2011 年度研究成果報告書

リガンド予測のための記述子自動獲得アルゴリズムの開発

研究課題

研究課題/領域番号	22700312
研究種目	若手研究(B)
配分区分	補助金
研究分野	生体生命情報学
研究機関	群馬大学
研究代表者	加藤毅群馬大学, 大学院・工学研究科, 准教授 (40401236)
研究期間 (年度)	2010 – 2011
キーワード	非線形合成記述子 / サポートベクトルマシン / 転移学習 / 重みつき経験分布 / リガンド予測 / 一般化固有値問題 / P450アイソザイム / 嗅覚受容体
研究概要	本研究は,指定された化合物がターゲットタンパク質のリガンドとなりうるかを予測するリガンド予測問題に関するものである.タンパク質と相互作用するリガンドを予測するには効果的な記述子が重要となる.大域的モデルでは,各々の局所問題に特化した記述子を扱うことができないが,局所的モデルでは少サンプル問題が起因して十分な汎化能力が得られないことが多々ある.本研究は,転移学習の考え方を導入して,この2つの問題を同時に解決する記述子自動獲得アルゴリズムを開発した.