci

      巻: 102 ページ: 1782-88

    • DOI

      doi:10.1111/j.1349-7006.2011.02038.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Novel Single Nucleotide Polymorphism of the CYP2A13 gene in Japanese individuals2011

    • 著者名/発表者名
      Tamaki Y, Sugimura H, et al
    • 雑誌名

      Drug Metab Pharmacokinet

      巻: 26 ページ: 516-522

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic susceptibility to lung cancer2011

    • 著者名/発表者名
      Sugimura H, et al
    • 雑誌名

      Front Biosci

      巻: 3 ページ: 1463-77

    • 査読あり
  • [学会発表] 酸化的DNA損傷修復に関わる遺伝子多型とヒト発がん2011

    • 著者名/発表者名
      椙村春彦
    • 学会等名
      日本環境変異原学会
    • 発表場所
      学術総合センター(東京)
    • 年月日
      2011-11-21
  • [図書] Gliomas : Glioblastoma (Part 2) ISBN 978-94-007-0617-02011

    • 著者名/発表者名
      Sugimura H, et al (分担)
    • 総ページ数
      458
    • 出版者
      Springer

URL: 

公開日: 2013-06-26  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi