海洋細菌がもつプロテオドプシンの光受容による地球規模炭素循環の支配

2011 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 22710004
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 環境動態解析
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 吉澤 晋 東京大学, 大気海洋研究所, 特任研究員 (00553108)
• 研究期間 (年度): 2010 – 2011
• キーワード: プロテオロドプシン / 光従属栄養 / Flavobacteria / 物質循環 / 海洋 / 微生物

研究概要

本研究では、2000年に海洋細菌から見つかった光駆動型プロトンポンプであるプロテオロドプシン(以下PR)の生物機能を、分離培養株を用いて詳細に解析し、PRのプロトン排出速度および利用波長領域を明らかにすることに成功した。従来、PR遺伝子を持つ細菌は難培養性であると考えられてきたが、本研究で多数の分離培養に成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Aureitalea marina gen. nov., sp. nov. (2012)
  • 著者名/発表者名: Sanghwa Park, Susumu Yoshizawa, Kentaro Inomata, Kazuhiro Kogure and Akira Yokota
  • 雑誌名: a member of the family Flavobacteriaceae, isolated from seawater. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 62 ページ: 912-916
  • DOI: doi:10.1099/ijs.0.031450-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Vibrio azureus emits blue-shifted light via an accessory blue fluorescent protein (2012)
  • 著者名/発表者名: Susumu Yoshizawa, Hajime Karatani, Minoru Wada, and Kazuhiro Kogure
  • 雑誌名: FEMS microbiology letters 巻: 329 ページ: 61-68
  • DOI: DOI:10.1111/j.1574-6968.2012.02507.x.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Diversity and functional analysis of proteorhodopsin in marine Flavobacteria (2012)
  • 著者名/発表者名: Susumu Yoshizawa, Akira Kawanabe, Hiroyasu Ito, Hideki Kandori, and Kazuhiro Kogure
  • 雑誌名: Environmental Microbiology 巻: 14 ページ: 1240-1248
  • DOI: DOI:10.1111/j.1462-2920.2012.02702.x.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Anomalous pH Effect of Blue Proteorhodopsin (2012)
  • 著者名/発表者名: Keisuke Yamada, Akira Kawanabe, Susumu Yoshizawa, Kentaro Inoue, Kazuhiro Kogure, and Hideki Kandori
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry Letters 巻: 3 ページ: 800-804
  • DOI: DOI:10.1021/jz3000257
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rubricoccus marinus gen. nov., sp. nov., of the family' Rhodothermaceae', isolated from seawater (2011)
  • 著者名/発表者名: Sanghwa Park, Susumu Yoshizawa, Kazuhiro Kogure and Akira Yokota
  • 雑誌名: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: 61 ページ: 2069-2072
  • DOI: doi:10.1099/ijs.0.026294-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Oceanicoccus sagamiensis gen. nov., sp. nov., a gamma-proteobacterium isolated from sea water of Sagami Bay in Japan (2011)
  • 著者名/発表者名: Sanghwa Park, Susumu Yoshizawa, Kazuhiro Kogure and Akira Yokota
  • 雑誌名: The Journal of Microbiology 巻: 49 ページ: 233-237
  • DOI: DOI:10.1007/s12275-011-0368-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] Vibrio sagamiensis sp. nov., luminous marine bacteria isolated from sea water (2010)
  • 著者名/発表者名: Susumu Yoshizawa, Minoru Wada, Akira Yokota, and Kazuhiro Kogure
  • 雑誌名: The Journal of General and Applied Microbiology 巻: 56 ページ: 499-507
  • URL: http://dx.doi.org/10.2323/jgam.56.499
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aliivibrio sifiae sp. nov., luminous marine bacteria isolated from seawater (2010)
  • 著者名/発表者名: usumu Yoshizawa, Hajime Karatani, Minoru Wada, Akira Yokota, and Kazuhiro Kogure
  • 雑誌名: The Journal of General and Applied Microbiology 巻: 56 ページ: 509-518
  • URL: http://dx.doi.org/10.2323/jgam.56.509
  • 査読あり
• [雑誌論文] Psychrosphaera saromensis gen. nov., sp. nov., within the family Pseudoalteromonadaceae, isolated from Lake Saroma, Japan (2010)
