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2010 年度 実績報告書

インプリンティング遺伝子のゲノムワイドな同定法の開発と小児固形腫瘍解析への応用

研究課題

研究課題/領域番号 22659196
研究機関群馬県衛生環境研究所

研究代表者

林 泰秀  群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (30238133)

研究分担者 朴 明子  群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (50450375)
佐野 弘純  群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (20469878)
キーワード遺伝子 / ゲノム / マイクロアレイ / 癌 / インプリンティング
研究概要

これまでに神経芽腫200例のSNPアレイ解析からALK遺伝子の増幅と活性化変異をみいだした(Nature 455:271,2008)。この変異は家族性神経芽腫でも胚細胞変異もあることが判明した。またA20が成人のリンパ腫のSNPアレイの解析から6番長腕のuniparental disomy (UPD)のみられる領域にあり変異を有することと、成人の骨髄増殖性疾患(MDS/MPN)でも11番のUPDからCBL遺伝子を同定した(Nature 459:712-716,2009)。我々のSNPアレイを用いた手法が新規の重要な遺伝子をみい出すことができることを示しており、この手法を用いて、小児の固形腫瘍(リンパ腫50例、横紋筋肉腫50例、ユーイング肉腫82例、悪性ラブドイド腫瘍20例、肝芽腫20例)のUPD領域からゲノムインプリンティングの網羅的な探索を通じて新規原因遺伝子を単離・同定する。
今年度は、ユーイング肉腫ファミリー(Ewing sarcoma family of tumors,ESFT)99検体(細胞株17株を含む)を用い、ALK遺伝子の変異解析を行ったところ、新規のミスセンス変異が4例に認められた。その一部について機能解析を行ったところ、ウェスタンブロットにおける自己リン酸化の亢進、siRNAによるALK kmockdownでの細胞増殖の抑制、コロニーアッセイにおいて足場非依存性増殖、ヌードマウスアッセイにて腫瘍形成が観察された。また、ALK阻害剤(TAE684、2,4-PDD,PF02341066)の投与にて、ALK変異を持つESFT細胞株においても高い効果を認めた。神経芽腫のみでなく、一部ESFTにおいてもALKが関与することや治療の標的になることが示唆された。

  • 研究成果

    (51件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (16件) (うち査読あり 16件) 学会発表 (35件)

  • [雑誌論文] IDH1 and IDH2 mutations are rare in pediatric myeloid malignancies.2011

    • 著者名/発表者名
      Oki K, et al.
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 25 ページ: 382-384

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Oncogenic mutations of ALK in neuroblastoma.2011

    • 著者名/発表者名
      Ogawa S, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 102 ページ: 302-308

    • 査読あり
  • [雑誌論文] CBL mutations in juvenile myelomonocytic leukemia and pediatric myelodysplastic syndrome.2010

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 24 ページ: 1090-1092

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantitative assessment of PTPN11 or RAS mutations at the neonatal period and during the clinical course in patients with juvenile myelomonocytic leukaemia2010

    • 著者名/発表者名
      Matsuda K, et al.
    • 雑誌名

      Bri J Haematol

      巻: 148 ページ: 593-599

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prognostic significance of the BAALC isoform pattern and CEBPA mutations in pediatric acute myeloid leukemia with normal karyotype : a study by the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group.2010

    • 著者名/発表者名
      Mizushima Y, et al.
    • 雑誌名

      Int J Hematol

      巻: 91 ページ: 831-837

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Down syndrome and GATA1 mutations in transient abnormal myeloproliferative disorder : mutation classes correlate with progression to myeloid leukemia.2010

    • 著者名/発表者名
      Kanezaki R, et al.
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 116 ページ: 4631-4638

    • 査読あり
  • [雑誌論文] FLT3-internal tandem duplication, CD56 expression, and obstructive jaundice due to granulocytic sarcoma at relapse in a pediatric patient with t(8;21) acute myeloid leukemia.2010

    • 著者名/発表者名
      Kawamura M, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Genet Cytogenet

      巻: 203 ページ: 292-296

    • 査読あり
  • [雑誌論文] High frequencies of simultaneous FLT3-ITD, WT1 and KIT mutations in hematological malignancies with NUP98-fusion genes.2010

    • 著者名/発表者名
      Taketani T, et al.
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 24 ページ: 1975-1977

    • 査読あり
  • [雑誌論文] NOTCH1 mutation in a female with myeloid/NK cell precursor acute leukemia.2010

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 雑誌名

      Pediatr Blood Cancer

      巻: 55 ページ: 1406-1409

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expression of ADAMTS4 in Ewing's sarcoma.2010

    • 著者名/発表者名
      Minobe K, et al.
    • 雑誌名

      Int J Oncol

      巻: 37 ページ: 569-581

    • 査読あり
  • [雑誌論文] AID-induced T-lymphoma or B-leukemia/lymphoma in a mouse BMT model.2010

