海洋環境中におけるＤＮＡ／ＲＮＡ両ウイルスの宿主争奪戦に関する研究

2013 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22688016
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 水産学一般
• 研究機関: 独立行政法人水産総合研究センター
• 研究代表者: 外丸 裕司 独立行政法人水産総合研究センター, 瀬戸内海区水産研究所, 主任研究員 (10416042)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2014-03-31
• キーワード: 珪藻 / ウイルス / 生態

研究概要

近年、海洋における藻類ウイルス研究が注目されている。本研究は、タイプが異なるウイルスの共通宿主に対する感染・優占化戦略を、珪藻とそれに感染する2種のウイルスを材料として解明することを目的とした。現場調査ならびに室内実験の結果、2種のウイルスは水温に対して異なる増殖特性を持つことが明らかとなった。このことから異種のウイルス同士は宿主を争奪するのではなく、異なる環境条件下で宿主をシェアしているものと推察された。

研究成果

• [雑誌論文] Utilization of phosphate diesters by phosphodiesterase-producing marine diatoms (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi H, Arisaka H, Otsuka N, Tomaru Y
  • 雑誌名: J Plankton Res 巻: 36 ページ: 281-285
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded RNA virus that infects the marine planktonic diatom Chaetoceros sp. (SS08-C03) (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Kimura K, Takao Y, Sakurada K, Nakayama N, Nagasaki K
  • 雑誌名: Phycol Res 巻: 61 ページ: 27-36
  • 査読あり
• [雑誌論文] A unique method for culturing diatoms on agar plates (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura K, Tomaru Y
  • 雑誌名: Plankton and Benthos Research 巻: 8 ページ: 46-48
  • 査読あり
• [雑誌論文] Co-occurrence of Heterocapsa circularisquama bloom and its lytic viruses in Lake Kamo, Japan, 2010 (2013)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto A, Kondo S, Nakao R, Tomaru Y, Nagasaki K
  • 雑誌名: JARQ 巻: 47 ページ: 329-338
  • 査読あり
• [雑誌論文] New single-stranded DNA virus with a unique genomic structure that infects marine diatom Chaetoceros setoensis (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Suzuki H, Nagumo T, Kimura K & Takao Y
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 3 ページ: 3337
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and Characterization of a Single-Stranded DNA Virus Infecting the Marine Diatom Chaetoceros sp. Strain SS628-11 Isolated from Western Japan (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura K, Tomaru Y
  • 雑誌名: Plos One 巻: 8 ページ: e82013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded DNA virus infecting the marine planktonic diatom Chaetoceros sp (2012)
  • 著者名/発表者名: Toyoda, K., Kimura, K., Hata, N., Nakayama, N., Nagasaki, K., Tomaru, Y
  • 雑誌名: Plankton Benthos Res 巻: 7 ページ: 20-18
  • 査読あり
• [雑誌論文] First evidence for the existence of pennate diatom viruses (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomaru, Y., Toyoda, K., Kimura, K., Hata, N., Yoshida, M., Nagasaki K
  • 雑誌名: ISME Journal
  • DOI: 10.1038/ismej.2011.207
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterisation of a single-stranded DNA virus infecting the marine planktonic diatom Chaetoceros tenuissimus Meunier (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Shirai Y, Toyoda K, Nagasaki K
  • 雑誌名: Aqatic Microbila Ecology 巻: 64 ページ: 175-185
  • 査読あり
• [雑誌論文] PCR-RFLP analysis for species-level distinction of the genus Chaetoceros Ehrenberg (Bacillariophyceae) (2011)
  • 著者名/発表者名: Toyoda K, Nagasaki K, Williams DM, Tomaru Y
  • 雑誌名: Hiyoshi Rev Natur Sci 巻: 50 ページ: 21-30
• [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded DNA virus infecting Chaetoceros lorenzianus Grunow (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Takao Y, Suzuki H, Nagumo T, Koike K, Nakgasaki K
  • 雑誌名: Applied and Environmental Microbiology 巻: 77 ページ: 5285-5293
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynamics of diatom viruses on the western coast of Japan (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Fujii N, Nagasaki K
  • 雑誌名: Aquatic Microbial Ecology 巻: 63 ページ: 223-230
  • 査読あり
• [雑誌論文] Application of real-time PCR assay for detection and quantification of Chaetoceros tenuissimus Meunier (Bacillariophyta) (2010)
  • 著者名/発表者名: Toyoda K, Nagasaki K, Tomaru Y
  • 雑誌名: Plankton Benthos Res 巻: 5 ページ: 56-61
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of a marine diatom-infecting singlestranded RNA virus (2010)
  • 著者名/発表者名: Naitow, H., Shirai, Y., Tomaru, Y., Nagasaki, K
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F : Structural Biology and Crystallization Communications 巻: 66 ページ: 1449-1452
  • 査読あり
• [雑誌論文] 原生生物の寄生, 共生者(ウイルスを中心に) (2010)
  • 著者名/発表者名: 長崎慶三, 外丸裕司
  • 雑誌名: 日本プランクトン学会報 巻: 58 ページ: 73-76
  • 査読あり
• [学会発表] 珪藻DNA/RNA ウイルスの増殖と水温の関係 (2013)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司, 木村圭
  • 学会等名: 第29回日本微生物生態学会大会
  • 発表場所: 鹿児島大学(鹿児島市)
  • 年月日: 2013-11-23
• [学会発表] 珪 藻Chaetoceros tenuissimus に感染するDNA/RNA ウイルスの増殖に与える水温の影響 (2013)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司, 木村圭
  • 学会等名: 2013年日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会
  • 発表場所: 東北大学農学部(仙台市)
  • 年月日: 2013-09-28
• [学会発表] Viral impacts on population dynamics of a bloom-forming diatom Chaetoceros tenuissimus (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Kimura K
  • 学会等名: 15th International Conference on Harmful Algae
  • 発表場所: Changwon Cyeongam, Korea
  • 年月日: 20121100
• [学会発表] Pennate diatom viruses are similar to centric diatom viruses (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Kimura K and Takao Y
  • 学会等名: 22nd International diatom symposium
  • 発表場所: Gent, Belugium
  • 年月日: 20120000
• [学会発表] Bacterial communities help survivals of diatom populations from viral attacks (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Kimura K
  • 学会等名: 22nd International diatom symposium
  • 発表場所: Gent, Belugium
  • 年月日: 20120000
• [学会発表] Dynamics of Chaetoceros tenuissimus and its viruses in Hiroshima Bay, Japan (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Kimura K
  • 学会等名: 22nd International diatom symposium
  • 発表場所: Gent, Belugium
  • 年月日: 20120000
• [学会発表] 珪藻ウイルス研究の最前線と今後の展望 (2012)
  • 著者名/発表者名: 外丸裕司
  • 学会等名: 2012年度日本プランクトン学会春季シンポジウム
  • 発表場所: 東京大学柏キャンパス(千葉県柏市)
  • 年月日: 2012-03-30
  • 招待講演
• [学会発表] Ecological relationships between diatom blooms and viruses (2010)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Toyoda K, Nagasaki K
  • 学会等名: 14th International Conference on Harmful Algae
  • 発表場所: ギリシャ(ポスター)
  • 年月日: 2010-11-01
• [図書] Diatom Virus. The Diatom World, Cellular Origin, Life in Extreme Habitats and Astrobiology (2011)
  • 著者名/発表者名: Tomaru Y, Nagasaki K
  • 総ページ数: 533
  • 出版者: Springer
• [備考] ホームページ等珪藻ウイルスの生態学的研究
  • URL: http://feis.fra.affrc.go.jp/keisou_Virus/index.html