  • 著者名/発表者名: Sanghwa Park, Susumu Yoshizawa, Koji Hamasaki, Kazuhiro Kogure and Akira Yokota
  • 雑誌名: The Journal of General and Applied Microbiology 巻: 56 ページ: 475-480
  • URL: http://dx.doi.org/10.2323/jgam.56.475
  • 査読あり
• [雑誌論文] Halioglobus japonicus gen. nov., sp. nov., and Halioglobus pacificus sp. nov.
  • 著者名/発表者名: Sanghwa Park, Susumu Yoshizawa, Kentaro Inomata, Kazuhiro Kogure, and Akira Yokota
  • 雑誌名: within the class Gammaproteobacteria, isolated from seawater. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: (in press)
  • DOI: doi:10.1099/ijs.0.031443-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Vibrio jasicida sp. nov., a member of the Harveyi clade
  • 著者名/発表者名: Susumu Yoshizawa, Yasuhiro Tsuruya, Youhei Fukui, Tomoo Sawabe, Akira Yokota, Kazuhiro Kogure, Melissa Higgins, Jeremy Carson and Fabiano L. Thompson
  • 雑誌名: from marine animals(packhorse lobster, abalone, and Atlantic salmon). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 巻: (in press)
  • DOI: doi:10.1099/ijs.0.025916-0
  • 査読あり
• [学会発表] ロテオロドプシン、新たな光利用メカニズム (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉澤晋・木暮一啓
  • 学会等名: 2nd Forum of Network association of Microbiologist in Ehime(NAME)
  • 発表場所: 愛媛
  • 年月日: 2011-11-26
• [学会発表] Proteorhodopsin-mediated phototrophy in marine Flavobacteria (2011)
  • 著者名/発表者名: Susumu YOSHIZAWA
  • 学会等名: The 3rd AORI-KIOS Joint Symposium on Marine Science
  • 発表場所: Kashiwa, Japan
  • 年月日: 2011-10-10
• [学会発表] 海洋性フラボバクテリアのプロテオロドプシンによる光エネルギー利用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉澤晋,川鍋陽,伊藤洋康,神取秀樹,木暮一啓
  • 学会等名: 第27回日本微生物生態学会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-10-06
• [学会発表] 極海洋から分離されたPolaribacterの広宿主域遺伝子伝達粒子 (2011)
  • 著者名/発表者名: 千浦博,吉澤晋,木暮一啓
  • 学会等名: 第27回日本微生物生態学会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2011-10-06
• [学会発表] Can you answer this question in your own words?"Why are you interested in the matter?" (2011)
  • 著者名/発表者名: Susumu YOSHIZAWA
  • 学会等名: THE 3rd KOREA-JAPAN SYMPOSIUM ON MICROBIAL ECOLOGY
  • 発表場所: Gwangju, Korea
  • 年月日: 2011-05-13
• [学会発表] PROTEORHODOPSIN FUNCTIONS AS THE LIGHT-DRIVEN PROTON PUMP AMONG MARINE FLAVOBACTERIA (2010)
  • 著者名/発表者名: Susumu Yoshizawa, Akira Kawanabe, Hideki Kandori, and Kazuhiro Kogure
  • 学会等名: 第26回日本微生物生態学会
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2010-11-24
• [学会発表] Distribution and diversity of haloarchaea in marine environments (2010)
  • 著者名/発表者名: Kentaro Inoue, Keigo Watanabe, Susumu Yoshizawa and Kazuhiro Kogure
  • 学会等名: 第26回日本微生物生態学会
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2010-11-24
• [学会発表] Polaribacter属細菌の分類に関する研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 猪又健太郎・吉澤晋・木暮一啓
  • 学会等名: 第26回日本微生物生態学会
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2010-11-24
• [学会発表] VARIATION OF EMISSION SPECTRA OF MARINE LUMINOUS BACTERIA (2010)
  • 著者名/発表者名: Susumu Yoshizawa, Wada Minoru and Kazuhiro Kogure
  • 学会等名: 13th International Society for Microbial Ecology
  • 発表場所: Seattle, USA
  • 年月日: 2010-08-26
• [学会発表] PROTEORHODOPSIN IS FUNCTIONING AS THE LIGHT-DRIVEN PROTON PUMP AMONG MARINE FLAVOBACTERIA (2010)
  • 著者名/発表者名: Susumu Yoshizawa, Akira Kawanabe, Hideki Kandori, and Kazuhiro Kogure
  • 学会等名: 3th International Society for Microbial Ecology
  • 発表場所: Seattle, USA
  • 年月日: 2010-08-26
• [備考] プレスリリース(2012年2月16日)
  • URL: http://www.aori.u-tokyo.ac.jp/research/news/2012/20120216.html