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2012 年度 実績報告書

インプリンティング遺伝子のゲノムワイドな同定法の開発と小児固形腫瘍解析への応用

研究課題

研究課題/領域番号 22659196
研究機関群馬県衛生環境研究所

研究代表者

林 泰秀  群馬県衛生環境研究所, その他部局等, 研究員 (30238133)

研究分担者 大木 健太郎  群馬県衛生環境研究所, その他部局等, 研究員 (50400966)
朴 明子  群馬県衛生環境研究所, その他部局等, 研究員 (50450375)
研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2013-03-31
キーワード遺伝子 / ゲノム / マイクロアレイ / 癌 / インプリンティング
研究概要

神経芽腫の1歳以上の進展例は予後不良である。近年チロシンキナーゼの活性化が予後と相関することが成人の固形腫瘍で報告されている。我々はこれまでに神経芽腫チロシンキナーゼのKIT、PDGFR、FLT3、RET、TRKA、ALK、EGFRとMETにつき、発現と予後の関係を検討し報告した。今年度は神経芽腫細胞株と新鮮腫瘍でAffymetrix社のGeneチップ500k arrayを用いて腫瘍ゲノムに生じたコピー数の変化およびuniparental disomy(UPD)の解析を行い、MYEOVとNEGR1遺伝子は11q31増幅と1p31減少の標的遺伝子と思われ、NEGR1遺伝子の発現は予後因子になりうると思われた。また、神経芽腫細胞株よりALKの短縮型をみい出してその機能解析を行い、短縮型ALKは新たな活性型変異であることを明らかにした。
今年度は、昨年度の横紋筋肉腫(RMS)の研究を継続し、 55検体(細胞株8株、新鮮腫瘍47例)を用いてSNPアレイによるゲノムコピー数の解析を行った。SNPアレイでは胞巣型の1例でALK領域の高度増幅を検出した。胎児型は高2倍体がみられ、染色体2番、8番、12番の増加がみられ、KRAS、NRAS領域の異常が3例でみられた。注目すべきは13q増加がある患者は予後良好であった。胞巣型は近2倍体であり15qLOHが45.8%でみられた。ALK阻害剤により一部の細胞株で増殖抑制効果が認められた。ALKはRMSで高率に発現し、高度増幅例も認められたことからRMSの発症・進展に関与している可能性が示唆された。

現在までの達成度 (区分)
理由

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (56件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (15件) (うち査読あり 15件) 学会発表 (41件)

  • [雑誌論文] Characterization of genetic lesions in rhabdomyosarcoma using a high-density single nucleotide polymorphism array.2013

    • 著者名/発表者名
      Nishimura R, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Sci

      巻: in press ページ: in press

    • DOI

      doi: 10.1111/cas.12173.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Naturally occurring oncogenic GATA1 mutants with internal deletions in transient abnormal myelopoiesis in Down syndrome.2013

    • 著者名/発表者名
      Toki T, et al.
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 12 ページ: 3181-3184

    • DOI

      doi: 10.1182/blood-2012-01-405746

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cytomegalovirus retinitis during maintenance therapy for T-cell acute lymphoblastic leukemia.2013

    • 著者名/発表者名
      Wakai K, et al.
    • 雑誌名

      J Pediatr Hematol Oncol

      巻: 35 ページ: 162-163

    • DOI

      doi: 10.1097/MPH.0b013e318279e920

    • 査読あり
  • [雑誌論文] An Inv(16)(p13.3q24.3)-encoded CBFA2T3-GLIS2 fusion protein defines an aggressive subtype of pediatric acute megakaryoblastic leukemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Gruber TA, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Cell.

      巻: 22 ページ: 683-697

    • DOI

      doi: 10.1016/j.ccr.2012.10.007

    • 査読あり
  • [雑誌論文] High WT1 mRNA expression after induction chemotherapy and FLT3-ITD have prognostic impact in pediatric acute myeloid leukemia: a study of the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group.2012

    • 著者名/発表者名
      Shimada A, et al.
    • 雑誌名

      Int J Hematol

      巻: 96 ページ: 469-476

    • DOI

      doi: 10.1007/s12185-012-1163-1

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Somatic mosaicism for oncogenic NRAS mutations in juvenile myelomonocytic leukemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Doisaki S, et al.
    • 雑誌名

      Blood.

      巻: 120 ページ: 1485-1488

    • DOI

      doi: 10.1182/blood-2012-02-406090

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Childhood acute myeloid leukemia with bone marrow eosinophilia caused by t(16;21)(q24;q22).2012

    • 著者名/発表者名
      Kawashima N, et al.
    • 雑誌名

      Int J Hematol.

