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2011 年度 実績報告書

顔面形態における三次元デジタル解析およびゲノムワイド関連解析

研究課題

研究課題/領域番号 22687023
研究機関琉球大学

研究代表者

木村 亮介  琉球大学, 亜熱帯島嶼科学超域研究推進機構, 特命准教授 (00453712)

キーワード顔 / 形態 / 三次元解析 / 多型 / ゲノム
研究概要

顔面形態をはじめとするヒトの量的可視形質には、個体差や集団差が存在している。ヒトの量的可視形質の研究については、その遺伝性が認識されているにもかかわらず、未だ遺伝因子が不明なものが多い。その要因として、軟部組織形態の解析方法が確立していない点、正常形質が遺伝子関連解析の研究対象として扱われることが少ない点が挙げられる。そこで本研究では、非接触三次元スキャナを導入した現代日本人の顔面形態解析を行い、DNAマイクロアレイを用いたゲノムワイドSNP関連解析を行うことで、関連する遺伝子多型を同定することを目的とする。当該年度において、以下のような成果を得た。
1. 顔面形態データおよび試料の収集:インフォームドコンセントのもと、20代~30代の成人を対象に三次元スキャナによる顔面の撮影、試料採取(DNA抽出用の末梢血あるいは唾液)、簡単な生体計測(身長、体重、指極、臍高、肩峰幅、臀幅、頭長、頭幅など)を行なった。当該年度までに合わせて約800人のデータおよび試料を得た。
2. 顔面形態データの解析:顔面データの特徴点の抽出などの処理を行い、特徴点間の距離や角度を算出した。細分化曲面理論に基づいた相同モデリングにより、三元次顔面形状データの新たな解析方法の確立を行った。
3. ゲノムワイドSNPタイピング:末梢血あるいは唾液からDNAを抽出し、DNAマイクロアレイを用いたゲノムワイドSNPタイピングを行なった。当該年度までに、およそ600人分のSNP解析を終了した。また、集団構造を調べるための集団遺伝学的解析および予備的なゲノムワイド関連解析を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

三次元形状を詳細に解析するために、新たに細分化曲面理論に基づいた相同モデリングを解析に加えたことにより、複雑な形状の解析が可能となった。顔面形態解析において特徴点の取得など自動化が難しいところは、予想以上に労力を必要とした。その結果、形態の解析が遅れた。

今後の研究の推進方策

今後、形態解析の結果を精査し、本格的にゲノムワイド関連解析を進めていく。また、リプリケーション研究のための試料の収集に努める。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2011 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] The Serum Leptin Level and Body Mass Index in Melanesian and Micronesian Solomon Islanders: Focus on Genetic Factors and Urbanization2011

    • 著者名/発表者名
      Furusawa, T. et al.
    • 雑誌名

      American Journal of Human Biology

      巻: 23 ページ: 435-444

    • DOI

      10.1002/ajhb.21124

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Advanced CT images reveal nonmetric cranial variations in living humans2011

    • 著者名/発表者名
      Saitou, N. et al.
    • 雑誌名

      Anthropological Science

      巻: 119 ページ: 231-237

    • DOI

      10.1537/ase.100928

    • 査読あり
  • [学会発表] How to interpret multivariate genomic analyses of populations with admixture.

    • 著者名/発表者名
      Kimura R.
    • 学会等名
      ociety for Molecular Biology and Evolution 2011 Annual Meeting
    • 発表場所
      Kyoto
  • [学会発表] ゲノム多変量解析の解釈

    • 著者名/発表者名
      木村亮介
    • 学会等名
      日本進化学会第13回大会
    • 発表場所
      京都
  • [学会発表] ゲノム集団遺伝学でみるホモ・サピエンスの拡散と遺伝適応

    • 著者名/発表者名
      木村亮介
    • 学会等名
      第21回日本数理生物学会大会
    • 発表場所
      東京
  • [学会発表] ゲノム多変量解析から読み解く集団の移動史

    • 著者名/発表者名
      木村亮介
    • 学会等名
      第65回日本人類学会大会
    • 発表場所
      那覇
  • [学会発表] 若年成人の全身性関節弛緩性と左右の優位性との関係について

    • 著者名/発表者名
      諸見里恵一他
    • 学会等名
      第65回日本人類学会大会
    • 発表場所
      那覇
  • [学会発表] 本土日本-琉球人集団間における体毛分布差異の統計学的評価

    • 著者名/発表者名
      佐藤丈寛他
    • 学会等名
      第65回日本人類学会大会
    • 発表場所
      那覇
  • [学会発表] 3次元顔面画像データの特徴点による琉球および本土日本人の判別

    • 著者名/発表者名
      宮里絵理他
    • 学会等名
      第65回日本人類学会大会
    • 発表場所
      那覇
  • [学会発表] アジア人特異的EDAR 1540Cアリルは下顎第2大臼歯のhypoconulidと関連する

    • 著者名/発表者名
      川口亮他
    • 学会等名
      第65回日本人類学会大会
    • 発表場所
      那覇
  • [学会発表] 沖縄在住日本人の皮膚色変異とその遺伝的要素

    • 著者名/発表者名
      山口今日子他
    • 学会等名
      第65回日本人類学会大会
    • 発表場所
      那覇
  • [学会発表] ゲノムから探る人類の拡散と遺伝適応

    • 著者名/発表者名
      木村亮介
    • 学会等名
      日本人間行動進化学会第4回大会
    • 発表場所
      札幌
    • 招待講演
  • [学会発表] Peopling of Asia inferred from the genome diversity.

    • 著者名/発表者名
      Kimura, R.
    • 学会等名
      Symposium on the Emergence and Diversity of Modern Human Behavior in Palaeolithic Asia
    • 発表場所
      Tokyo

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公開日: 2014-07-24  

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