    • 著者名/発表者名
      Komeno Y, et al.
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 24 ページ: 1018-1024

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Long-term results of Tokyo Children's Cancer Study Group trials for childhood acute lymphoblastic leukemia, 1984-1999.2010

    • 著者名/発表者名
      Tsuchida M, et al.
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 24 ページ: 383-396

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 初診時にコンパートメント症候群を合併した血友病Aの1乳児例2010

    • 著者名/発表者名
      外松学, 他
    • 雑誌名

      日本小児血液学会雑誌

      巻: 24 ページ: 111-114

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 神経芽腫におけるreceptor tyrosine kinase(RTK)および癌抑制遺伝子DCCの発現と臨床的予後因子との相関について2010

    • 著者名/発表者名
      佐野弘純, 他
    • 雑誌名

      小児がん

      巻: 47 ページ: 424-427

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 典型例とは異なる緩徐な臨床経過を示し、リボソームタンパク遺伝子RPL11の変異の検出により診断したDiamond-Blackfan貧血の1例2010

    • 著者名/発表者名
      佐野弘純, 他
    • 雑誌名

      日本小児血液学会雑誌

      巻: 24 ページ: 225-228

    • 査読あり
  • [雑誌論文] CBL mutation in childhood therapy-related .leukemia.

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: (in press)

    • 査読あり
  • [学会発表] 次世代シークエンサーによる神経芽腫におけるエクソーム解析2011

    • 著者名/発表者名
      滝田順子, 他
    • 学会等名
      第6回JNBSG研究会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2011-01-30
  • [学会発表] T細胞性急性リンパ性白血病におけるLEF1遺伝子異常の解析2010

    • 著者名/発表者名
      朴明子, 他
    • 学会等名
      第52回日本小児血液学会総会・第26回日本小児がん学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-12-19
  • [学会発表] 急性骨髄性白血病におけるRAS遺伝子変異と臨床像2010

    • 著者名/発表者名
      佐野弘純, 他
    • 学会等名
      第52回日本小児血液学会総会・第26回日本小児がん学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-12-18
  • [学会発表] 治療関連白血病におけるCBLとRAS遺伝子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      柴徳生, 他
    • 学会等名
      第52回日本小児血液学会総会・第26回日本小児がん学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-12-18
  • [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたエクソンシークエンスによる神経芽腫の標的分子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      吉田健一, 他
    • 学会等名
      第52回日本小児血液学会総会・第26回日本小児がん学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-12-18
  • [学会発表] 小児悪性腫瘍におけるIsocitrate depydrogenase 1/2の変異解析2010

    • 著者名/発表者名
      大木健太郎, 他
    • 学会等名
      第52回日本小児血液学会総会・第26回日本小児がん学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-12-18
  • [学会発表] 小児固形腫瘍におけるALK遺伝子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      西村力, 他
    • 学会等名
      第52回日本小児血液学会総会・第26回日本小児がん学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-12-17
  • [学会発表] 高密度SNPアレイを用いた胸膜肺芽腫における網羅的ゲノム解析2010

    • 著者名/発表者名
      大久保淳, 他
    • 学会等名
      第52回日本小児血液学会総会・第26回日本小児がん学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-12-17
  • [学会発表] ダウン症候群に合併した一過性骨髄異常増殖症148例の後方視的解析2010

    • 著者名/発表者名
      村松秀城, 他
    • 学会等名
      第52回日本小児血液学会総会・第26回日本小児がん学会学術集会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-12-17
  • [学会発表] CBL mutations in therapy-related leukemia and infant leukemia.2010

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      The 53rd ASH Annual Meeting and Exposition
    • 発表場所
      Orlando, U.S.A.
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] LEF1 gene mutations in childhood T-cell acute lymphoblastic leukemia and T cell non-hodgkin's lymphoma.2010

    • 著者名/発表者名
      Park MJ, et al.
    • 学会等名
      The 53rd ASH Annual Meeting and Exposition
    • 発表場所
      Orlando, U.S.A.
    • 年月日
      2010-12-06
  • [学会発表] Low-dose cytosine arabinoside therapy for neonates with down syndrome (DS) and transient leukemia (TL).2010

    • 著者名/発表者名
      Muramatsu H, et al.
    • 学会等名
      The 53rd ASH Annual Meeting and Exposition
    • 発表場所
      Orlando, U.S.A.
    • 年月日
      2010-12-06
  • [学会発表] 肝機能障害を伴うTAMの臨床像について2010

    • 著者名/発表者名
      朴明子, 他
    • 学会等名
      第114回小児血液腫瘍懇話会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-10-29
  • [学会発表] 小児急性白血病と骨髄異形成症候群におけるCBL遺伝子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      柴徳生, 朴明子, 林泰秀
    • 学会等名
      第114回小児血液腫瘍懇話会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-10-29
  • [学会発表] Mutation analyses of CBL and MPL genes in childhood leukemia and myelodysplastic syndrome.2010