      巻: 95 ページ: 577-580

    • DOI

      doi: 10.1007/s12185-012-1044-7

    • 査読あり
  • [雑誌論文] RAS mutations are frequent in FAB type M4 and M5 of acute myeloid leukemia, and related to late relapse: a study of the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group.2012

    • 著者名/発表者名
      Sano H, et al.
    • 雑誌名

      Int J Hematol

      巻: 95 ページ: 509-515

    • DOI

      doi: 10.1007/s12185-012-1033-x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Novel splicing factor mutations in juvenile myelomonocytic leukemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Takita J, et al.
    • 雑誌名

      Leukemia.

      巻: 26 ページ: 1879-1898

    • DOI

      doi: 10.1038/leu.2012.45

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of TRIB1 R107L gain-of-function mutation in human acute megakaryocytic leukemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama T, et al.
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 119 ページ: 2608-2611

    • DOI

      doi: 10.1182/blood-2010-12-324806

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Aberrant activation of ALK kinase by a novel truncated form ALK protein in neuroblastoma.2012

    • 著者名/発表者名
      Okubo J, et al.
    • 雑誌名

      Oncogene.

      巻: 31 ページ: 4667-4676

    • DOI

      doi: 10.1038/onc.2011.616

    • 査読あり
  • [雑誌論文] CBL mutation in chronic myelomonocytic leukemia secondary to familial platelet disorder with propensity to develop acute myeloid leukemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 雑誌名

      Blood

      巻: 119 ページ: 2612-2614

    • DOI

      doi: 10.1182/blood-2011-02-333435

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clinical significance of early T-cell precursor acute lymphoblastic leukaemia: Results of the Tokyo Children’s Cancer Study Group Study L99-15.2012

    • 著者名/発表者名
      Inukai T, et al.
    • 雑誌名

      Brit J Haematol

      巻: 156 ページ: 358-365

    • DOI

      doi: 10.1111/j.1365-2141.2011.08955.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNMT3A mutations are rare in childhood acute myeloid leukaemia, myelodysplastic syndromes and juvenile myelomonocytic leukaemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 雑誌名

      Br J Haematol

      巻: 156 ページ: 413-414

    • DOI

      doi: 10.1111/j.1365-2141.2011.08879.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] CBL mutations in infant acute lymphoblastic leukaemia.2012

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 雑誌名

      Br J Haematol

      巻: 156 ページ: 672-674

    • DOI

      doi: 10.1111/j.1365-2141.2011.08900.x

    • 査読あり
  • [学会発表] 先端的ゲノムスキャニングを用いた難治性小児固形腫瘍における標的分子の探索.

    • 著者名/発表者名
      滝田順子, 他
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] 次世代シークエンサーを用いた神経芽腫のエクソーム解析.

    • 著者名/発表者名
      西村力, 他.
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたEwing肉腫のエクソーム解析.

    • 著者名/発表者名
      大久保純, 他
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] 発現アレイを用いた小児急性骨髄性白血病における、NUP98-NSD1融合遺伝子の解析.

    • 著者名/発表者名
      柴 徳生, 他
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] TCCSGの小児B前駆細胞型急性リンパ性白血病におけるCRLF2とIKZF1、JAK遺伝子解析.

    • 著者名/発表者名
      大木健太郎, 他
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡
  • [学会発表] 第2再発時に初めてMLL-AF4陽性となったB前駆型急性リンパ性白血病1例におけるクローン構造の検討.

    • 著者名/発表者名
      大木健太郎, 他
    • 学会等名
      第8回北関東小児がんセミナー
    • 発表場所
      高崎
  • [学会発表] TAMに合併する肝機能障害について.

    • 著者名/発表者名
      朴 明子, 他
    • 学会等名
      第48回日本周産期・新生児医学会学術集会
    • 発表場所
      さいたま
  • [学会発表] 2遺伝子の発現に基づく高リスク小児急性骨髄性白血病の同定.

    • 著者名/発表者名
      三谷幸代, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] BLNK欠損preB-ALLとB細胞分化におけるC/Ebpbの働き.

    • 著者名/発表者名
      倉田盛人, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] 神経芽腫におけるエピジェネティック関連遺伝子の網羅的ゲノム解析

    • 著者名/発表者名
      星野諭子, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] 全エクソーム解析による小児急性骨髄性白血病の新規発症原因遺伝子変異の同定,

    • 著者名/発表者名
      柴 徳生, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] 次世代シーケンサーによる再発肺芽腫のエクソーム解析

    • 著者名/発表者名
      関 正史, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] SNPアレイをエクソーム解析を用いた横紋筋肉腫の初発・再発/転移巣のクローン比較.

