2011 年度研究成果報告書

タンパク質相互作用パターン解析と予測法の開発

研究課題

研究課題/領域番号	22700314
研究種目	若手研究(B)
配分区分	補助金
研究分野	生体生命情報学
研究機関	北里大学
研究代表者	寺師玄記北里大学, 薬学部, 講師 (40383658)
研究期間 (年度)	2010 – 2011
キーワード	生体生命情報学 / バイオインフォマティクス / タンパク質間相互作用
研究概要	タンパク質間相互作用パターン解析と予測法の開発のため、タンパク質間相互作用部位データベースの作成、および三次元座標で表現された相互作用部位検索に使用する検索方法を新たに開発した。タンパク質の三次元構造を問い合わせにして、局所的な部分構造検索(3-D substructure search)の新たなアルゴリズムを開発し、既存の手法で最も探索速度の速い手法と比較して9～23倍高速な検索が可能となった。