2012 年度研究成果報告書

次世代DNAシークエンサーを用いたゲノム解読のためのアルゴリズム開発

研究課題

研究課題/領域番号	22700307
研究種目	若手研究(B)
配分区分	補助金
研究分野	生体生命情報学
研究機関	東京大学
研究代表者	笠原雅弘東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 講師 (60376605)
研究期間 (年度)	2010 – 2012
キーワード	ゲノム / アルゴリズム / ゲノムアセンブリ / 遺伝学的地図
研究概要	次世代DNAシークエンサーと呼ばれる高速・安価にDNA配列を読み取ることができる装置を用いてゲノム解読を行う場合には、解読・復元されたゲノム配列が断片化することが多く、各断片がどの染色体上のどの位置に存在するかは分からなかった。そこで、次世代DNAシークエンサーを用いて短期間に比較的少ない手間で遺伝学的地図を構築するアルゴリズムを開発し、染色体上に解読ゲノム断片配列を整列するシステムを開発した。

(2件)