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      第72回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2010-09-26
  • [学会発表] Mutation analysis of lymphocyte tyrosine kinase (LTK) in acute lymphoblastic leukemia.2010

    • 著者名/発表者名
      Uchisaka N, et al.
    • 学会等名
      第72回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2010-09-25
  • [学会発表] Genome-wide analysis using high-density SNP microarrays in various types of hematologic malignancies.2010

    • 著者名/発表者名
      Matsubara A, et al.
    • 学会等名
      第72回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2010-09-25
  • [学会発表] Mutations of LEF1 gene in pediatric T cell acute lymphoblastic leukemia2010

    • 著者名/発表者名
      Park MJ, et al.
    • 学会等名
      第72回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2010-09-25
  • [学会発表] Internal deletions of transcription factor GATA1 observed in transient abnormal myelopoiesis.2010

    • 著者名/発表者名
      Toki T, et al.
    • 学会等名
      第72回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2010-09-25
  • [学会発表] 小児悪性造血腫瘍におけるCBL遺伝子とMPL遺伝子の変異解析2010

    • 著者名/発表者名
      柴徳生, 他
    • 学会等名
      第69回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-09-24
  • [学会発表] Genome-wide scanning of pediatric acute myeloied leukemia using SNP-genotyping microarrays.2010

    • 著者名/発表者名
      Oki K, et al.
    • 学会等名
      第72回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2010-09-24
  • [学会発表] Mutations of IDH1 and IDH2 in pediatric acute myeloid leukemia.2010

    • 著者名/発表者名
      Oki K, et al.
    • 学会等名
      第72回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2010-09-24
  • [学会発表] 胸膜肺芽腫における網羅的ゲノム解析2010

    • 著者名/発表者名
      大久保淳, 大木健太郎, 林泰秀
    • 学会等名
      第69回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-09-23
  • [学会発表] 小児固形腫瘍におけるALK遺伝子の関与2010

    • 著者名/発表者名
      滝田順子, 大木健太郎, 林 泰秀
    • 学会等名
      第69回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-09-23
  • [学会発表] 小児T細胞性造血器腫瘍におけるLEF1遺伝子の異常2010

    • 著者名/発表者名
      朴明子, 他
    • 学会等名
      第69回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-09-23
  • [学会発表] 小児固形腫瘍におけるALK阻害剤を用いた抗腫瘍効果の検討2010

    • 著者名/発表者名
      樋渡光輝, 他
    • 学会等名
      第69回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-09-22
  • [学会発表] 小児白血病とMDSにおけるCBLとMPL遺伝子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      柴徳生, 他
    • 学会等名
      第7回北関東小児がんセミナー
    • 発表場所
      高崎
    • 年月日
      2010-05-15
  • [学会発表] 小児白血病の発症,進展の分子遺伝学2010

    • 著者名/発表者名
      林泰秀
    • 学会等名
      113回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      岩手
    • 年月日
      2010-04-25
  • [学会発表] 小児T細胞性急性リンパ性白血病における網羅的ゲノム解析2010

    • 著者名/発表者名
      朴明子, 他
    • 学会等名
      第113回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      岩手
    • 年月日
      2010-04-24
  • [学会発表] 若年性骨髄単球性白血病におけるCBL遺伝子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      柴徳生, 他
    • 学会等名
      第113回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      岩手
    • 年月日
      2010-04-24
  • [学会発表] Ewing/PNET familyにおけるALK遺伝子の解析2010

    • 著者名/発表者名
      滝田順子, 他
    • 学会等名
      第113回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      岩手
    • 年月日
      2010-04-24
  • [学会発表] 当科にて経験した血球貧食症候群12例の臨床的検討2010

    • 著者名/発表者名
      外松学, 他
    • 学会等名
      第113回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      岩手
    • 年月日
      2010-04-24
  • [学会発表] 神経芽腫における部分欠損型ALKの活性化2010

    • 著者名/発表者名
      大木健太郎, 他
    • 学会等名
      第113回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      岩手
    • 年月日
      2010-04-24
  • [学会発表] ALK gene aberrations in pediatric solid tumors.2010

    • 著者名/発表者名
      Takita J, et al.
    • 学会等名
      第6回小児研究アジア学会
    • 発表場所
      台北
    • 年月日
      2010-04-15
  • [学会発表] High resolution copy number analysis of Ewing sarcoma family of tumors using high-density SNP-genotyping microarrays.2010

    • 著者名/発表者名
      Nishimura R, et al.
    • 学会等名
      第6回小児研究アジア学会
    • 発表場所
      台北
    • 年月日
      2010-04-15

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公開日: 2012-07-19  

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