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2010 年度 実績報告書

二次性能動輸送体による細胞環境維持機構の構造生物学

研究課題

研究課題/領域番号 22687007
研究機関東京大学

研究代表者

石谷 隆一郎  東京大学, 大学院・理学系研究科, 准教授 (90361568)

キーワードX線結晶構造解析 / 膜蛋白質 / 膜輸送体 / ドラッグデリバリー / 多剤排出因子
研究概要

細胞内外の環境維持に重要な能動輸送体は,エネルギーを消費して細胞膜を介した物質輸送を行う膜蛋白質であり,二次性輸送体は一次性輸送体が作り出したH+,Na+等のイオンの濃度勾配をエネルギー源として,低分子化合物を能動的に輸送する役割を持つ.特にこの二次性輸送体は,アミノ酸,核酸,糖,薬剤など,重要な生理活性物質の細胞内外の分布を決定づけている.そのため,これらの輸送体のヒトにおける機能異常は様々な疾病と深く関係している.本研究は,生物学的,医学的応用の両面から重要である二次性能動輸送体,多剤排出輸送体MATE,Ca^<2+>カチオン交換体CaCA,オリゴペプチド輸送体POTのX線結晶構造解析・機能解析を行っている.
MATEに関しては構造解析可能な分解能まで回折する結晶を得ることに成功したが,X線損傷によりデータセット測定が困難なため,今後さらなる結晶の改善を行う.また,並行してセレノメチオニン置換体結晶を調製し,構造決定を目指す.CaCAに関しては,様々な条件のスクリーニングや条件精密化により,最大300μm程度の大きさの結晶が得られたが,構造解析可能な分解能まで回折する結晶を得るには至らなかった.今後さらなる改善を目指す,POTに関しては,構造解析可能な分解能まで回折する結晶を得ることに成功し,Nativeデータセットの収集に成功した.さらに,セレノメチオニン置換体結晶を調製し,SAD法による構造決定に成功した.今後は,POTによる基質輸送活性測定を試験管内で行う系を立ち上げ,構造に基づいた変異体の作成を行い,オリゴペプチドや薬剤輸送の機構解明を目指す.またさらに,構造に基づいた分子動力学シミュレーションを行い,POTによる基質輸送の動的メカニズムの解明を目指す.

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (1件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Crystal structure of autotaxin and insight into GPCR activation by lipid mediators2011

    • 著者名/発表者名
      Nishimasu H, (他), Ishitani R, Takagi J, Aoki J, Nureki O
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 18 ページ: 205-212

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for nonribosomal peptide synthesis by an aminoacyl-tRNA synthetase paralog2011

    • 著者名/発表者名
      Bonnefond L, (他), Ishitani R, Nureki O.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 108 ページ: 3912-3917

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of a novel JmjC-domain-containing protein, TYW5, involved in tRNA modification2011

    • 著者名/発表者名
      Kato M, (他), Ishitani R, Nureki O
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: (未定)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] C-terminal domain of archaeal O-phosphoseryl-tRNA kinase displays large-scale motion to bind the 7-bp D-stem of archaeal tRNASec2011

    • 著者名/発表者名
      Sherrer RL, (他) Ishitani R, Ho JM, Soll D, Nureki O
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: (未定)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for mRNA surveillance by archaeal Pelota and GTP-bound EF1α complex2010

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi K, (他), Ishitani R, Inada T, Nureki O
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 107 ページ: 17575-17579

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Omnipotent role of archaeal elongation factor 1 alpha (EF1α) in translational elongation and termination, and quality control of protein synthesis.2010

    • 著者名/発表者名
      Saito K, Kobayashi K, (他), Ishitani R, Nureki O, Ito K
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 107 ページ: 19242-19247

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expanding role of the Jumonji C domain as an RNA hydroxylase2010

    • 著者名/発表者名
      Noma A, Ishitani R, Kato M, Nagao A, Nureki O, Suzuki T
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 285 ページ: 34503-7

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of an archaeal non-discriminating glutamyl-tRNA synthetase : a missing link in the evolution of Gln-tRNAGln formation2010

    • 著者名/発表者名
      Nureki O, (他), Ishitani R
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 38 ページ: 7286-7297

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular mechanisms underlying the early stage of protein translocation through the Sec translocon2010

    • 著者名/発表者名
      Mori T, Ishitani R, Tsukazaki T, Nureki O, Sugita Y
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 49 ページ: 945-950

    • 査読あり
  • [学会発表] 古細菌由来Pelota・EF1α・GTP複合体によるmRNA品質管理機構の構造基盤2010

    • 著者名/発表者名
      石谷隆一郎
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2010-12-07
  • [図書] 酵素利用技術大系-基礎・解析から改変・高機能化・産業利用まで-(1章1節2)2010

    • 著者名/発表者名
      石谷隆一郎、荒磯裕平、野澤佳世
    • 総ページ数
      800
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
  • [備考]

    • URL

      http://www.nurekilab.net/

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公開日: 2012-07-19  

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