    • 著者名/発表者名
      西村 力, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたユーイング肉腫発生の分子生物学的検討

    • 著者名/発表者名
      樋渡光輝, 他
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
  • [学会発表] Fusion gene-specific signature of microRNR expression in childhood ALL.

    • 著者名/発表者名
      Kiyokawa N, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] Gene expression profile related to prognosis of childhood ALL without fusion genes.

    • 著者名/発表者名
      Iijima K, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] IL-7R gene mutations in childhood T-cell acute lymphoblastic leukemia.

    • 著者名/発表者名
      Park MJ, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] Analysisi of CRLF2 and IKZF1, JAK, IL7R genes in pediatric B-precursor ALL treated on TCCSG protocol.

    • 著者名/発表者名
      Oki K, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] JAK2 V617F mutation in pediatric myeloproliferative neoplasm.

    • 著者名/発表者名
      Shimada A, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] Clonal architecture and evolution of pediatric AML.

    • 著者名/発表者名
      Okuno Y, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] Whole exome resequencing reveals novel gene mutations in pediatric AML.

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] Characteristics and prognostic impacts of structural chromosomal abnormalities in childhood ALL.

    • 著者名/発表者名
      Takahashi H, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] NUP98-NSD1 related gene expression signature is associated with a poor prognosis in pediatric AML.

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      第74回日本血液学会学術集会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] 小児B前駆細胞型急性リンパ性白血病におけるclonal evolutionの解析.

    • 著者名/発表者名
      大木健太郎,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 進行期T細胞性リンパ芽球性リンパ腫の染色体異常解析―JPLSGからの報告.

    • 著者名/発表者名
      関水匡大,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 先端的ゲノム解析技術を用いた胸膜肺芽腫における発症分子機構の解明.

    • 著者名/発表者名
      関 正史,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] MLPA法を用いたT-ALL遺伝子異常についての解析.

    • 著者名/発表者名
      朴 明子,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] t(17;19)(q22;p13.3)を含む染色体異常を呈したT細胞性急性リンパ性白血病の1例.

    • 著者名/発表者名
      西 眞範,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 神経芽腫におけるエピジェネティック関連遺伝子の網羅的ゲノム解析

    • 著者名/発表者名
      星野諭子,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 神経芽腫における網羅的メチル化解析

    • 著者名/発表者名
      関 正史,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 全エクソーム解析による小児急性骨髄性白血病の新規発症原因遺伝子変異の同定

    • 著者名/発表者名
      柴 徳生,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 小児急性骨髄性白血病におけるGATA2遺伝子変異同定.

    • 著者名/発表者名
      柴 徳生,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] TAM芽球におけるCD117発現と末梢血中芽球割合の相関.

    • 著者名/発表者名
      出口隆生,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] ダウン症候群に合併した一過性骨髄異常増殖症に対する少量シタラビン療法による腫瘍崩壊症候群.

    • 著者名/発表者名
      村松秀城,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 小児骨髄増殖疾患におけるJAK2V617F遺伝子変異.

    • 著者名/発表者名
      嶋田 明,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] CD66c陽性小児急性リンパ芽球性白血病の特徴.

    • 著者名/発表者名
      富田 理,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 小児リンパ腫における遺伝子異常の解析.

    • 著者名/発表者名
      大木健太郎,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] 次世代シーケンサとSNPアレイを用いた横紋筋肉腫3例における初発/再発・転移巣の比較.

    • 著者名/発表者名
      西村 力,他
    • 学会等名
      第54回日本小児血液・がん学会学術集会
    • 発表場所
      横浜
  • [学会発表] NUP98-NSD1 related gene expression signature is strongly associated with a poor prognosis in pediatric acute myeloid leukemia.,

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      54rd Annual Meeting of the American Society of Hematology
    • 発表場所
      Atlanta
  • [学会発表] Whole exome sequencing reveals spectrum of gene mutations in pediatric AML.

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      54rd Annual Meeting of the American Society of Hematology
    • 発表場所
      Atlanta
  • [学会発表] GATA2 mutations in pediatric acute myeloid leukemia: a study of the Japanese Childhood AML Cooperative Study Group.

    • 著者名/発表者名
      Shiba N, et al.
    • 学会等名
      54rd Annual Meeting of the American Society of Hematology
    • 発表場所
      Atlanta

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公開日: 2014-07-24  

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